| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,400,868 | C→G | 6.4% | intergenic (+123/‑119) | aroQ‑III → / → PP_3004 | type II 3‑dehydroquinate dehydratase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,400,868 | 0 | C | G | 6.4% | 819.9 / 32.3 | 245 | intergenic (+123/‑119) | aroQ‑III/PP_3004 | type II 3‑dehydroquinate dehydratase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/117); new base G (8/8); total (120/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCAGTCAACA > NC_002947/3400719‑3401015 | cTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGc > 1:3688106/1‑150 (MQ=255) tgcgtgcgGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCa < 2:1086431/150‑1 (MQ=255) cgtgcgGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCatg < 1:4661552/150‑1 (MQ=255) gtgcgGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCatgg < 2:6814986/150‑1 (MQ=255) tgcgGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCatgga > 2:1024219/1‑150 (MQ=255) tgcgGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCatgga < 2:5171536/150‑1 (MQ=255) cggcgATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCatggatg > 2:8383814/1‑150 (MQ=255) ggcgATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCatggatgg < 1:1600423/150‑1 (MQ=255) gcgATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCAtggatgga < 1:820604/150‑1 (MQ=255) cgATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCATGctggatgggt < 1:6097070/150‑3 (MQ=255) gATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCATGctggatgggta < 2:2889529/150‑4 (MQ=255) aTGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCATGctggatgggtag < 1:3820876/150‑5 (MQ=255) gCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAg < 1:2137773/150‑1 (MQ=255) gCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAg > 2:3259294/1‑150 (MQ=255) cATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGc > 1:2211899/1‑146 (MQ=255) cATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGt > 1:3439731/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTa > 1:4327764/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTa < 1:6761794/150‑1 (MQ=255) ggTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGc < 2:2027652/150‑1 (MQ=255) ggTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGc > 1:16/1‑150 (MQ=255) gTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCg > 2:8691689/1‑150 (MQ=255) gTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCg > 1:5423637/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCATGctggatgggta > 1:801073/1‑134 (MQ=255) gAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGTGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACtt < 1:3902854/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACtt > 1:5959088/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTcc > 1:1132970/1‑150 (MQ=255) aGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGt < 1:7373393/150‑1 (MQ=255) gcAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTg < 1:2872563/150‑1 (MQ=255) ggggTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCAt < 2:1340250/150‑1 (MQ=255) ttgatttctcCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGt > 2:8142322/7‑150 (MQ=255) tCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGGCTGTAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTa < 2:8952626/150‑1 (MQ=255) tCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTa > 1:4500920/1‑150 (MQ=255) ggATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACg < 2:758566/150‑1 (MQ=255) tcCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCg > 2:5729291/1‑150 (MQ=255) tcCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCg > 1:1945283/1‑150 (MQ=255) gAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCt > 2:7941642/1‑150 (MQ=255) gcgTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTcaa > 1:9044520/1‑150 (MQ=255) tACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGc > 2:2319710/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCAc > 1:5225548/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCAc > 1:2344028/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCAc > 2:8932627/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCATGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTTGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCAccc < 2:5508930/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCAccc < 2:1660217/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCAccc > 2:3152776/1‑150 (MQ=255) gCAGGGGGCGCGGGGCCTGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTCGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTc < 2:7745686/150‑1 (MQ=255) aGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGt > 2:8656946/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGtt < 1:2383364/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGc < 1:6540510/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGGGCAAGCGGCCACCGCGCCAGAAGTGACCGTAGGTGTGGAGGATGACGAGCTCCCTACCCATCCAGCATCGATGGAAAGCCACAACCGACTTCCGTCACTGCATAGTACGCTCCGCCTACAACAACCCACCCGCTACGTTGcc < 2:4792712/150‑1 (MQ=255) cgcgGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTc > 2:357742/1‑150 (MQ=255) gcgGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGTCTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTcc < 2:6299795/150‑1 (MQ=255) cgGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCa > 2:1808389/1‑150 (MQ=255) aTGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCa < 2:4739692/150‑1 (MQ=255) gcggcgACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTa < 1:6208507/80‑1 (MQ=255) ggcgACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGa > 1:5049408/1‑150 (MQ=255) gACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGTATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCg < 1:8778579/150‑1 (MQ=255) gACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCg < 1:7685758/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCggg < 2:258714/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCggg < 2:258323/150‑1 (MQ=255) aggagcCTGAAGTGACCGTATGTGTGGTGGATGTCTTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCTACTTCCGTGACTGCATAGTTCGGTCCGCCTTCATCAATCCACCCTGTTCGTTGCCTCCAACGCCACGTACCggt < 2:2293512/146‑2 (MQ=255) ccTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGctct > 2:7287133/1‑150 (MQ=255) cTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTAGGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCtctc < 1:1278168/150‑1 (MQ=255) cTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCtctc < 2:269319/150‑1 (MQ=255) cTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCtctc < 1:1024194/150‑1 (MQ=255) cTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCtctc > 1:8485579/1‑150 (MQ=255) tGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCa > 1:6951383/1‑150 (MQ=255) tGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCa > 2:4223893/1‑150 (MQ=255) gAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCAt < 1:5265342/150‑1 (MQ=255) aCCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTg < 1:1718339/150‑1 (MQ=255) cGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTggg < 1:5648751/150‑1 (MQ=255) cGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTggg < 1:5729291/150‑1 (MQ=255) tAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAg < 1:4044602/150‑1 (MQ=255) aGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAgg > 1:2573778/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAgg < 2:6183797/150‑1 (MQ=255) gtgtGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTc < 1:327690/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCg > 2:4916408/1‑150 (MQ=255) tggtggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTc > 2:6458786/1‑147 (MQ=255) tggtggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGaa < 2:6616412/150‑1 (MQ=255) tggtggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGaa > 2:5808745/1‑150 (MQ=255) gtggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGTGGTCGAATg < 1:7829485/150‑1 (MQ=255) gtggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATg > 1:414218/1‑150 (MQ=255) ggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGa < 1:2756500/150‑1 (MQ=255) ggATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGa > 1:7908255/1‑150 (MQ=255) gATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGAc < 1:6465407/150‑1 (MQ=255) tGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGt > 2:3556406/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGc < 1:3474182/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCt > 1:7522232/1‑150 (MQ=255) tgctgcCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTa < 1:357742/150‑1 (MQ=255) tgctgcCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTa > 2:1924755/1‑150 (MQ=255) tgcCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACaa > 1:2096576/1‑150 (MQ=255) tgcCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACaa > 1:3759848/1‑150 (MQ=255) tgcCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACaa < 2:1067676/150‑1 (MQ=255) ctttccatccatGCTGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGa > 2:2175374/5‑150 (MQ=255) tttccatccatGCTGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGAt > 1:3066235/4‑150 (MQ=255) ttccatccatGCTGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATc > 1:6380941/3‑150 (MQ=255) cccATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCa < 2:6632858/150‑1 (MQ=255) ccATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCAg > 1:1881719/1‑150 (MQ=255) ccATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCAg > 1:8100645/1‑150 (MQ=255) cATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCAGt > 2:412669/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCAGTc > 2:3830513/1‑150 (MQ=255) | CTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCTGAAGTGACCGTAGGTGTGGTGGATGTCGTGCTGCCTACCCATCCAGCATGGATGGAAAGCCAGTAGCGACTTCCGTGACTGCATAGTACGGTCCGCCTTCAACAAGCCACCCGGTTCGTTGCCTCCAACCCCACGGACCGGGGCTCTCATGACCTGGGAGGTCGAATGGACGTCGCTACAACGATCAGTCAACA > NC_002947/3400719‑3401015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |