Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 170,839 | T→G | 6.8% | intergenic (+20/‑550) | PP_0159 → / → PP_16SA | family III CoA‑transferase/16S ribosomal RNA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 170,839 | 0 | T | G | 6.8% | 510.6 / 11.2 | 196 | intergenic (+20/‑550) | PP_0159/PP_16SA | family III CoA‑transferase/16S ribosomal RNA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/88); new base G (12/5); total (102/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.33e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
TCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAGG > NC_002947/170691‑170986 | tCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTc < 1:761235/150‑1 (MQ=255) tCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTc < 2:4282118/150‑1 (MQ=255) cGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGACGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCa < 2:5469044/150‑1 (MQ=255) gagaCGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAgg > 2:7445010/1‑150 (MQ=255) agaCGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGc < 1:3325020/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTcc > 1:9130000/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTccc < 2:7727372/150‑1 (MQ=255) tGGTGTATGGCGGGGCGCCACCACTGGTGGGCGAGCATACCTAAGTGGTGGTGGGGGATGTGTTGGGGCTGGTTGGTGGGGAGGTACCGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATTAAAAGGGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCt < 1:8897870/150‑1 (MQ=255) gAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGACGGGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGGTGGTTGGTGGCGAGGTACAGCGTCGGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGTTGAAAAGCGGGGCGGCCGTCCGGCCTCCCCGCttt < 2:4671855/150‑1 (MQ=255) gAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGATGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCTGACGGCCTCCCCGCttt < 2:2352619/150‑1 (MQ=255) gTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGt > 1:2995556/1‑150 (MQ=255) tATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGTGGGGAGGCCTGACGGCCTCCCCGCttttca < 2:5968108/150‑4 (MQ=255) tATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCGGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGTTGCTGGCGAGGTAGCGCGGCGGCGTGCTGCGGGGGTGCGCTGGATGAAATGCGGGGAGGCCGGGAGGCCGCCCCGCGTTGtg > 2:6793167/1‑149 (MQ=255) tATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGACCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGAACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCACTAGATGAAAACCGGGGAGCCCGTCAGCCCTCCCCGCTTTgat < 2:3722639/150‑3 (MQ=255) aTCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGttt > 2:1682981/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAg < 2:8606106/150‑1 (MQ=255) ggCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAgcg > 2:6581807/1‑150 (MQ=255) caccacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCGTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATc > 1:2947133/1‑150 (MQ=255) caccacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATc > 1:5145827/1‑150 (MQ=255) accacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAATGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCa > 2:5326705/1‑150 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGGTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa > 2:5204031/1‑150 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCTGACGGCCTCCCCGCt < 1:77803/129‑1 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa < 2:1299786/150‑1 (MQ=255) cacTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCaaa < 2:7268661/150‑1 (MQ=255) acTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAg > 2:8249009/1‑150 (MQ=255) acTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGGTTTTCAGCGCTATCAAAg > 2:4783952/1‑150 (MQ=255) gctgGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTAAGCGCTATCAAAGGTa > 1:5161691/1‑150 (MQ=255) tgGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCTGACGGCCTCCCCg < 1:1509906/121‑1 (MQ=255) gggCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAAtt < 2:6884058/150‑1 (MQ=255) gCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACATCGTCGGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGa < 2:8283494/150‑1 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGGTTTGTTTTTCAGCGGTATCAAAGGTAATGGaaa > 1:2974449/1‑150 (MQ=255) gAGCATACCGAAGTGGTGCGGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGaaa < 1:8249009/150‑1 (MQ=255) aTACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCACCCCGCGTTGTTTTTAAGCGCTATCAAAGGTAATTTAAATTaa > 1:2299569/1‑150 (MQ=255) tACCGATGTGGTGCTGGGGGATGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTTATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaaa < 1:730162/150‑1 (MQ=255) tACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTaaa < 2:2070306/150‑1 (MQ=255) accgttgtggtgGGGGGTGATGTGTGGGGGGTGGTTGGGGGCGTGGTACCGCGTCTGGGTTTTGGTGGGGTGCTCTTGTTTAAAAGCGGGGTGGCCGTCTGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAg < 1:5587430/144‑1 (MQ=255) aCCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCGCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATAAAAGGTAATTGAAAATaaat > 1:6166594/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAgg < 2:5622894/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGt > 2:1043941/1‑150 (MQ=255) tggtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCACCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCGATCAAAGGTAAATGAAAATAAATGtttaag > 1:2588402/1‑146 (MQ=255) gtgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGcc > 2:2220800/1‑150 (MQ=255) tgCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGccc < 2:676026/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCct > 2:2107107/1‑150 (MQ=255) cTGGGGGAAGTGTTGGGGGTGGTGGGTGTCGAGGTAAAGGGTGTGGTTGTTGTGGGGTTTCTCTTTATTAAACGCGGGTAGCCCGTCCGGCATCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCctc < 1:525087/150‑1 (MQ=255) tGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTACATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCctct < 1:6847192/150‑1 (MQ=255) tGGGGGAAGTGTGGGGGCTGTATGCTGGCGTGGTACAGCGTCTGCTTGATGCTGGGGTGCTCTCGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCctct < 2:516250/150‑1 (MQ=39) ggggttcgtgtGGGGGCTGGATGCTGGCGTGGTACCGCGTCTGCGTGATGGTGGGGTGCTCTAGTTGAAAAGCGGGCCGGCCGTCTGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCtctc < 1:8046308/143‑1 (MQ=255) gggggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCtctc > 2:7987683/1‑150 (MQ=255) gggggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCACCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCtctc > 2:8857347/1‑150 (MQ=255) ggggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCCCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAATGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGcccacacg > 1:6463569/1‑145 (MQ=255) gggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCGCCCCGCGTTGTTTTTCAGCGCGATCAAAGGTAATTGAAATTAAATGTTGACGCCCACTCgc > 1:2462177/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGTGGCCGTCAGGCCACCCCGCGTTGTTTTTGAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAATGTTGACGCCCTCTCGaa > 1:6981688/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTccc < 2:6325178/91‑1 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTccc > 1:6325178/1‑91 (MQ=255) ggAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAATGTTGACGCCCTCTCGaa > 2:4231669/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATccc < 1:4408255/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCACCCCGCTTTTTTTTTCAGCGCTATAAAATGTAATTGAAATTAAAGTTTGAAGCCCACTCGAAAccc > 1:9149097/1‑150 (MQ=255) tgtTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGGCTCCCCGCTTTGTTTTTAAGCGCTATAAAAGGTAATTTAAATTAAAGGTTTAAGCCCTCTCGAATaccc > 2:1907791/1‑150 (MQ=255) tgtTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCATTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATcccc < 2:3880980/150‑1 (MQ=255) gtTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCt < 1:8212361/150‑1 (MQ=255) gggCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCCCGTTGTTTTTAAGCGCTATAAAATGTAAATTAAATTAAAGGTTGACCCCCACTCGAATACCCAtata > 1:3423297/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTAAGCGCTATAAAAGGTAATTTAAATTAAAGGTTTAAGCCCTCACGAATCCCCGTATAAt > 1:3558586/1‑150 (MQ=39) gCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGAAGCCCACTCGAAACCCCGTATAATGCGCCCCACta > 2:3848814/1‑149 (MQ=255) gcaccgggTCTGCGTGCTGCGGGGGGGCTCTAGATGAAAAGCGGGGCGGCCGGCCGGCCCCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGc < 1:4087205/143‑1 (MQ=25) gTACCGCGTGTGCGTGCGGCGGGGGTGCTCTAGATCAAACGCGGGGCGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGc < 1:4825811/150‑1 (MQ=37) gTACAGCGTGTGCGTGATGCTGGGGTGCTATAGATGAAAAGGGGGGAGGCCGTCCGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGc < 1:3451945/150‑1 (MQ=255) aCAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGa < 2:3364335/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGCGGCCGGCCGGCCGCCCCCCGTTGTTTTTCAGCGCGATAAAAGGTAATTGAAATTAAATGTTTACGCCCTCACCAATCCCCATATAAAGAGCCCCACAACCACCGAc > 1:219812/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGAc < 1:3641313/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGGGGCCGGCAGGCCGCCCCCCGTTTTTTTTGAGCGCGATAAAATGTAAATTAAATTAAAGGTTTAAGCCCACTCGAATACCCCTATAAAGCGCCCCCCATCCCACGACaa > 1:3798878/1‑149 (MQ=255) tCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCgg > 2:4265806/1‑150 (MQ=255) tGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCCCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTTAAATTAAATGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATTCGCCCCACATCCAGCGACAACGGaa > 2:1194341/1‑150 (MQ=38) tGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGGCAGGCCTCCCCGCGTTGTTTTTCCGCGCTATCCAAGGTCATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACATCCAGCGACAACGGaa > 2:2646120/1‑150 (MQ=25) gCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGCGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATACCCTTTTAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAAc > 1:5192173/1‑150 (MQ=255) gCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAAc < 2:4702579/150‑1 (MQ=255) cGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTTACGCCCTCTCGAATCCCCGTATAATGCTCCCCACATCCAGCGACATCGGAACg > 1:6816975/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGCTCTAGATCAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTc < 2:1013079/150‑1 (MQ=255) gggTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCACGCCACCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTAAAAAAGGTAATTGAAAATAAAGGTTGACGCCCTCACGAAACCCCAAAAAAAGCGCCCCACATACAGCGACATCGGAACCAAAAACAccg > 2:4112245/1‑149 (MQ=255) tGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTga < 2:1671689/150‑1 (MQ=255) tGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTga < 2:7082762/150‑1 (MQ=255) ctctAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTgaga < 2:1595552/150‑1 (MQ=255) tctAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTTACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACAACGGAACGAAAAAATCCTTGAGAt > 2:5756721/1‑150 (MQ=255) ctAGTTGAAACGCGGGGCGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGAtt < 1:3118788/150‑1 (MQ=255) tAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCACCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATAAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTTACGCCCTCGCGAATCCCCGTATAATGCGCCCCCCTTCCAGCGACCTCGGAACGAAAAACTCCGTGAGATTc > 2:2297383/1‑150 (MQ=255) gATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCaa < 1:2788719/150‑1 (MQ=255) aTGAAATGCGGGGAGGGCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTAAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGTCGCCCTCTGGAATGCCCTTATAATGCGCCCCAATTGCAGCGACATGGGAACGAAAAACTGCTTGTGATTCAAt > 2:941876/1‑150 (MQ=255) gAAACGGGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCATTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGa < 1:1100599/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGGGGCGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGa < 1:7445010/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGGGGCGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGa < 1:1100911/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGa < 2:4179308/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGa < 1:8976801/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGGGAGGCCGTCAGGCGTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGt < 2:2947133/150‑1 (MQ=255) gCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTaa > 1:8684478/1‑150 (MQ=255) ggggAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAagt > 1:6685312/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAagtagt > 1:4850760/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAagtagt > 1:4157743/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACTAAATACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGtt > 2:3038829/1‑150 (MQ=255) ccGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAg < 2:9130000/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAgg < 1:4265806/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAgg < 1:1196588/150‑1 (MQ=255) | TCGGAGACGCCAGTGGAGTATCGCCGGGCGCCACCACTGCTGGGCGAGCATACCGAAGTGGTGCTGGGGGAAGTGTTGGGGCTGGATGCTGGCGAGGTACAGCGTCTGCGTGATGCTGGGGTGCTCTAGATGAAAAGCGGGGAGGCCGTCAGGCCTCCCCGCTTTGTTTTTCAGCGCTATCAAAGGTAATTGAAATTAAAGGTTGACGCCCTCTCGAATCCCCTTATAATGCGCCCCACTTCCAGCGACATCGGAACGAAAAACTCCTTGAGATTCAATGAGTTAAGTAGTTAAGG > NC_002947/170691‑170986 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |