Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,367,689 | G→C | 10.4% | T279T (ACC→ACG) | ftsH ← | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,367,689 | 0 | G | C | 10.4% | 916.7 / 73.4 | 287 | T279T (ACC→ACG) | ftsH | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (143/114); new base C (12/18); total (155/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
ATGTCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGACACCCACGAA > NC_002947/5367540‑5367838 | gTCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGt < 2:4785832/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGt > 1:4871126/1‑150 (MQ=255) tCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCGGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACGGGGTGAggggt > 2:5156975/1‑148 (MQ=255) tCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGtt > 1:8005565/1‑150 (MQ=255) tCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGtt > 1:55660/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTg > 1:8116418/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTg < 2:254569/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTg < 1:6644795/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTg > 2:1165232/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTg > 2:8311553/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGc > 2:616259/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGc > 1:2145821/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCt > 1:8585494/1‑150 (MQ=255) aGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCa < 2:1546489/150‑1 (MQ=255) aGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCa < 1:4090949/150‑1 (MQ=255) gCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGACGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACg > 2:386316/1‑150 (MQ=255) cAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCt > 2:5812884/1‑150 (MQ=255) aaCCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCtc < 2:8677823/150‑1 (MQ=255) aaCCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCtc < 2:2671036/150‑1 (MQ=255) ccaccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTcgtcgt < 1:940517/150‑1 (MQ=255) ccaccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTcgtcgt > 1:6897054/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAc > 1:3960281/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAc < 2:8620299/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAcc > 2:2115987/1‑150 (MQ=255) tcgCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAccg > 2:6144309/3‑150 (MQ=255) gCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGTCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCTTCTCGAAGCCGTCCATCTCCTCCAGCAACTGGTTGATGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAccgcc < 1:6844777/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAccgcc > 2:7577698/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGccc < 1:1990567/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCgg < 2:683863/150‑1 (MQ=255) cGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGgcgc > 1:5160762/1‑150 (MQ=255) gggCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCa < 2:55660/150‑1 (MQ=255) gcagcaGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGAt > 1:1098466/1‑150 (MQ=255) agcagcGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATgg > 1:7275956/1‑150 (MQ=255) 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atcatTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGc > 1:9123562/1‑150 (MQ=255) atcatTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGc > 2:4062971/1‑150 (MQ=255) catCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTc < 2:234652/150‑1 (MQ=255) ctcGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGaa < 1:6695656/150‑1 (MQ=255) tcGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAAc > 2:3350419/1‑150 (MQ=255) 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tttcgaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGgacgc > 2:2075946/6‑148 (MQ=255) tctcCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCacac < 1:5803026/150‑1 (MQ=255) gaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCt > 1:7935322/2‑150 (MQ=255) gaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCt > 1:3369710/2‑150 (MQ=255) gaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCt > 1:8948562/2‑150 (MQ=255) caccaGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCt < 2:881764/150‑1 (MQ=255) caccaGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCt > 2:8203081/1‑150 (MQ=255) caccaGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCt > 1:4992908/1‑150 (MQ=255) agaagcTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCTTGCa < 1:5464701/145‑1 (MQ=255) agaagcTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCTTGCa < 1:2087284/145‑1 (MQ=255) gCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCAc > 2:7474391/1‑150 (MQ=255) aagcTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCCCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTCTTCGAACATGTCACGTACGCGGCTTGCAcc < 2:4925940/147‑1 (MQ=255) aCTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGTCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGa > 2:3264445/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGac < 1:786260/150‑1 (MQ=255) ttGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGACGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACAAGTCGCGCACACGGCTGGCACCGACAccc > 1:82/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ggTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGACACCCACGaa > 1:1307328/1‑150 (MQ=255) | ATGTCCGGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGACACCCACGAA > NC_002947/5367540‑5367838 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |