| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,677,305 | G→T | 9.6% | intergenic (+36/+68) | PP_4137 → / ← chrR | outer membrane siderophore receptor/chromate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,677,305 | 0 | G | T | 9.6% | 366.2 / 6.8 | 164 | intergenic (+36/+68) | PP_4137/chrR | outer membrane siderophore receptor/chromate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/93); new base T (6/12); total (51/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGA > NC_002947/4677157‑4677452 | gcTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGa < 1:1625976/150‑1 (MQ=255) cTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGaa < 2:8687288/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAAttt < 1:5615660/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAAttt < 2:7174422/150‑1 (MQ=255) gCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTg < 2:5399360/150‑1 (MQ=255) gCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTg < 2:5399427/150‑1 (MQ=255) cAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGc < 1:3186264/150‑1 (MQ=255) cAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGc < 1:5726887/150‑1 (MQ=255) gACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGAc < 2:6431934/150‑1 (MQ=255) cGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCa < 1:5418900/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 2:8036130/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 1:4179793/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 1:8735223/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTACGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 1:4647115/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCCCACACCGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 1:3343281/150‑1 (MQ=255) gCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGCAAATTCAATGACGCATTcgcg < 1:843046/150‑1 (MQ=37) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGCAAATTCAATGACGCATTCGCgg < 1:3809819/150‑1 (MQ=37) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGCAAATTCAATGACGCATTCGCgg < 1:955522/150‑1 (MQ=37) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCgg < 1:2693082/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCgg < 2:7381780/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGCAAATTCAATGACGCATTCGCgg < 2:7215848/150‑1 (MQ=37) cGGCCGACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCGGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTGACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCggg < 2:3585926/150‑1 (MQ=255) tACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAAc < 1:1157287/150‑1 (MQ=255) aCAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGGTTTCCCCCGCCTTCCGCAATGTATTTTGCGACCCATTCGCGGGTAAAcc > 2:5432275/1‑150 (MQ=255) gacgCGGGCCTGTACTATGCCCGTTCTACACCGGGCGATGGTTTTTGCTTTTTTGCCGGTGTTTCCTACTGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGG‑GTGTTTACCGGGTAATGCGTCTTTGATTTTGCCGACGATTTCGGGGGTAAACCCGCTc < 2:6367949/150‑1 (MQ=255) gacgCGGGCCAGGACAATGCCGGTTCGACACCGGGCGACGGTTTTGGCGTGTATGCGGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:6367590/150‑1 (MQ=38) cgCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTTTACCCGcgaat < 1:1697435/150‑5 (MQ=255) aGGACAATGCCGGTTCGACCCGGGGCGAAGTTTTGGGCGTGTATGCGGGGGTTCCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGG‑GGGTTTACCCGCGATTGCGTCATTGAATTGGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAggg < 2:888246/150‑1 (MQ=37) aaTGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGGTTTACCCCCCAAT‑CGGCATTGTATTTTGCGCAGCATTAGCCGGGAAAACCCCGCCAACACAGGGGCGtt > 2:264051/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTACCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCTAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTg < 2:331319/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACACAGGGGCGGTGca > 2:6839948/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGGTTTACCGCGCCAGGGTCATTTGATTTGCCGGCGCAATAGCCGGTTAAACCGCACCAAAACAGGGGCggttca > 2:151869/1‑145 (MQ=255) cccGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGGTTAACCCCCCAGGCGTCATGGAATTTGCCGCCGCCGTCGCGGGGACACCCCCGCCAACCCCCGGGCGGTGcac > 2:4749761/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGGGTCATTTAATTTTCCGACCCAATCGCCGGTAAAACCCCACCTAAAAAGGGGCggttgaac > 2:4888896/1‑143 (MQ=255) ccGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAAttt > 2:8707246/1‑102 (MQ=255) ttCGACACCGGGCGAAGGATTGGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACCGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCAcagca < 2:490506/150‑1 (MQ=255) acCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTTAATTTGCCGACGCATTAGCGGGTAAAACCCCTCCTACACAGGGGCGGTTCACACCAGGGTTa > 2:3745210/1‑150 (MQ=255) acCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCCCGAATTCGTCAGTGCATTTTCCGACGCAAGCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACAGGGGCGTTTCACAGCAGGagtt > 1:2410073/1‑147 (MQ=255) ccGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTCCCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAg < 2:211852/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGaa > 2:687360/1‑88 (MQ=255) cGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAgg < 2:5143210/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAgg < 1:9136034/150‑1 (MQ=255) gAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGGTTAACCCCCCAGGCGGCCTTGTATTTGCCCCCGCCGTACCGGGGGGACCCCCCCCAAAACCCGGGCGGTGGACAGCCGGGGTAGGGGttg > 2:125527/1‑149 (MQ=255) aaGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGGTTAACCCCGAATTCGGCAATGTATTTTGCGACGCAATAGCGGGTTAAACCCCGACAAAACAGGGGCGGTTGACAGCCGGGGTAGGGGTTCa > 2:5031634/1‑150 (MQ=255) ggATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGa < 2:5186157/150‑1 (MQ=255) aTTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTAAACGCCAATGCGTCAATGAATTTGCCGACGCAATAGCGGGTAAAACCCCTCCAACAAAAGGGCGGTGCACAGCAGGATTAGGGGGTCAGaac > 2:7967438/1‑148 (MQ=255) tttGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTTCCCGCCCATTCGGCAATGGATTTTGCGACGCCATCGCCGGGACACCCGCGCCAACACCCGGGCGGTGCCCCGCAGGCGTAGGGGGTGAGAccc > 2:6299266/1‑149 (MQ=255) tGGCGTGTATGCGGGGGTTTCCTACAGCTTCGGCTGAGGGGTGGGCGG‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTTAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGcc < 1:6750135/150‑1 (MQ=38) gtgtATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTTACCCCCCATTCGTCATTGAATTTTGCGACCCATTAGCGGGTAAAACCGCTACAAAACACGGGCGTTGCACAGCCGGATTATGGGTTGAGACCGCCCGGt > 2:592088/1‑150 (MQ=255) gtgtATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTAACCGCGAATGGGTCATTGGATTTTGCGTCGCATTAGCGGGGAAAACCCCTCCTACACAGGGGGGTTGCACACCCGGATTAGGGGTTAAGACCGCCCGGt > 2:7041874/1‑150 (MQ=255) gtATGCCGGGGTTGCATACAGCTTCCGCTGAGGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGATTTTGCCGACGCATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTc < 1:592088/150‑1 (MQ=39) tGCGGGGGTTTCCCACCGCTTCCGCTGCCGGGTGGGCGC‑GGGTTTCCCCGCGAATGCTTAATTGAATTGGCCGCCGCATGCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAAc < 1:2812560/150‑1 (MQ=255) tGCGGGGGTTTCATCCAGCTCCCGCTGCGGGGGGGGCGG‑GGGTTGCCCCGCGAATGGGTCTTTGATTTTGCCGACGCATCCGGGGGTAACCCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAAc < 1:6998524/150‑1 (MQ=255) ggggTTTCCTACAGCTTCGGCTTAGGGGTGGGGGC‑GGTTTTACCCGCGATTGCTTCATTTAATTTGCCGACGCATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCa < 1:1434458/150‑1 (MQ=255) ggttttCCTACAGCTTCCGCTGCGGGTTGGGGGC‑GGTTTTACCCGCTATTGCTTCTTTGATTTTGCGCACGAATTCGCTGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAc < 1:7386083/147‑1 (MQ=255) gggTTTCCTCCTGTTTCCGCTGCGGGGTGGGCGG‑GGTTTTCCCCGGGAATGCGTAATTTATTTTGCCGACGAATTCGGGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAc < 1:6168748/150‑1 (MQ=255) gggTTTCCTCCTGCTTCCGCTGAGGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAc < 2:7678955/150‑1 (MQ=255) gggTTTCCTCCCGTTGCCGCTGCGGGGGGGGCGG‑GGTTTTACCGGCGATTGGTTATTTTATTTTGCCGACGAATTGGGGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAc < 1:4747740/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAcc < 2:706683/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAcc < 2:7529377/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCAcc < 2:7529371/150‑1 (MQ=255) tttCCTACAGCTGCCGCTGAGGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGATTGCGTCATTTAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCa < 2:168001/150‑1 (MQ=255) ttCCTACAGCTTCGGCTGACGGTTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGATTTGGTCTTTTAATTTGCCGACGCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCAt < 2:909233/150‑1 (MQ=255) cTACAGCTTCCGGTGAGGGGGGGGCGC‑GGGTTTACCGGGTAATGCGTCTTTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGAc < 1:5548030/150‑1 (MQ=38) cTACAGCTTCCGCTGCCGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGATTTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGAc < 1:2085260/150‑1 (MQ=255) cTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTAACCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGAAGCATTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGGTTAGGGGTTCAGACCGCCCAGTTCAACATCAACCATGAc > 2:4550275/1‑150 (MQ=255) cGCTGACGGGTGGGCGC‑GGTTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGt < 2:6037897/150‑1 (MQ=255) cGCTGACGGGGGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCCACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGt < 1:96421/150‑1 (MQ=255) gctgcggggTGGGCGG‑GGTTTTACCCGCTATTGCTTAATTTAATTTGCCGACGAATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTc < 1:1867999/144‑1 (MQ=255) gCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTc < 2:2931931/150‑1 (MQ=255) gCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTAACCGCGCATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCAATCGCGGGTAAAACCCCGCCGAAACAGGGGCGTTGGACAGCAGGATTGTGGGTTGAGACCGCCCGGGTCAACATAACCCAAGAAGCAAACCAGta > 2:4387937/1‑149 (MQ=255) ggggggCGG‑GGGTTTACCCGCGAATGCTTCTTTTAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAAc < 1:6333867/147‑1 (MQ=38) tGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGc < 2:8980267/150‑1 (MQ=255) gggCGG‑GGGTTTACCCGCGATTGCGTCTTTGAATTTGCCGACGCTTTCGGGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGcc < 1:6263470/150‑1 (MQ=255) cgc‑gGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGc < 2:594725/150‑1 (MQ=255) gc‑gGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCa > 1:4694717/1‑150 (MQ=255) c‑gGGTTTACCCGCCAATGCTTAATTGAATTTGCCGACCAATACGCGGCAAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCaa < 1:6570639/150‑1 (MQ=255) gTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGaa < 1:2905576/150‑1 (MQ=255) tttACCCGGTATTGGGTCTTTTATTTTGCGGCCGCTTTCGGGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAAc < 1:3171406/150‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAAc < 2:675213/150‑1 (MQ=255) attACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGTGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAAc < 2:6734204/149‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACg < 2:5322134/150‑1 (MQ=255) ccccGCGAATGCTTATTTGAATTTGCCGACGCTTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGt < 1:6949715/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGt < 2:1921308/150‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCGGCAAATTCAATGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 2:896708/1‑150 (MQ=37) ccGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGc > 2:3176978/1‑135 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 1:8864239/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 2:849896/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 1:8146714/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTACACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcg > 2:3593297/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGGCGCATTTTAATTTGCCGACGCTTTCGGGGTTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTcgc < 1:4858554/150‑1 (MQ=255) aTGCGTCATTGATTTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCtt < 2:210907/150‑1 (MQ=255) aTGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCtt < 2:6775621/150‑1 (MQ=255) tGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTg < 2:732122/150‑1 (MQ=255) ttGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGa > 1:6804612/1‑150 (MQ=255) ttGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGa > 1:3424357/1‑150 (MQ=255) ttGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGa > 1:4365313/1‑150 (MQ=255) ttGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGa > 1:6709824/1‑150 (MQ=255) ttGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGa > 2:497439/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCaaa < 1:607183/105‑1 (MQ=255) | GCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCTGCAAGAACGGTCGCGTCTTGTCATTGA > NC_002947/4677157‑4677452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |