| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,238,397 | C→T | 5.3% | L515L (CTG→TTG) ‡ | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,238,397 | 0 | C | T | 5.3% | 1027.8 / 28.6 | 320 | L515L (CTG→TTG) ‡ | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (160/143); new base T (13/4); total (173/147) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.86e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
CCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATCGAC > NC_002947/2238248‑2238546 | ccACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggt < 2:228617/150‑1 (MQ=255) cACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtg > 2:8741775/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 2:1972663/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:4671561/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:4333228/1‑150 (MQ=255) gCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCt < 1:820819/150‑1 (MQ=255) ggTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGa < 1:5397703/150‑1 (MQ=255) cGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCg > 1:8404335/1‑150 (MQ=255) gCTACCTGCACTAGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCAGCGCCTGGGCACCTTCCACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCAGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCAACCTCGATGCgg > 2:2853179/1‑150 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa < 1:1819131/150‑1 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa < 2:6047520/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaa < 2:4238328/150‑1 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCGCCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg > 1:3958774/1‑150 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg < 1:1059971/150‑1 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGAGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg > 2:4139458/1‑150 (MQ=255) aCTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaag < 1:725429/150‑1 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaagg > 2:332211/1‑150 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaagg < 2:26785/150‑1 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt > 1:3702454/1‑150 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt > 1:8426505/1‑150 (MQ=255) tCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACaaggaaggc > 1:4251976/1‑149 (MQ=255) tCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTAGCCATTCTGGATGCCGACaaggaaggc > 1:3456654/1‑149 (MQ=255) cGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTTGGCACCTTCGTCGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGtt < 1:7072131/150‑1 (MQ=255) gACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGtttt < 2:4778933/150‑1 (MQ=255) gACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGtttt > 2:6319502/1‑150 (MQ=255) gACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGtttt < 1:8300271/150‑1 (MQ=255) aTCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTg > 2:5829966/1‑150 (MQ=255) aTCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTg > 2:7753439/1‑150 (MQ=255) acacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGtt > 2:8386810/1‑150 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCGCCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc < 2:3958774/150‑1 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc > 2:7587640/1‑150 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc < 1:2431261/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCGGGTGGAGTTTATCCGCGAGCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGa < 2:1560692/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATTCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGa < 2:8599345/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGa < 1:1203594/150‑1 (MQ=255) gTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAg < 1:5037145/150‑1 (MQ=255) aGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCt < 2:7963291/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTc > 2:6526168/1‑150 (MQ=255) cGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTcc < 2:509488/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCt < 1:4405858/150‑1 (MQ=255) gagaTTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATc > 1:7458405/1‑150 (MQ=255) agaTTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATcc < 2:3932572/150‑1 (MQ=255) aTTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAg > 1:2370704/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa > 2:2297900/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa < 1:8624327/150‑1 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa > 1:8102889/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa > 1:3751485/1‑150 (MQ=255) tCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCa < 2:3702454/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAt > 2:2128919/1‑150 (MQ=255) cgcgATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAtc > 2:7210589/1‑149 (MQ=255) cgcgATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAtc > 1:6684621/1‑149 (MQ=255) cgcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt < 1:7367412/150‑1 (MQ=255) cgcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt < 1:1676321/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg < 1:6055970/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg < 2:5079035/150‑1 (MQ=255) atcTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCggtc < 1:2612732/148‑3 (MQ=255) cTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgc > 2:1239635/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCGGTcgtg > 1:2583932/1‑148 (MQ=255) gcgcCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCGGTcgtgc > 1:5210332/1‑150 (MQ=255) cTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCa < 1:8741775/150‑1 (MQ=255) ggCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGt > 1:3376596/1‑150 (MQ=255) gCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTa > 2:4887908/1‑150 (MQ=255) gCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTa > 1:2180892/1‑150 (MQ=255) gCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTa > 1:6855939/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAAc > 1:1714222/1‑150 (MQ=255) tttCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCGGTCGTGCGGCGCGTAAcgt > 1:5922693/2‑148 (MQ=255) cTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCt > 2:69637/1‑150 (MQ=255) ttCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTc > 1:3320075/1‑150 (MQ=255) ttCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTc > 2:1718838/1‑150 (MQ=255) aCGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATg > 1:4091039/1‑150 (MQ=255) tGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGcc < 2:5382651/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGcc > 2:1502933/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCgg < 2:6883465/150‑1 (MQ=255) tggtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCggg < 1:5680381/150‑1 (MQ=255) tggtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCggg < 1:3894012/150‑1 (MQ=255) tggtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAGTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCggg > 1:7919960/1‑150 (MQ=255) tggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCa > 1:700160/1‑150 (MQ=255) gggCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCCTTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCAt > 2:3513592/1‑150 (MQ=255) gggCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCAt > 2:7446366/1‑150 (MQ=255) ggCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCAtt < 2:3158023/150‑1 (MQ=255) gCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTc < 2:1840038/150‑1 (MQ=255) aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGTGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg < 2:5591265/150‑1 (MQ=255) aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg > 2:4587785/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg > 1:7664902/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTAc < 1:5985350/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGc > 1:1079527/1‑150 (MQ=255) gAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTa > 2:444358/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACa < 1:5585997/150‑1 (MQ=255) gCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATaa > 1:926803/1‑142 (MQ=255) cTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTATGCCGATAACGTAACAGGc > 1:5782075/1‑150 (MQ=255) ggACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTc < 1:2990086/150‑1 (MQ=255) ggACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTc > 2:454789/1‑150 (MQ=255) gACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTcc > 1:2775057/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGc < 2:1656034/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGc > 2:7923242/1‑150 (MQ=255) gAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGa < 1:1287320/150‑1 (MQ=255) gtgtCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTTGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGcc > 2:6501109/1‑150 (MQ=255) gtgtCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGcc > 1:6414447/1‑150 (MQ=255) tCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATc > 2:804968/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATcgac < 2:5635091/150‑1 (MQ=255) | CCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATCGAC > NC_002947/2238248‑2238546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |