| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,276,801 | T→A | 5.0% | H198Q (CAT→CAA) | eamA → | O‑acetylserine/cysteine export transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,276,801 | 0 | T | A | 5.0% | 892.3 / 24.4 | 258 | H198Q (CAT→CAA) | eamA | O‑acetylserine/cysteine export transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/120); new base A (7/6); total (132/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGTGA > NC_002947/3276654‑3276949 | cGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGc < 1:111225/150‑1 (MQ=255) gCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCACCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTg < 2:8372994/150‑1 (MQ=255) gATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGc < 1:5896142/150‑1 (MQ=255) gtgGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCaa < 2:6705149/150‑1 (MQ=255) gtgGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCaa < 2:2063564/150‑1 (MQ=255) tgGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCAAGGCATGGCCAat < 1:1783673/150‑1 (MQ=255) tgGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCAAGGCATGGCCAat < 1:1959104/150‑1 (MQ=255) tgGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCAAGGCATGGCCAat < 1:642636/150‑1 (MQ=255) ggggCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAata < 2:853688/150‑1 (MQ=255) gggCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAatat > 2:1819324/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCa > 2:1183433/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGACATGCCTTGGCCAATATCa > 1:2303665/1‑150 (MQ=255) gCCGGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCa < 2:918988/150‑1 (MQ=255) aaCATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGt > 2:4823372/1‑150 (MQ=255) aaCATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGt > 2:8009271/1‑150 (MQ=255) atcatTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCg < 1:2730626/150‑1 (MQ=255) tcatTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCgg > 1:739602/1‑150 (MQ=255) ttACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGc < 2:1909221/150‑1 (MQ=255) 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gACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGccc > 1:1243030/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGc < 2:7015554/150‑1 (MQ=255) tCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGt > 1:7651730/1‑150 (MQ=255) ggCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTAt > 1:5381683/1‑150 (MQ=255) cTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTAttt > 2:8948638/1‑150 (MQ=255) gTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGTATTGGCCAAGGCATGGCCAatg < 1:170295/112‑2 (MQ=255) gTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGTATTGGCCAAGGCATGGCCAatg > 2:170295/1‑111 (MQ=255) gTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGcc > 1:3450878/1‑150 (MQ=255) gTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGcc < 2:2095822/150‑1 (MQ=255) gTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGcc > 2:2867165/1‑150 (MQ=255) gTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGcc > 1:4141937/1‑150 (MQ=255) 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cTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCAc > 2:3020361/1‑150 (MQ=255) tGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCAcc > 2:5331962/1‑150 (MQ=255) tGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCAcc > 2:2329159/1‑150 (MQ=255) ggCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCAccc < 2:5214760/150‑1 (MQ=255) gCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCg > 1:3609765/1‑150 (MQ=255) aCTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCggc > 2:6223581/1‑150 (MQ=255) cTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCggca < 1:3706758/150‑1 (MQ=255) tCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCggcaggc > 1:9030366/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCggcaggc > 2:6927526/1‑150 (MQ=255) tggtggCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCaaa > 2:4959868/1‑150 (MQ=255) tggtggCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCaaa > 1:6017008/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTgg < 1:1183433/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGgc < 1:5151098/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGgcg > 1:7883260/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGgcg > 1:6353275/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGgcgc > 1:7290036/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGgcgc > 2:1063315/1‑150 (MQ=255) aGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCggca < 1:4489589/133‑1 (MQ=255) gCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTtct < 1:5531598/150‑1 (MQ=255) ccccGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTtctc < 2:5173254/150‑1 (MQ=255) cccGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCg < 1:5782769/150‑1 (MQ=255) cccGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCg > 2:3186890/1‑150 (MQ=255) ctgataTTGGCCAAGGCATGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTGTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCgctgc > 1:8689566/6‑150 (MQ=255) taTTGGCCAAGGCATGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGt > 1:5584822/2‑150 (MQ=255) ccATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGt < 2:4394870/150‑1 (MQ=255) cATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGTg > 1:7248866/1‑150 (MQ=255) | CGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGTGA > NC_002947/3276654‑3276949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |