Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 3,315,793 | T→G | 5.2% | intergenic (+33/‑126) | hemB → / → proP | 5‑aminolevulinate dehydratase/osmosensory proline/betaine/H+ permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 3,315,793 | 0 | T | G | 5.2% | 896.3 / 25.8 | 262 | intergenic (+33/‑126) | hemB/proP | 5‑aminolevulinate dehydratase/osmosensory proline/betaine/H+ permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/141); new base G (8/6); total (115/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
CGGTGCCATCGACGAAGGCCGGGTGGTGCGCGAAAGCATTGGCGCAATCAAGCGTGCTGGTGCAGACCTGATCCTGACCTACTTCGCCATGGACCTGGCGCGCGAAGGTATCTGAAGCCAGGCCTTGGTCATGAAAGCCGCTGCCATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCTCGCAAGAAAAGCGT > NC_002947/3315646‑3315941 | cGGTGCCATCGACGAAGGCCGGGTGGTGCGCGAAAGCATTGGCGCAATCAAGCGTGCTGGTGCAGACCTGATCCTGACCTACTTCGCCATGGACCTGGCGCGCGAAGGTATCTGAAGCCAGGCCTTGGTCATGAAAGCCGCTGCCATTGc > 2:3441997/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGACGAAGGCCGGGTGGTGCGCGAAAGCATTGGCGCAATCAAGCGTGCTGGTGCAGACCTGATCCTGACCTACTTCGCCATGGACCTGGCGCGCGAAGGTATCTGAAGCCAGGCCTTGGTCATGAAAGCCGCTGCCATTGCAGc < 2:8352138/150‑1 (MQ=255) ccATCGACGAAGGCCGGGTGGTGCGCGAAAGCATTGGCGCAATCAAGCGTGCTGGTGCAGACCTGATCCTGACCTACTTCGCCATGGACCTGGCGCGCGAAGGTATCTGAAGCCAGGCCTTGGTCATGAAAGCCGCTGCCATTGCAGCgg < 2:4866449/150‑1 (MQ=255) 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2:7851106/1‑150 (MQ=255) aTGAAAGCCGCTGCCATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGGTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCGGGTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAAc > 2:7271215/1‑150 (MQ=255) gAAAGCCGCTGCCATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCt > 2:5757245/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGCTGCCATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCTc > 1:1192533/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCTGCCATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCTCg < 1:8674264/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCAATGGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCTCGCaa > 2:4162129/1‑150 (MQ=255) cATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCTCGCAAGAAAAGc > 1:2147613/1‑150 (MQ=255) | CGGTGCCATCGACGAAGGCCGGGTGGTGCGCGAAAGCATTGGCGCAATCAAGCGTGCTGGTGCAGACCTGATCCTGACCTACTTCGCCATGGACCTGGCGCGCGAAGGTATCTGAAGCCAGGCCTTGGTCATGAAAGCCGCTGCCATTGCAGCGGCTTTTCTTTGTGCGCCGTTGGGTGGTGCCGCAAACGCACAAAAAAACAGTAAGCGCTGAATTATTTAGTGTCCTGTTGTATCTGATCCCTTAGAGCATTCATCGACAGGGATACGGGTATGAAACCTCGCAAGAAAAGCGT > NC_002947/3315646‑3315941 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |