Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,173,757 | T→A | 5.1% | intergenic (+327/+76) | PP_5484 → / ← PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,173,757 | 0 | T | A | 5.1% | 912.3 / 25.9 | 275 | intergenic (+327/+76) | PP_5484/PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (123/137); new base A (7/7); total (130/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.67e-01 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGAAATCA > NC_002947/2173608‑2173905 | aCCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCa < 1:2610841/150‑1 (MQ=255) ccATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGTCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAg > 2:3231365/1‑150 (MQ=255) caccAGCTGTCGACAGCTGATGGTACCGGTTGACCGTGACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGc > 2:8994035/4‑150 (MQ=255) caccAGCTGTCGACAGCTGATGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGc > 1:931065/4‑150 (MQ=255) caccAGCTGTCGACAGCTGATGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGc > 1:8027215/4‑150 (MQ=255) tCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCg > 2:1614219/1‑150 (MQ=255) gCTGTCGAGTGCTGGTTGTACCGGTTGACAGTAACCGGTCAGGCGTTTGCTGTAAGTGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCTCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTc < 1:7019263/150‑1 (MQ=255) tGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCAc < 1:5509550/150‑1 (MQ=255) tGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCAc > 2:7051224/1‑150 (MQ=255) tGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCAc > 2:309239/1‑150 (MQ=255) tGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTATGGGTCGAATGCGGCCTGTcgt < 1:5489129/150‑3 (MQ=255) tCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGa > 1:3063122/1‑150 (MQ=255) tCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGa < 1:3457569/150‑1 (MQ=255) tggtggTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGc > 1:721646/1‑150 (MQ=255) tggtggTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGc < 2:1037768/150‑1 (MQ=255) aCCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACAGGCAGCTATGGGTCGAATGCGGCCTGTCGTGACCGGCTGCAATCGAc < 2:6836203/150‑1 (MQ=37) ccGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGAcc > 1:4960892/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGAcc > 1:1183006/1‑150 (MQ=255) aCCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCAGTCGACCCATAGcg > 2:6020856/1‑149 (MQ=255) gTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGcc > 2:2187076/1‑150 (MQ=255) tAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCt < 1:947291/150‑1 (MQ=255) tAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCt > 1:2186311/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCTCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTcg < 1:990216/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCgg > 2:1952558/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGaa > 1:4718752/1‑150 (MQ=255) gCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGa > 2:7635498/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGTCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACa > 2:641949/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACa < 2:7167037/150‑1 (MQ=255) tttGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAg > 1:5115162/1‑150 (MQ=255) gttAAGGGTCGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGTGTCGATTGCAGCCGGTCACGACTGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCaat < 1:4836071/148‑2 (MQ=255) ggTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCaaa < 1:5178087/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCaaa < 1:1859988/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGTCTTCCGCGAAAGGCAgctatgg < 1:8316037/150‑7 (MQ=255) gTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAAc > 1:2913706/1‑150 (MQ=255) gggACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCAc > 2:2538990/1‑150 (MQ=255) ggACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACt > 2:5236449/1‑150 (MQ=255) gcttgttccccAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTgg < 2:2558118/143‑1 (MQ=255) ccccAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCctc > 1:3353237/1‑150 (MQ=255) cccAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCctct > 1:2362461/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAAc < 1:7500181/150‑1 (MQ=255) cGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAgg > 2:2959214/1‑150 (MQ=255) cTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCAc < 2:4915806/150‑1 (MQ=255) tGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACt < 1:9052452/150‑1 (MQ=255) tAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGa < 1:6517742/150‑1 (MQ=255) aGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGAt > 1:1454892/1‑150 (MQ=255) gcgcATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGAtt > 2:2282513/1‑150 (MQ=255) gcATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGTAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTg < 2:1412478/150‑1 (MQ=255) gcATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTg < 2:4254453/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGTCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTgg < 1:641949/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTgg < 1:7610912/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTgg < 2:4837697/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTgg < 2:583186/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTgg < 2:1769220/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTgg < 2:824015/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGa > 1:3978498/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATa < 1:2108345/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCCCGGGCAGCTTTGGTTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACTGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAg < 1:8714147/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAg < 1:8690378/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATGTGGGATAg > 2:5073188/1‑150 (MQ=255) aGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATAGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGCCTAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAg < 1:5304838/150‑1 (MQ=255) ggTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGa < 1:7210472/150‑1 (MQ=255) tggtggTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGc < 2:7353349/150‑1 (MQ=255) tggtggTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGc > 2:5898973/1‑150 (MQ=255) gtggtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGAGTTGGGATAGGAAGCCt > 2:5670840/1‑150 (MQ=255) ggtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTaa > 1:4293628/1‑150 (MQ=255) gtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAt < 1:6793796/150‑1 (MQ=255) gtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAt > 2:4630944/1‑150 (MQ=255) gtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAt > 1:2054130/1‑150 (MQ=255) gtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAt > 1:4162078/1‑150 (MQ=255) gtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAt < 2:8535238/150‑1 (MQ=255) gtTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTAACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAt > 1:32059/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACCGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGa < 2:5396358/150‑1 (MQ=255) gccgccCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAg < 1:4084351/150‑1 (MQ=255) gccCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGa > 2:432969/1‑130 (MQ=255) gccCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGa < 1:432969/130‑1 (MQ=255) cccccATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTATCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCgg > 1:2717358/1‑150 (MQ=255) ccccATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCggg < 1:600195/150‑1 (MQ=255) ccccATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCggg > 2:6282351/1‑150 (MQ=255) ccccATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCggg < 2:6605137/150‑1 (MQ=255) ccccATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCggg < 2:1306705/150‑1 (MQ=255) ccccATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACACATAGCTGCCATTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCggg < 2:7214553/150‑1 (MQ=255) cATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCgggggg < 1:3634113/150‑3 (MQ=255) aTCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGa < 2:8140278/150‑1 (MQ=255) aTCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGa > 1:3769594/1‑150 (MQ=255) cACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAg < 1:3869139/150‑1 (MQ=255) gggCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGcc > 1:1014544/1‑150 (MQ=255) cAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTCACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTc < 2:7896218/150‑1 (MQ=255) cAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTc < 2:2681797/150‑1 (MQ=255) cAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTc < 1:8911553/150‑1 (MQ=255) cTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTc > 2:2813035/1‑150 (MQ=255) tatGGGTCGAATGCGGCCTGTCGTGACCGGCTGCAATCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGAttt < 1:5572799/104‑1 (MQ=18) gTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGaa > 2:1650010/1‑150 (MQ=255) gTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGaa < 2:4031689/150‑1 (MQ=255) tCGAATGCGGCCTGTCGTGACCGGCTGCAATCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGaaa > 2:2029282/1‑150 (MQ=38) tCGAATGCGGCCTGTCGTGACCGGCTGCAATCGACCCAAAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGaaa > 2:348108/1‑150 (MQ=37) tCGAATGCGGCCTGTCGTGACCGGCTGCAATCGACCCAAAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGaaa > 1:1716278/1‑150 (MQ=37) cGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGAAAt < 2:577051/150‑1 (MQ=255) gATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGAAATc > 1:6132820/1‑150 (MQ=255) gATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGAAATc > 2:846183/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAAGGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGAAATCa < 1:4991545/150‑1 (MQ=255) | GGCTACCATCAGCTGTCGACAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGGCCGCATTCGACCCATAGCTGCCTTTCGCGGAAGACAGTCAAACTCACTGGGACCCTCTAACGAGGCACTGGGATTTGGGATAGGAAGCCTAATGGAGCCTCGGGGTGAAGGCCTTCGTCACCGAAATCA > NC_002947/2173608‑2173905 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |