Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,258,306 | G→C | 5.2% | H189Q (CAC→CAG) | PP_3729 ← | amino acid‑binding protein‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,258,306 | 0 | G | C | 5.2% | 840.7 / 25.0 | 248 | H189Q (CAC→CAG) | PP_3729 | amino acid‑binding protein‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (112/123); new base C (7/6); total (119/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GCGATCTCGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCT > NC_002947/4258157‑4258455 | cgATCTCGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGgt < 2:8609765/150‑1 (MQ=255) aTCTCGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGgtgt > 1:7209394/1‑150 (MQ=255) aTCTCGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATGTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCTCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGgtgt < 2:1641674/150‑1 (MQ=255) tctcGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGtt < 1:2307382/150‑1 (MQ=255) ctcGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTc < 1:1073592/150‑1 (MQ=255) ctcGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTc < 2:8585241/150‑1 (MQ=255) ctcGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTc > 1:5936842/1‑150 (MQ=255) cgcccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGa < 1:8972051/150‑1 (MQ=255) cgcccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGa > 1:6527114/1‑150 (MQ=255) gcccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCCGGTGTTCGAt > 2:8264306/1‑150 (MQ=255) gcccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGAt > 2:907104/1‑150 (MQ=255) cccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATg > 2:7802309/1‑150 (MQ=255) ccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCCGGTGTTCGATGa > 2:4927904/1‑150 (MQ=255) ccgccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGa > 2:8461845/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAAca < 2:7216600/150‑1 (MQ=255) ggTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAAcagca < 1:1911995/150‑1 (MQ=255) tCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCgg > 2:137165/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGt < 1:764723/150‑1 (MQ=255) cGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCACCGGGCTGCTGTTCATCGAACACCTGCCCgggg < 2:7258222/150‑3 (MQ=38) aCTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCACCGGGCTGCTGTTCATCGAACACCTGCCCGGGgcgcagga < 2:2746734/150‑5 (MQ=37) tGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTcc < 2:6507315/150‑1 (MQ=255) cgcgTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTcc < 1:8019171/148‑1 (MQ=255) cgcgTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTcc > 2:8019171/1‑148 (MQ=255) gTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAAt < 1:406452/150‑1 (MQ=255) gTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAAt < 2:3939639/150‑1 (MQ=255) tCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATc < 1:4649115/150‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATcaca < 1:5397284/150‑1 (MQ=255) aGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTc > 1:7466503/1‑150 (MQ=255) aGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTc > 1:3517992/1‑150 (MQ=255) aGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTc < 1:6164939/150‑1 (MQ=255) aGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTc < 1:6155519/150‑1 (MQ=255) ccATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGa < 2:2196948/150‑1 (MQ=255) ccATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGa > 1:204917/1‑150 (MQ=255) ccATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGa > 1:203403/1‑150 (MQ=255) cATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGAt < 1:438649/150‑1 (MQ=255) cATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGAt > 1:2653302/1‑150 (MQ=255) cATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGAt < 1:4771094/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGAt > 2:4815107/1‑107 (MQ=255) tGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCcg > 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aaGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAAAATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATc > 2:6416643/1‑150 (MQ=255) aGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCa < 1:7492090/150‑1 (MQ=255) gggTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAg < 2:7278507/150‑1 (MQ=255) gTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAAAATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCt > 2:7487445/1‑150 (MQ=255) tGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCg > 2:5732809/1‑150 (MQ=255) 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1:8380013/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGt > 1:1565213/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGt > 1:9074253/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTc < 2:3682040/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCtgg < 2:2869529/150‑1 (MQ=255) cGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCtggtg < 1:2117879/150‑1 (MQ=255) tGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTggc > 2:1513238/1‑150 (MQ=255) aaTGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTggcgggcg > 2:4609194/1‑150 (MQ=255) gcgcGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGcgacg > 1:1580477/1‑150 (MQ=255) gcgAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCGGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGaa > 1:292524/1‑150 (MQ=255) gcgAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACAAAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGaa > 1:6714732/1‑150 (MQ=255) cgAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAg < 2:5234268/150‑1 (MQ=255) cgAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACAAAg < 2:6098820/150‑1 (MQ=255) gAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGc > 1:481652/1‑150 (MQ=255) atCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTc < 1:5732809/150‑1 (MQ=255) tCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATCCCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCg > 2:5418139/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCg > 1:7353546/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCg < 2:2234269/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGaa < 2:5936842/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGaa > 1:4489426/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTc > 1:7527923/1‑146 (MQ=255) tGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAAc > 1:5155259/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAAc > 1:545577/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAAc > 1:8520354/1‑150 (MQ=255) gcgcACCGGGCTGCTGTTCATCGAACACCTGCCCGGGGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACt > 1:7819214/1‑150 (MQ=38) gcgcACCGGGCTGCTGTTCATCGAACACCTGCCCGGGGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACt > 1:3201605/1‑150 (MQ=38) ccGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGgcg > 1:6009110/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGgcgc < 2:3517167/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGgcgc > 2:8941809/1‑150 (MQ=255) ggCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCa < 2:2307546/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCt < 2:1962286/150‑1 (MQ=255) | GCGATCTCGCCCGCCTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCT > NC_002947/4258157‑4258455 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |