Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,863,160 | A→G | 11.4% | intergenic (‑144/+93) | ligA ← / ← PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,863,160 | 0 | A | G | 11.4% | 547.0 / 42.5 | 226 | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (138/42); new base G (8/15); total (151/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.69e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.25e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTAGT > NC_002947/4863011‑4863308 | ggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTa < 1:308284/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAg < 2:431514/150‑1 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGc > 2:7156682/1‑150 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCACCCACAAGGGCGTCACATGCCCAAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGc > 2:2248823/1‑150 (MQ=255) gggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCg > 2:5906343/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCC‑CCGCCCACAAAGGCGGCACAAGCCCAAGGGC‑GGGGTTGTAACAGTAGGAGCgg > 1:8420756/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:9138867/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑CCGCCCACCACGGCGTGACAAGCCCTACGGC‑GGGGATGTAACAGTATGAGCgg > 1:8421440/1‑150 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCggg < 1:7132669/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCCTGAGGGCGTGCTGGCCGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:2046957/150‑1 (MQ=37) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGt < 1:6096719/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGt > 2:5720400/1‑150 (MQ=255) ttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGttt < 2:312793/150‑1 (MQ=14) tGTCTTCTCTTGCAATGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGGCCTATGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:1013542/1‑150 (MQ=255) tGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTa < 1:3529670/150‑1 (MQ=255) gTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTAc < 2:1049417/150‑1 (MQ=14) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTATCTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:2728755/1‑150 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACC‑CCTCCCACAACGGCGTCACAATCCCAAGGGC‑GGTGATGTAACAGTAGGAGCGGGTTTAacc > 1:7037423/1‑150 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 2:1882831/1‑150 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 2:8241344/1‑150 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 1:3744103/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:3378502/150‑1 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCCCAAGGGCGTCACAATCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCAGTAGGGGCGGGTTTAACCGCGa > 2:2730547/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:7349459/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:6566248/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCAAATGCCCTAGGGC‑GGTGATTTACCTGTAGGAGCGGGGTTAACCGCGa > 1:2075651/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACC‑GCTCCCACAATGGGGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTTGCTGTTGGTGGGGGTTTTCCCGCGa > 1:8903979/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGGAACCC‑CCGCCCACCAGGGCGGGACAAGCCCAAGGGC‑CGGGGTGTTCCGGGTGGAGCGGGGTTAcaccccc > 1:4625010/1‑144 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:2828032/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 2:7644688/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCGATGGC‑GGTGCGGTACCGGGGGGCGCGGGTTTACCCGCGAag > 1:4375027/1‑150 (MQ=38) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACC‑GCTCCCAAAATGGCGTGACATGCCCTAGGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTTACCGCGaat > 1:6837574/1‑149 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAATCCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag > 2:6804933/1‑150 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag > 2:3586815/1‑150 (MQ=255) caaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAAACC‑CCTCCCACAAGGGCGGCCCAATCCCGAGGGC‑GGGGATGTACCGGTGGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGc > 1:3575423/1‑150 (MQ=255) caaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAAACC‑CCGACCACAACGGCGTCACAAGCCCGAGGGG‑GGGGGGGTAACGGTGGGGGCGGGGTTAACCGCGAAGcggccggc > 1:6216209/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTTGGAGCGGGTTTTACCCCGCAGAGGCCGGcac > 1:5157332/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGcac > 2:4632369/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGGAAACC‑CCGCCCCCAAGGGCGGCCCCGGCCCCAGGGC‑GGGGGTGTTCCGGGAGGGGCGGGGTTACACCCGAAGAGggcggccc > 1:121939/1‑148 (MQ=255) cagcTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACC‑CCGCCCCAAAGGGCGTCACAATGCCTAGGGC‑GGTGTTGTTACGGTATGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGGCGGCACAGGcca > 1:6350033/1‑148 (MQ=255) agcTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAac > 2:4740935/1‑150 (MQ=255) gTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTATACCC‑GGTGCCACAAGGGCGTCACATGGCCTTGGGG‑GGTGTTGTTGGTGTTGGTGCGGGTTTTCCCGCGAAGTGGGCGGGACAGGGAACGTCGTTAGGCGAAGCgggct > 2:2941831/1‑147 (MQ=255) cAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAACGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCAc > 2:502774/1‑150 (MQ=255) aGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGAATCCCGAACCGGCCCGCACg > 2:1329628/1‑150 (MQ=255) cttttcaCTGTCCCACCCTCTACCCGTCTAAACCC‑GCACCCACAAGGCCTTCACATCCCATAGGGC‑GGTTATTTACATTTAGTAGCGTTTTTACCCGCCAAGAGGCCGGAACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCa < 2:1999714/144‑1 (MQ=255) ggggCCTGCGTCTTCGGGGGTAACCCG‑GCTCCCACCGGGGGGTCACTGGCCCTTGGGG‑GGTTCTTTACGTTTTGGAGGGGGTTCACCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGctc < 2:4009050/147‑1 (MQ=255) ccTCTCCGGGGTTAAACCC‑GCCCCCACACGGGCGACACTTGCCCTCGGGG‑GGTGATGTCCCTTTAGGAGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCt < 2:2776520/150‑1 (MQ=255) ttCGGGGGCAAACCC‑TCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GTTTATTTACCTGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCGGCACATGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAt < 2:9135782/150‑1 (MQ=255) cgggggTAACCCC‑GCCCCCACAGGGGCGCCCCCGGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTCCCTGTGGGTGGGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 2:6183060/147‑1 (MQ=255) cgcgGGTAACCCC‑GCTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTCGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 2:6849724/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTg > 1:7222607/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCC‑GCTCCCACATGGGCGTCACTTGCCCTTGGGC‑GGTGTTGTACCTGTTGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt < 2:5047520/150‑1 (MQ=38) cggTAAACCCGGCCCCCCCACGGGCTTCAATGGCCCTGGGGG‑GGTTTTGTACGTGTTGGCGGGGTTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt < 2:1719709/149‑1 (MQ=255) ggaacaCCC‑GCCCCCACCCGGGCGTCACAGGCCCTCGGGG‑GTTGTTGACCGTGTAGGCGGGGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCa < 2:1574888/145‑1 (MQ=255) ggTAACCCC‑GCTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTAGGGG‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCa < 2:8709801/150‑1 (MQ=255) tAAACCC‑GCTCCCCCACGGGCGTCACAGGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgc < 2:5157880/150‑1 (MQ=39) aaaCCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcg > 2:4780932/1‑150 (MQ=255) aaaCCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcg > 2:8985171/1‑150 (MQ=255) aaaCCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcg > 1:7314507/1‑150 (MQ=255) aaCCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc > 1:5267026/1‑150 (MQ=255) aCCC‑GCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:5609756/1‑150 (MQ=14) ccc‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 1:6741777/1‑150 (MQ=255) ccc‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:1154496/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCTCAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:3263958/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:6489889/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:7803188/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:8832685/1‑150 (MQ=255) tCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg > 1:3386492/1‑150 (MQ=255) cacaCGGGCGTCACATGCCCTTGGGG‑GGTTTTGTACCTTTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa < 2:2719906/150‑1 (MQ=38) cacaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAgg < 1:2877530/112‑1 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg > 2:7816053/1‑146 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:7671517/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:8291531/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:5665547/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:244231/1‑150 (MQ=255) aGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgcgc > 2:885040/1‑150 (MQ=255) gggCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCa > 1:8194928/1‑150 (MQ=255) gTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACACGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgc > 1:1878261/1‑150 (MQ=38) aTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCg > 2:6096838/1‑150 (MQ=255) cccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAAc > 2:337602/1‑150 (MQ=255) cccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAAc > 1:6538641/1‑150 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 2:6168601/1‑150 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 2:4163963/1‑150 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 1:6335965/1‑150 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 2:7496089/1‑150 (MQ=255) cTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTc > 1:7235896/1‑150 (MQ=255) ggggg‑ggTTATTTACGTGTAGGAGGGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga < 1:5171287/149‑1 (MQ=39) gggg‑ggTGCGGTCCCTGTCGGCGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcgac < 2:4847087/150‑1 (MQ=38) gggC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcgac > 2:25993/1‑150 (MQ=255) tGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTg > 2:9086533/1‑150 (MQ=255) gTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTgg > 1:7525702/1‑150 (MQ=255) gTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTgg > 2:4513809/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCgg > 1:38254/1‑150 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGt > 2:3631219/1‑150 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGt > 1:3147873/1‑150 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTACTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGt > 2:8013619/1‑150 (MQ=255) tGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTa < 2:4434709/150‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTa < 2:7422507/150‑1 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTAGt > 2:8751252/1‑150 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTAGt > 1:6069816/1‑150 (MQ=255) | GGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGC‑GTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGTAGT > NC_002947/4863011‑4863308 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |