| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 2,423,533 | G→A | 5.0% | G127R (GGG→AGG) | moaB‑I → | molybdenum cofactor biosynthesis protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,423,533 | 0 | G | A | 5.0% | 792.8 / 20.4 | 261 | G127R (GGG→AGG) | moaB‑I | molybdenum cofactor biosynthesis protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (119/127); new base A (4/9); total (125/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCTGTGA > NC_002947/2423385‑2423681 | cggcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCgg > 1:6779663/1‑150 (MQ=255)cggcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCgg > 1:8682510/1‑150 (MQ=255) ggcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCggg < 2:6677827/150‑1 (MQ=255) 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ttGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGcc > 2:4671386/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCt < 2:2114131/150‑1 (MQ=255) | CGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCTGTGA > NC_002947/2423385‑2423681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |