| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,804,956 | A→C | 5.9% | K459Q (AAG→CAG) ‡ | rbsA‑I → | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,804,956 | 0 | A | C | 5.9% | 876.9 / 31.1 | 263 | K459Q (AAG→CAG) ‡ | rbsA‑I | ribose ABC transporter ‑ ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (120/127); new base C (7/9); total (127/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
TGTCTGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTAT > NC_002947/2804807‑2805105 | tGTCTGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCcaaggca > 2:2562818/1‑150 (MQ=255) tttctgatAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACAGTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCcaaggcaagg > 2:6806868/8‑150 (MQ=255) tGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCaaggcaaggc > 1:6904565/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCaaggcaaggc > 2:4884935/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGAAGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCaaggcaaggc > 1:3434536/1‑150 (MQ=255) ggCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGcc > 1:1068808/1‑150 (MQ=255) gCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCt > 1:4892459/1‑150 (MQ=255) ggTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtg < 2:8754423/150‑1 (MQ=255) ggTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtg < 1:7504553/150‑1 (MQ=255) ggTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtg > 2:7613909/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtg < 2:4643830/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGAGTGCCAGGAGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTCGGCGCCAAGTTCCACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtg < 2:8140499/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCCTTGCCTtggcgc < 1:5702825/150‑4 (MQ=255) aCCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCACCAAGGCCTTGCCTtggcgc < 1:1153569/150‑4 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:5433661/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 2:3463147/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:6076427/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 2:1158751/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 1:991505/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:7441943/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 2:8076030/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:9047242/150‑1 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg > 1:1244572/1‑150 (MQ=255) cagcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGAGTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggtg < 2:6374035/150‑1 (MQ=255) gcagAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTggtggtggt > 2:498900/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGGTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTc > 2:1512331/1‑150 (MQ=255) gtgATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACGCACGCGTGTCATCGATGTGTTCGCCAATTTCGTCATTTATGGCCTTCTTGCCGAGCTGTCGAGCCATGTCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGAc < 1:8639306/150‑1 (MQ=255) gtgATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGAc < 2:43293/150‑1 (MQ=255) gATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCt > 1:8124335/1‑150 (MQ=255) tCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTgc > 1:6417046/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTgcgc < 1:6171114/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTgcgc < 2:822324/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTgcgc < 2:3296721/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGa > 2:9008243/1‑150 (MQ=255) ggctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGa > 1:6313933/1‑150 (MQ=255) gctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGAt < 1:5047821/150‑1 (MQ=255) gctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGAt < 1:853020/150‑1 (MQ=255) gctggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGAt < 2:7038488/150‑1 (MQ=255) tggAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGc > 2:5625222/1‑150 (MQ=255) aGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtggt > 1:6566118/1‑118 (MQ=255) cgcgATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACAAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGAtt < 1:7773787/150‑1 (MQ=255) gcgATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGAttt > 1:2941508/1‑150 (MQ=255) gcgATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGAttt < 2:5218986/150‑1 (MQ=255) gATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGc < 2:5112836/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCg > 2:7382833/1‑150 (MQ=255) cAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGc > 1:6612350/1‑150 (MQ=255) tgctgcTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCg > 2:5773871/1‑150 (MQ=255) tgctgTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCg > 2:6578486/1‑150 (MQ=255) tgctgTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCg > 2:7788740/1‑150 (MQ=255) gacgaACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTcc > 2:4019030/1‑150 (MQ=255) cgaACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGc > 2:6341423/1‑150 (MQ=255) aaCCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTg < 1:9008243/150‑1 (MQ=255) aCCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTgg < 1:6751619/150‑1 (MQ=255) ggCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATc > 1:3613886/1‑150 (MQ=255) ggCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATc < 2:3629015/150‑1 (MQ=255) cGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGacac < 2:273020/150‑1 (MQ=255) gATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtgg > 1:7248928/1‑70 (MQ=255) gATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTtggtgg < 2:7248928/70‑1 (MQ=255) aTGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCt > 1:5843343/1‑150 (MQ=255) aTGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCt > 1:7980785/1‑150 (MQ=255) gtgGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTc < 1:7053688/150‑1 (MQ=255) tgGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTcg > 1:4677240/1‑150 (MQ=255) gcCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGt > 2:6007031/1‑150 (MQ=255) gcCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGt < 1:1655762/150‑1 (MQ=255) gcCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGt < 2:450641/150‑1 (MQ=255) gcCAAGGTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCTCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGt < 1:3258813/150‑1 (MQ=255) ccAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTg < 1:6175238/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCAtt < 1:3748436/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCAtt < 1:4436278/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCAtt < 1:7905218/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCAtt < 1:2564377/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCAtt < 1:6372990/150‑1 (MQ=255) gACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGt < 1:2245103/141‑1 (MQ=255) gACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTgg < 2:6409952/150‑1 (MQ=255) aCATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGa < 1:608732/150‑1 (MQ=255) ttATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCa < 1:7710273/150‑1 (MQ=255) ttATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCa < 1:544438/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGAc > 1:8239748/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGAcc > 2:6500713/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGt < 2:169186/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGt > 1:4288231/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGt < 2:3818971/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGttgctt < 2:8590249/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGttgctt < 1:5221662/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGttgctt < 2:7717893/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTgcc > 2:1835409/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGAGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTgcc > 1:6513626/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTgccgccgcc > 2:3103323/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTgccgccgcc > 1:9167175/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTgccgccgcc > 2:2224122/1‑150 (MQ=255) gcgcCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCtt > 1:2776474/1‑150 (MQ=255) accAAGGCCTTGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCg > 1:1498982/2‑150 (MQ=255) caaggcaaggCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCa < 2:1980187/122‑1 (MQ=255) caaggcaaggCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCa > 1:1980280/1‑122 (MQ=255) caaggcaaggCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGcc > 2:4856666/1‑150 (MQ=255) aaggcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCg > 1:4019289/1‑150 (MQ=255) gcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGtt > 2:2068902/1‑150 (MQ=255) gcaaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGtt < 2:1244572/150‑1 (MQ=255) aaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTAt < 2:3527026/150‑1 (MQ=255) aaggcCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTAt < 2:8808957/150‑1 (MQ=255) | TGTCTGGCGGTAACCAGCAGAAGGTGGTGATCGGCCGCTGGCTGGAGCGCGATTGCCAGGTGCTGCTGTTCGACGAACCCACGCGTGGCATCGATGTGGGCGCCAAGTTCGACATTTATGGCCTGCTGGCCGAGCTGGCGCGCCAAGGCAAGGCCTTGGTGGTGGTGTCCAGTGACCTGCGCGAACTGATGCTGATTTGCGACCGCATCGCCGTGCTGTCCGCTGGCCGCCTGATCGACACCTTCGCGCGTGATCATTGGAGCCAGGACCAGTTGCTTGCCGCCGCCTTCGCCGGTTAT > NC_002947/2804807‑2805105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |