| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,152,038 | 0 | A | C | 5.3% | 397.5 / 2.6 | 143 | intergenic (+71/‑326) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (75/53); new base C (5/5); total (82/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCC‑TCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGG‑AG‑CGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCA‑CCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCCTCTACCCCAAGGCCTTCAGCCAGCTGGCACTCTCCTTGC > NC_002947/4151889‑4152187 | cAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCC‑TCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGG‑a < 2:4541227/150‑1 (MQ=255)cAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCC‑TCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGG‑a < 1:869141/150‑1 (MQ=255)cAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCC‑TCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAA‑CCCGCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGG‑a < 1:7297220/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |