Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 4,258,320 | G→C | 5.3% | L185V (CTG→GTG) | PP_3729 ← | amino acid‑binding protein‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 4,258,320 | 0 | G | C | 5.3% | 838.0 / 25.0 | 247 | L185V (CTG→GTG) | PP_3729 | amino acid‑binding protein‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (114/120); new base C (7/6); total (121/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCGTACAGCA > NC_002947/4258171‑4258469 | ttCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACagcagc < 2:3747423/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGt < 1:5646756/150‑1 (MQ=255) gCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGGGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTgc < 2:4330203/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCACCGGGCTGCTGTTCATCGAACACCTGCCCGGGgcgcagga < 2:1469759/150‑5 (MQ=37) aCTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCACCGGGCTGCTGTTCATCGAACACCTGCCCGGGgcgcagga < 2:6466191/150‑5 (MQ=37) gcgcGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCt > 1:7904807/1‑150 (MQ=255) gTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAAt < 2:3939639/150‑1 (MQ=255) gTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAAt < 1:406452/150‑1 (MQ=255) tCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATc < 1:4649115/150‑1 (MQ=255) cGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATca < 1:1525413/150‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATcaca < 1:5397284/150‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCACCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATTAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATcaca < 1:4745088/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATa < 1:5971109/150‑1 (MQ=255) 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cccGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAAGTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGgc > 2:3475090/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGgcgc < 2:3517187/150‑1 (MQ=255) cAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATa < 1:4865101/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCt < 2:1962286/150‑1 (MQ=255) gtTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCttt < 2:8699278/150‑1 (MQ=255) 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acgaaaCAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCAcc < 1:7309236/146‑1 (MQ=255) aTGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCg > 2:80225/1‑150 (MQ=255) aTGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCg > 1:8941827/1‑150 (MQ=255) gAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTTAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCGTa < 2:7904807/150‑1 (MQ=255) gAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCGTa < 2:2496696/150‑1 (MQ=255) 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gcagcCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCGTAcagca > 2:2616976/1‑150 (MQ=255) gcagcCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTAGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCGTAcagca < 2:6801204/150‑1 (MQ=255) | CTGGTTCATCCGCTGCAACTGCGCGTCGATTTCAGCCATGTGCTGGCTCAAGGGTGACTGTCGCGATACCGCCACCCGCAGGTAGTCCACGCTCAGTGCCGTGGGCAATGCGCGAATATCCTGCGCCCCGGGCAGGTGTTCGATGAACAGCAGCCCGGTGCGCCGCTCCTGAATCACATAGTCGATGCGCCCGCGGATCAGCTTGCCGAAATTCTGCTGGCTGGACGATACCCGCTCGATGTTCTGGTGGCGGGCGACGAAGCGGTCGAACTCGGCGCCATAGCTTTCACCGTACAGCA > NC_002947/4258171‑4258469 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |