Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 4,808,082 | A→T | 5.3% | S593T (TCG→ACG) | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,808,082 | 0 | A | T | 5.3% | 1124.1 / 25.7 | 331 | S593T (TCG→ACG) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (157/154); new base T (5/14); total (162/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
GCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCT > NC_002947/4807934‑4808231 | gCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGaa < 2:5060552/150‑1 (MQ=255) gCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGaa < 1:4458813/150‑1 (MQ=255) gCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGaa > 1:3266468/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACgg > 2:1588100/1‑150 (MQ=255) cgaTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCCTCGGCCGTTCGGcc < 1:4256840/150‑1 (MQ=255) aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 2:3448601/150‑1 (MQ=255) aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 1:131729/150‑1 (MQ=255) aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 1:6534614/150‑1 (MQ=255) aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 1:186640/150‑1 (MQ=255) ggCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCTCCTCGTCGGCCGAACGGCCGAgg < 2:9057517/150‑1 (MQ=255) ggCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCCGacg < 2:6180277/150‑3 (MQ=255) gCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacga < 1:297175/150‑1 (MQ=255) cGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacgag < 2:2300568/150‑2 (MQ=255) gACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGaaa > 1:282081/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGGCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCt < 2:8313998/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCt < 2:555289/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCt < 2:4588448/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCt > 2:1863624/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCCTCGGCCGTTCGGCcgacgagg > 2:6002954/1‑143 (MQ=255) gCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGa < 1:4648569/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGacc > 2:566069/1‑150 (MQ=255) ttGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGacc < 1:1112331/150‑1 (MQ=255) cGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGAccacca > 1:5245683/1‑150 (MQ=255) gACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCaa > 1:4701730/1‑150 (MQ=255) gACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCaa > 1:5010048/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCCATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCGTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGc > 2:7142169/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTg < 1:8155175/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTgg < 1:5746499/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTgg < 1:6270624/150‑1 (MQ=255) cgGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGa < 1:877759/150‑1 (MQ=255) cgGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGa < 1:7604611/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGa < 2:4256089/150‑1 (MQ=255) cgcAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGAc < 2:3242565/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATg > 1:1730224/1‑150 (MQ=255) cgcgGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGTAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGcc > 2:4008550/1‑150 (MQ=255) cgcgGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACagcga < 1:5418777/150‑5 (MQ=255) cgcgGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGcc > 2:7653182/1‑150 (MQ=255) gcggcgTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCg < 1:7202157/150‑1 (MQ=255) gcggcgTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCg < 2:8705340/150‑1 (MQ=255) ggcgTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGt < 1:7240303/150‑1 (MQ=255) gTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGcc < 2:2716550/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCa < 1:6956886/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCa < 1:7487768/150‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGc > 2:4767747/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTc > 2:6920858/1‑150 (MQ=255) tCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCg > 2:8703274/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCgg < 1:5601235/150‑1 (MQ=255) gctggctgATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTTACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGc > 1:2206096/1‑150 (MQ=255) 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cGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGc < 1:8344239/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCAt > 2:1933995/1‑150 (MQ=255) gTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCg < 2:8027827/150‑1 (MQ=255) gCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgc > 2:2374700/1‑150 (MQ=255) gCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGgc > 1:5477791/1‑150 (MQ=255) 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aaTTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTg > 2:806507/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGaa > 2:7288401/1‑150 (MQ=255) gCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACt > 2:4937248/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc < 2:7836759/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc > 2:3026416/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc < 1:6041192/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc < 1:787641/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc < 2:5860367/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTc < 2:1091311/150‑1 (MQ=255) gCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTgg > 2:8861393/1‑150 (MQ=255) ccccttCGGCGACCGCAGTCACCACCACGTCGGCCGCCCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAACGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTgg < 1:7368681/146‑1 (MQ=255) aTTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCa > 2:1724768/1‑150 (MQ=255) gTGACTGCAGTCTTCACCTCGGCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAACGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGgc < 2:5349369/150‑1 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTc > 2:4092764/1‑150 (MQ=255) tGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTc > 2:6347942/1‑150 (MQ=255) tCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAAc > 1:7790426/1‑150 (MQ=255) cTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAAcc > 2:4883635/1‑150 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGGCATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 2:6413539/1‑150 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 2:8467023/1‑150 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 1:2024031/1‑150 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 1:2403919/1‑150 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt < 2:1443357/150‑1 (MQ=255) cACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGt > 1:4924104/1‑150 (MQ=255) ccTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc > 1:8619792/1‑150 (MQ=255) ccTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc < 1:9004173/150‑1 (MQ=255) 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gCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTcc > 2:7765354/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCt < 2:2920575/150‑1 (MQ=255) | GCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCT > NC_002947/4807934‑4808231 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |