| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,310,068 | G→C | 5.2% | D104H (GAC→CAC) | csiD → | carbon starvation induced protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,310,068 | 0 | G | C | 5.2% | 905.3 / 26.9 | 267 | D104H (GAC→CAC) | csiD | carbon starvation induced protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (114/139); new base C (2/12); total (116/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.68e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CAGGCATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTCCGACAGCTACCTGCGCCAG > NC_002947/3309921‑3310214 | aGGCATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACg < 2:4076826/150‑1 (MQ=255) aGGCATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACg > 1:2652592/1‑150 (MQ=255) ggCATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGTTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGt < 2:3913880/150‑1 (MQ=255) ggCATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGt < 2:9076221/150‑1 (MQ=255) cATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGa < 1:518372/150‑1 (MQ=255) cATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGa < 1:3856900/150‑1 (MQ=255) cATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTGTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCAGGATGACGTGa < 1:2055133/150‑1 (MQ=255) aTTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAg > 2:3420572/1‑150 (MQ=255) aTTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCAAGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAg > 1:6665678/1‑150 (MQ=255) ttGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGc > 2:1014997/1‑150 (MQ=255) gTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGCTCACGTCATCCAGGc < 2:6827312/150‑1 (MQ=255) gTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGCTCACGTCATCCAGGc < 2:1496074/150‑1 (MQ=255) gTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGc < 2:36036/150‑1 (MQ=255) gTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGc < 2:8583055/150‑1 (MQ=255) gTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGc > 2:4461493/1‑150 (MQ=255) caGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGaa < 1:1800250/149‑1 (MQ=255) aaGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGaa > 2:2557713/1‑150 (MQ=255) aaGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGaa < 1:3088068/150‑1 (MQ=255) aaGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGaa > 1:6094491/1‑150 (MQ=255) aGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAg < 2:2471744/150‑1 (MQ=255) tCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGCTCACGTCATCCAGGCCGatcgg < 2:5788687/150‑5 (MQ=255) tCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGAc > 1:1188696/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATg > 1:8806611/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATg > 2:6360378/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATg < 2:5113407/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGt < 2:5532475/150‑1 (MQ=255) cTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTc > 2:6442629/1‑150 (MQ=255) gCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCaa > 1:4340057/1‑150 (MQ=255) gTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGt > 2:1289673/1‑150 (MQ=255) ttttCGTGTAGGCGAAATCGTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGCGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACTGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGtt > 2:8452941/1‑150 (MQ=255) ttttCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGtt < 2:1694086/150‑1 (MQ=255) ttttCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGtt > 1:7256433/1‑150 (MQ=255) gtAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCaccacc < 1:5057675/150‑1 (MQ=255) gCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCt > 1:3970605/1‑150 (MQ=255) gCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCt < 1:3643244/150‑1 (MQ=255) cGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTg > 1:117682/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACCTGGTCAAGTTCACCACCGCCTgcg > 2:8028092/1‑150 (MQ=255) aTCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCt < 1:2371826/150‑1 (MQ=255) tCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTc > 1:4542895/1‑150 (MQ=255) ttGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCCCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCAcc < 1:5484219/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATc < 1:573435/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATc < 2:782909/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCgg < 1:5832155/150‑1 (MQ=255) agcgtgCCCTGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCgg > 1:7185144/4‑150 (MQ=255) gCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGtt > 2:6092487/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTc < 1:7355484/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCCATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACAAGGTCAAGTTCAACACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTc > 1:337149/1‑150 (MQ=255) gggCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCCCCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCaa < 2:5271328/150‑1 (MQ=255) cACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTa < 2:3198153/150‑1 (MQ=255) cACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTa < 1:6321543/150‑1 (MQ=255) cTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGAc < 2:8206434/150‑1 (MQ=255) tGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGAGCGGCCGTTCCAACTATGACg > 2:8663876/1‑150 (MQ=255) cGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGcc < 1:5622813/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGt < 1:8499924/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGt < 1:7871643/150‑1 (MQ=255) tgctgcTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTg < 1:8663876/150‑1 (MQ=255) gctgctCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACGATGACGCCATGAGTgg > 2:8361739/1‑150 (MQ=255) ctgctCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGc < 2:7330534/150‑1 (MQ=255) 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tCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATgcgc > 1:3451079/1‑150 (MQ=255) tCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCt > 1:4482468/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTc < 2:8606945/150‑1 (MQ=255) cgcgCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtg < 2:8080281/150‑1 (MQ=255) cgcgCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtg < 2:8079891/150‑1 (MQ=255) gcgcCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtgg < 1:2103026/150‑1 (MQ=255) gcgcCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtgg < 2:8972138/150‑1 (MQ=255) gcCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtggtg < 2:7872146/150‑1 (MQ=255) gcCACAGGCGGCATGCGGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTAGGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtggtg < 1:4783389/150‑1 (MQ=255) cctcaGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGCGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGtggtgg < 1:7754286/147‑1 (MQ=255) ccACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGtggtgg > 2:3865712/1‑150 (MQ=255) cacaGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTggtggt > 1:5717379/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCaa > 2:1076648/1‑150 (MQ=255) gcggcATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACa < 2:6665580/150‑1 (MQ=255) cggcATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAg < 2:4643574/150‑1 (MQ=255) ggcATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGc < 2:6778121/150‑1 (MQ=255) gcATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCgtggtg > 1:5204661/1‑140 (MQ=255) cATGCTGATTACCCCCATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGa < 1:3945221/150‑1 (MQ=255) aTGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGCCGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGAc < 1:654953/150‑1 (MQ=255) aTGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGAc > 2:4866279/1‑150 (MQ=255) tGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGcc > 2:4782330/1‑84 (MQ=255) aTTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTcc > 1:5348748/1‑150 (MQ=255) aTTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTcc < 2:543671/150‑1 (MQ=255) tACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTCCGa < 2:1803547/150‑1 (MQ=255) cccGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTCCGACAg > 1:5529749/1‑150 (MQ=255) cccGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTCCGACAg > 2:1592451/1‑150 (MQ=255) tGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTCCGACAGCTACCTGCGcc > 1:5008591/1‑150 (MQ=255) | CAGGCATTGGAGTACAAGTCGTTCCTGCGTTTTCGTGTAGGCGAAATCCTTGACGAGCTGTGCCAGGGCACGCTGCGTCCGGTGCTGCTCAACACCATCCTCGACCGCGCCACAGGCGGCATGCTGATTACCCCGATCGGCCTGGATGACGTGAGCCAGGCCGAAGACATGGTCAAGTTCACCACCGCCTGCGCTCACCTGATCGGCCGTTCCAACTATGACGCCATGAGTGGCCAGTTCTATGCGCGCTTCGTGGTGGTCAACAGCGACAACTCCGACAGCTACCTGCGCCAG > NC_002947/3309921‑3310214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |