| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,238,330 | G→T | 6.6% | L492L (CTG→CTT) | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,238,330 | 0 | G | T | 6.6% | 1045.9 / 42.7 | 312 | L492L (CTG→CTT) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (130/161); new base T (14/7); total (144/168) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
GCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACG > NC_002947/2238181‑2238479 | gCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTg < 2:5080170/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTgg < 2:2325893/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCGAGTTCTGGCGACCACTTTGACCATTCGCATGGCCGTGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGTCCTCTACGTGCGGGTACGCTACCTGCTCTCGGACTTCGACTCGGTGGAGCGGGTGGAGATTTTGCGCGACCTGCGGCTGTGc < 2:3001296/150‑1 (MQ=255) gagcgagTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCAcc < 1:7082181/150‑1 (MQ=255) gagcgagTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCAcc > 2:4352310/1‑150 (MQ=255) cgagTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTc < 1:2444715/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGACCACGTTGACCTAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTAAGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGAc < 2:1460110/150‑1 (MQ=255) gACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggt < 1:7187387/150‑1 (MQ=255) aCCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggtg < 2:7778110/150‑1 (MQ=255) aCCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggtg < 1:2936937/150‑1 (MQ=255) ccACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggtgg > 2:5985350/1‑150 (MQ=255) ccACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggtgg < 1:656421/150‑1 (MQ=255) ccACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggtgg > 2:340487/1‑150 (MQ=255) cACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTggg < 1:3868286/150‑1 (MQ=255) ttGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATc > 1:7711581/1‑150 (MQ=255) ctGACCAAGCGCATGGCAGAAGACCTGACCGAATATCTGCATGAACAAGGTGTTCGAGTACGTTACATGCACTCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATc < 2:3660236/149‑1 (MQ=255) tGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCa < 1:2427796/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCATGGCAGAAGACCTGACCGAATATCTGCATGAACAAGGTGTTCGCGTACGTTACATGCACTCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACct < 2:7144818/150‑1 (MQ=255) cAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACct > 1:3656221/1‑150 (MQ=255) aaaCGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACctg > 2:5875848/1‑150 (MQ=255) aCGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACctgct < 2:2003716/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGa < 1:8813120/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAg > 1:1528510/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAg > 2:2916240/1‑150 (MQ=255) gACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTg < 2:4988538/150‑1 (MQ=255) gACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTg > 2:6649597/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCAcc > 1:632018/1‑104 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCAcc < 2:632018/104‑1 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGGCa > 1:6472976/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACa > 2:9020955/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACa > 1:478478/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACa > 1:4695996/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACa > 1:222637/1‑150 (MQ=255) ttACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGa < 2:5703713/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 1:5143223/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:1537132/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 1:4081651/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:1710515/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:4687978/150‑1 (MQ=255) tGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGgtgt < 1:1403952/150‑1 (MQ=255) cGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ct > 2:7232592/1‑150 (MQ=255) gACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctg > 1:6883465/1‑150 (MQ=255) acgacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtgg > 1:3712977/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:4333011/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:5254395/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 2:4141121/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:4671561/1‑150 (MQ=255) ggTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGa < 1:5397703/150‑1 (MQ=255) cGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCg > 1:8404335/1‑150 (MQ=255) gCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCgg > 1:8048930/1‑150 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa < 1:1819131/150‑1 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa > 1:2722603/1‑150 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTTGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaa < 2:4030952/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaa < 2:4238328/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaa < 2:1855224/150‑1 (MQ=255) cTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaag > 2:2392194/1‑150 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCGCCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg > 1:3958774/1‑150 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg < 1:1059971/150‑1 (MQ=255) cACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaa < 1:7456186/150‑1 (MQ=255) cACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaa > 2:8634230/1‑150 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaagg < 2:7450414/150‑1 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaagg < 2:26785/150‑1 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt > 1:5635091/1‑150 (MQ=255) tCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTAGCCATTCTGGATGCCGACaaggaaggc > 1:3456654/1‑149 (MQ=255) 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ggTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGa < 2:6449080/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGa < 1:338856/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTc > 2:6526168/1‑150 (MQ=255) cGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTcc < 1:5790539/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTcc < 1:8147103/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTcc < 1:1137523/150‑1 (MQ=255) gggTGGAGAGTATCCGCGACCGGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCGGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACACGGACGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTccc < 2:3531409/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCt < 1:4405858/150‑1 (MQ=255) tGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGa > 1:4915941/1‑150 (MQ=255) ggAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGAt < 1:2619682/150‑1 (MQ=255) agaTTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATcc < 2:3932681/150‑1 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa < 1:8624327/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAt > 2:2128919/1‑150 (MQ=255) cgcgATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAtc > 1:6684621/1‑149 (MQ=255) cgcgATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAtc < 1:8231512/150‑2 (MQ=255) cgcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt < 1:7367412/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg < 1:6055963/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg < 2:5079035/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgc > 2:1627920/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCGGTcgtg > 1:2583932/1‑148 (MQ=255) tGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCt > 2:123957/1‑112 (MQ=255) tGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCt < 1:123957/112‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgcg > 2:8574382/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgcg > 2:2292323/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCGGTcgtgc > 1:5210332/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgcgc < 1:7803835/150‑1 (MQ=255) | GCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACG > NC_002947/2238181‑2238479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |