| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,318,588 | 0 | T | A | 5.3% | 1097.3 / 32.7 | 321 | K161M (AAG→ATG) | ilvC | ketol‑acid reductoisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (146/158); new base A (11/6); total (157/164) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
CGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTAGTGG > NC_002947/5318439‑5318737 | cGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCt < 2:489244/150‑1 (MQ=255) gAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAACCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCtt > 2:3760845/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTg < 1:5635820/150‑1 (MQ=255) 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aTAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCgg > 2:6216731/1‑150 (MQ=255) aTAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCgg > 2:4512927/1‑150 (MQ=255) tAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGa < 1:1698386/150‑1 (MQ=255) tAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGa > 1:7376368/1‑150 (MQ=255) ggcatgaGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGa < 1:7004714/144‑1 (MQ=255) 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cTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTAGTg > 1:6767819/1‑150 (MQ=255) | CGAAACCGGCTTTGACCAGCTCGACGGTACCGCCACACAGAACAGCCTGCTCACCGAACAGGTCGGTTTCGGTTTCGTCCTTGAAGGTGGTTTCGATGATACCGGTACGGCCACCACCTACGCCCGAAGCATAGGACAGTGCGACGTTCTTG‑GCGTTGCCGGAAGCGTCCTGGTAGATAGCGATCAGGTCAGGGATGCCGCCGCCTTTGACGAACTCGGAGCGAACGGTGTGGCCCGGGGCTTTCGGCGCGATCATGATCACGTCGAGGTCGGCACGCGGAACAACCTGGTTGTAGTGG > NC_002947/5318439‑5318737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |