| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,065,166 | G→A | 20.0% | intergenic (+58/‑149) | PP_1838 → / → PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,065,166 | 0 | G | A | 20.0% | 414.2 / 94.9 | 200 | intergenic (+58/‑149) | PP_1838/PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (66/91); new base A (17/22); total (87/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
AAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAA > NC_002947/2065017‑2065315 | cTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTc < 1:8088521/150‑1 (MQ=255) cTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTc < 1:6576852/150‑1 (MQ=255) tCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCCTTGCACAGGGttag > 1:6068705/1‑148 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGa < 1:5121876/150‑1 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGa < 1:435982/150‑1 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGa < 2:1678630/150‑1 (MQ=255) gaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGGGTGCCCGCGCCCA‑CCGGCCTTGCACACGGTTGGGGcc > 1:1411034/1‑150 (MQ=255) agCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCtt < 1:4243702/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTtgtg < 2:2921341/150‑1 (MQ=255) ggAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGc < 2:3850886/150‑1 (MQ=255) gAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCa < 2:1275155/150‑1 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAg < 2:2455036/150‑1 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAg < 1:7638584/150‑1 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAg < 2:1029826/150‑1 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAg < 2:4173987/150‑1 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAg < 2:4473240/150‑1 (MQ=255) aGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCaat < 2:1364713/150‑3 (MQ=255) aGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCaat < 1:187141/150‑3 (MQ=37) cGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCaatgc < 2:5345160/150‑5 (MQ=25) gTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTcc < 1:4805547/150‑1 (MQ=255) gTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTcc < 1:6612391/150‑1 (MQ=255) gTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAAGGTCCGAACCCtgtg < 2:3921755/143‑1 (MQ=255) tataTCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCt < 1:1693724/150‑1 (MQ=255) tataTCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCt < 1:1912624/150‑1 (MQ=255) tagatCCAGCCCGCGACCACGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGGGCACGGCACACCGAAGGAACCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CCGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCt < 2:8204741/147‑1 (MQ=255) tatCCAGCCCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCtgt < 1:764942/150‑1 (MQ=255) tatCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCtgt < 1:9059084/150‑1 (MQ=255) tatCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGAGCACGGCACACCGACGGAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCtgt < 1:2634090/150‑1 (MQ=255) atCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCtgtg < 2:2257616/150‑1 (MQ=21) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCtgtgg < 2:6158745/150‑2 (MQ=21) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCtgtgg < 2:5915497/150‑2 (MQ=21) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCCTTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGc > 2:6988968/1‑150 (MQ=255) cAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGTACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGa < 2:3983616/150‑1 (MQ=255) aGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAg > 2:6200051/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCgg < 2:7901000/150‑1 (MQ=18) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCgg < 1:1109207/150‑1 (MQ=18) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCgg < 2:8633549/150‑1 (MQ=18) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 2:2587706/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 2:1316435/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 2:3351463/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 1:6200051/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 1:4045014/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 2:6412660/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 1:1255013/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCAGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 2:5121566/150‑1 (MQ=255) gcgACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGc < 2:7576084/150‑1 (MQ=255) gACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCaa < 1:8050365/150‑1 (MQ=255) gACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCaa < 1:3162889/150‑1 (MQ=255) ccAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGGTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCCTTGGACAGGGGTCGGACCTTGTGCAGGTACTGGGGGGGCGGGCAAGc > 1:6777960/1‑150 (MQ=255) aaGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCTTTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGGGAGCGGGCAAGccc < 1:1399911/150‑1 (MQ=255) gagCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTGGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCcgc < 2:5680396/150‑1 (MQ=255) ctgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCAATCGCGGGCGGGCCCCCGCCCC‑CACGCCATGCCCACGGGTCGGGCCGTTTTGAGGTGCAGTGCGCGCCGGCCAcccccccgca > 1:2809286/1‑144 (MQ=255) aTAACCCCGCCGGCGGGGTGCCCGGCACACCGACGTAAACGGGGGCCGCGTTGCGGCCCTTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCA‑CCGGCTTTGCACAGGGTTCGGACCTTGGGCTGGTCCTGTGCGAGGGGGCAAGCCCGCGAATGGGcccc < 2:2390573/150‑1 (MQ=37) acCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCAATCGCGGGCGTGCCCGCACCCA‑CACGCCTTGCCCCGGGTGCGGGCCATTTGCCGGGCCGGGGCGGGCGGGCCAGCCCCCGCAAGGGCCCCCcaca > 1:8276059/1‑150 (MQ=255) cgGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCAATAGCGGGCGTGCCCCCGCCCACCCGCCATTGAACA‑GGTTAGGGCCGTGTGCCCGGGCAGTGCGGGCGGGCCACCCCCCCCAAGGGCCCCCCCCaaaatt > 2:3811716/1‑146 (MQ=255) ggCGTGGTGCACGGCACACCGAATTAACCGGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CCGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTc < 2:1836688/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTccc < 2:7516530/150‑1 (MQ=255) tgCCCGGCACACCTACGTAAACCGGGGCCGCGTGGGGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CCGGCATGGCACAGGTTTCGGACCTTGGGCCGGTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACt < 2:455846/150‑1 (MQ=37) aCGGCACACCGAGGTACCCGGGGGCCGCGTTGGGGCCCATTCGGGGGCTGGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCCCCGGGTGGGGACCTTGTGCCGGTCGTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGaa < 2:3143089/150‑1 (MQ=37) ggCACACCCTCGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCC‑CTGGCTTTGCACAGGTTTCGGACGTTGTGCCGGTCCTGGGCGAGCGGCCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACa < 1:8224438/150‑1 (MQ=38) gCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCAGTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCA‑CCGGCAGTGCACAGGGGTCGGACCGTGTGCAGGGCCGGGGCGCGCCGGCCAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGCCAGGACAt > 2:682915/1‑150 (MQ=255) acCGAAGTAAACCGGGGCCGGGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCTTTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCTGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATc < 1:2994458/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTAGCGGGCTTGCCCCCTCCCA‑CAGGCAATTGACCGGGTTGGGACCTTGTGGAGGTGCTGTGCGGGCGGGCAACCCCCCGAAAGGGCCCCGCACAAATTTACCGGGCTGTAAAATATAcccccccc > 2:6197812/1‑150 (MQ=255) ggggCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGCCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGt < 2:4845221/150‑1 (MQ=255) cGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCCCGCCCA‑CAGGCCATGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGCGCGGGCAACCCCCCGAATGGGCCCCCCACAAAATTACCGGCAGGAACAATAACCCCCCCCCAAAGTCAGTTATTCAgg > 2:8079030/1‑150 (MQ=255) cctttCGGGGGCTTGCCCGCCCCCA‑CCGGCATTGCACCGGGTTCGGACCTTGTGCTGGTCCTGCGCGAGCGGGCACGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATc < 1:6571277/147‑1 (MQ=255) cATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATca < 2:6041152/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCTTGCCCGCTCCCT‑CAGGCATTGCACTGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGTGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATcact < 2:7876116/150‑2 (MQ=255) ggtttGCCCGCTCCCC‑CTGTCTTTGCACTGGTTTCGGACGTTTTGCTGGTCGTGTGCGCGGGGGCACGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTg < 1:566459/147‑1 (MQ=255) gCCCGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGtt > 1:3664921/1‑150 (MQ=18) cccGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc > 1:3598912/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc < 2:537968/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGGGCGAGGGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc < 2:4878591/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:4277709/1‑150 (MQ=18) ccGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 2:7966156/1‑150 (MQ=18) ccGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 2:871758/1‑150 (MQ=18) ccGCTCGCA‑CAGGACCTGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 2:3604671/1‑150 (MQ=18) ccGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 2:8866131/1‑150 (MQ=255) gCTCCCA‑CAGGCATTGCACCGGGTTCGGACCTTGTGCCGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGtt < 1:1473879/150‑1 (MQ=255) gCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGtt > 1:1319713/1‑150 (MQ=255) ccccA‑CCGGCCTGGCACTGGGTTCGGACCTTGGGCTGGTCCTGGGCGAGCGGGCACGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGa < 1:2794609/149‑1 (MQ=255) ccA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTTCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACt > 2:1371417/1‑150 (MQ=255) ccA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACt > 1:3412166/1‑150 (MQ=255) ccA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACt > 1:7324629/1‑150 (MQ=255) a‑caGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTga > 2:7255014/1‑150 (MQ=255) a‑caGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTga > 1:1767061/1‑150 (MQ=255) a‑caGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATAACACACCTGGTGTTCGTTGACTga > 2:704874/1‑150 (MQ=255) gCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAgg > 2:1888480/1‑150 (MQ=255) aTTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGt > 1:7028509/1‑150 (MQ=255) tGCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCGCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTcc > 2:6622273/1‑150 (MQ=25) gCACTGGTTTCGGCCCTTGGGCTGCTCGTGTGCGCCGGGGCAACCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCg < 1:3811691/150‑1 (MQ=255) gCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCg > 1:8380173/1‑150 (MQ=25) gCACAAGGTCCGAACCCTGTGCAATGCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCg > 2:5543365/1‑150 (MQ=37) cacaGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGTCTGAGAGGGTCCGt > 2:4695180/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGtt > 2:686378/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGtt > 2:4313842/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGta > 2:2244057/1‑149 (MQ=255) aGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCa > 2:5310870/1‑150 (MQ=255) aGGGTTCGGACATTGTGAAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCACGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCa > 1:2469678/1‑150 (MQ=255) aGGGTCCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCa > 1:6377723/1‑150 (MQ=255) | AAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCA‑CAGGCATTGCACAGGGTTCGGACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCAA > NC_002947/2065017‑2065315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |