Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,827,923 | G→T | 100% | R30S (CGT→AGT) | ptxS ← | 2‑ketogluconate utilization repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,827,923 | 0 | G | T | 100.0% | 1615.0 / ‑6.8 | 446 | R30S (CGT→AGT) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (192/253); total (192/254) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
CGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGC > NC_002947/3827776‑3828069 | cGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACtgg < 1:1034962/150‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga < 1:8393342/150‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga < 1:8692918/150‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga > 2:1828337/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGgag > 1:2318735/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGgaga < 1:7502222/150‑1 (MQ=255) accaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACg > 1:7826011/1‑150 (MQ=255) ccaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACgg < 1:6351838/150‑1 (MQ=255) caGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCAGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGt < 1:8265268/150‑1 (MQ=255) gCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTgg < 2:2253856/150‑1 (MQ=255) cATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCGTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGc > 1:1727365/1‑150 (MQ=255) tGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCtt < 2:8095604/150‑1 (MQ=255) gCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCttt < 1:1792186/150‑1 (MQ=255) ccGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTg < 1:161547/150‑1 (MQ=255) cGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTgg < 2:2117426/150‑1 (MQ=255) ctCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGc < 2:324292/149‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 2:5207373/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 2:5937246/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 1:3776888/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCATTGGAAACGCCa < 2:7771547/150‑1 (MQ=255) gcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAg > 2:1576706/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcgc > 1:1210591/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcgcg > 1:5444798/1‑150 (MQ=255) tttAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGt < 2:5482909/119‑1 (MQ=255) tttAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACt > 1:6909645/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCa < 1:7942194/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCAc < 2:9133687/150‑1 (MQ=255) gCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACt > 1:4662233/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGa < 2:2980075/150‑1 (MQ=255) gcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGAt > 1:4374616/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGAt < 1:6818462/150‑1 (MQ=255) cgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATg < 1:3030096/150‑1 (MQ=255) cgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATg < 1:260399/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc < 2:1214442/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc < 2:6074547/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc > 1:6586481/1‑150 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc < 2:839738/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc < 2:8949110/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAccc < 2:3413259/150‑1 (MQ=255) tGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGt > 1:341516/1‑150 (MQ=255) tGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGACGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGt > 2:4814141/1‑150 (MQ=255) tGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTCACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTcgc < 1:1430578/150‑1 (MQ=255) cGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTa > 1:575853/1‑150 (MQ=255) gATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAAAGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTAt > 1:3141855/1‑150 (MQ=255) tAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATgg < 2:8745941/150‑1 (MQ=255) cGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAg < 1:5573082/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGgc < 2:4467549/150‑1 (MQ=255) gCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGgcgc < 2:6196477/150‑1 (MQ=255) gTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTCCACTGAGGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGt < 1:4908147/150‑1 (MQ=255) ttCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTc < 1:2174380/150‑1 (MQ=255) ttCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTc > 2:6396549/1‑150 (MQ=255) ttCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTc > 2:2622367/1‑150 (MQ=255) tCGATGACCTCGTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCg < 2:2422051/150‑1 (MQ=255) gATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGt > 2:699022/1‑150 (MQ=255) gATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGt > 2:5161982/1‑150 (MQ=255) gATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGt > 2:3887022/1‑150 (MQ=255) gATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACGGATGGTGACCCGTTCGCGGGGATGGGCCGGCGCGTCggg > 1:8980802/1‑149 (MQ=255) aTGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTc > 1:7762139/1‑150 (MQ=255) 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ctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGtt < 2:4398246/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTcgc > 1:5225473/1‑116 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTcc > 1:6276292/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTcc > 2:1753469/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCt > 2:8810735/1‑150 (MQ=255) 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1:8823144/105‑1 (MQ=255) aaCTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATgc > 1:321831/1‑150 (MQ=255) | CGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGC > NC_002947/3827776‑3828069 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |