| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,238,399 | G→C | 5.5% | L515L (CTG→CTC) ‡ | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,238,399 | 0 | G | C | 5.5% | 1047.0 / 35.3 | 308 | L515L (CTG→CTC) ‡ | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (151/140); new base C (13/4); total (164/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.74e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATCGACG > NC_002947/2238250‑2238547 | ccACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggt < 2:228617/150‑1 (MQ=255) cACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtg > 2:8741775/1‑150 (MQ=255) cACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtg < 1:4578168/150‑1 (MQ=255) acgacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtgg > 1:3712977/1‑150 (MQ=255) gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGcc > 1:693053/1‑150 (MQ=255) gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGcc < 2:7208796/150‑1 (MQ=255) gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGcc > 1:9058071/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:4333106/1‑150 (MQ=255) cGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTc < 1:5290529/150‑1 (MQ=255) gCTACCTGCACTAGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCAGCGCCTGGGCACCTTCCACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCAGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCAACCTCGATGCgg > 2:2853179/1‑150 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa < 1:1819131/150‑1 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa < 2:6047520/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaa < 2:1855224/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaa < 2:4238328/150‑1 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCGCCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg > 1:3958411/1‑150 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg < 1:1059971/150‑1 (MQ=255) tGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGAGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaagg > 2:4139458/1‑150 (MQ=255) cACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaa < 1:7456186/150‑1 (MQ=255) aCTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaag < 1:8097919/150‑1 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaagg > 2:332211/1‑150 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaaggaagg < 2:26785/150‑1 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt > 1:5151945/1‑150 (MQ=255) tCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACaaggaaggc > 1:3456599/1‑149 (MQ=255) 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aTCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTg > 2:7753439/1‑150 (MQ=255) acacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGtt > 2:8386810/1‑150 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCGCCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc < 2:3958774/150‑1 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc < 1:2431261/150‑1 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc > 2:7587640/1‑150 (MQ=255) 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aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGTGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg < 2:5591265/150‑1 (MQ=255) aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg > 2:4587785/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGc > 1:1079527/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCg > 1:6779016/1‑150 (MQ=255) gAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTa > 2:444358/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACa < 1:6649597/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACa < 1:4392428/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACa < 1:5642328/150‑1 (MQ=255) ggACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTc > 2:454789/1‑150 (MQ=255) ggACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTc < 1:2990086/150‑1 (MQ=255) 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cTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATcgac < 2:5635091/150‑1 (MQ=255) tggtggCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAGTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATcgacg > 1:3370338/1‑150 (MQ=255) | GACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGCAGCGAGCCATCGACG > NC_002947/2238250‑2238547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |