| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 4,808,083 | A→T | 5.4% | R592R (CGT→CGA) | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,808,083 | 0 | A | T | 5.4% | 1071.5 / 32.7 | 331 | R592R (CGT→CGA) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (156/155); new base T (5/13); total (162/169) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.85e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTG > NC_002947/4807934‑4808232 | gCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGaa < 1:4458813/150‑1 (MQ=255)gCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGaa > 1:3266468/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACgg > 2:7240565/1‑150 (MQ=255) aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 1:131729/150‑1 (MQ=255) aTGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGa < 1:186640/150‑1 (MQ=255) ggCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCTCCTCGTCGGCCGAACGGCCGAgg < 2:9057517/150‑1 (MQ=255) ggCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCCGacg < 2:6180277/150‑3 (MQ=255) gACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGTTCGGCcgacgagg < 1:7418143/150‑3 (MQ=255) 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ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt < 2:1443357/150‑1 (MQ=255) ttCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCt > 2:8467023/1‑150 (MQ=255) cACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGt > 1:4924104/1‑150 (MQ=255) aCCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTa < 2:6284374/150‑1 (MQ=255) ccTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTAc < 1:9004173/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGaa < 1:8769580/139‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 2:365519/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 2:282081/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 2:1823586/150‑1 (MQ=255) gtcgGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa < 1:3962379/150‑1 (MQ=255) ctcgGCCGTTCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa > 2:3329600/2‑150 (MQ=255) ctcgGCCGTTCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGaa > 1:1437535/2‑150 (MQ=255) ggCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTc < 2:5010048/150‑1 (MQ=255) gCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTcc > 2:7765354/1‑150 (MQ=255) gCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTcc > 2:2685488/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCt < 2:2920575/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTg < 1:7031462/150‑1 (MQ=255) | GCCGACGATGGCGACGCCAGCTTGCCGACCCAGCGCGGGTTGCGCAGCGCGGCGTCCTGCTCCGGCTGGCTGATCAGGTACGGGTTTCCGCTGGTGCTCAATTGCAGCTCTGGCCATTCGGTGACTGCAGTCTTCACCTCGTCGGCCGAACGGCCGAGGAAATCGCTGACCACCAAAGCCTGGGAGGTGGACATGCCGGTGCCCAGCTCGGTGCCGATATGGCGCAGGCTGATGCGGCCATCGGCGCTGAACTCGACACTGGCCATCGGCGCCTCGGAACCTGTACCGAAGTCCTTCTG > NC_002947/4807934‑4808232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |