Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,367,695 | C→T | 11.0% | E277E (GAG→GAA) | ftsH ← | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,367,695 | 0 | C | T | 11.0% | 753.5 / 62.9 | 271 | E277E (GAG→GAA) | ftsH | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (129/112); new base T (12/18); total (141/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
GGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGACACCCACGAACATTTC > NC_002947/5367546‑5367844 | ggCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGc > 1:2145821/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCt > 1:8585494/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTc < 2:3842731/150‑1 (MQ=255) aGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCa < 1:6872976/150‑1 (MQ=255) aGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCa < 1:4090949/150‑1 (MQ=255) cAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCt > 2:5812884/1‑150 (MQ=255) cAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCt > 2:2170875/1‑150 (MQ=255) cAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGACGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCt > 2:409829/1‑150 (MQ=255) caccaccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCtcgtc > 2:2364449/1‑150 (MQ=255) caccaccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCtcgtc < 1:6678325/150‑1 (MQ=255) ccaccTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTcgtcgt > 1:6897054/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAccgcc > 2:7577698/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGATCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCCACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGccc < 1:1991252/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCAt > 2:2486627/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCgg < 2:683863/150‑1 (MQ=255) cGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGgcgc < 1:5543360/150‑1 (MQ=255) gggCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCa < 2:55660/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCAc < 2:8121385/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCAc > 2:8351025/1‑150 (MQ=255) gcagcaGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGAt > 1:1098466/1‑150 (MQ=255) agcagcGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATgg > 1:7766877/1‑150 (MQ=255) agcagcGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATgg > 1:7275956/1‑150 (MQ=255) agcagcGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATgg < 2:2600264/150‑1 (MQ=255) 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tCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTtcg > 2:614893/1‑150 (MQ=255) ccGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTtcgt < 2:2551060/150‑1 (MQ=255) cGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTtcgtc < 2:7706214/150‑1 (MQ=255) ggACGGTTGGTGACGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTtcgtcg > 1:5859720/1‑150 (MQ=255) gACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGa < 2:9073059/150‑1 (MQ=255) 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tctcCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGAACGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCacac > 2:8632412/1‑150 (MQ=255) ttcgaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGAcgcg < 1:2375262/146‑1 (MQ=255) tcgaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCgg < 1:2108603/147‑1 (MQ=255) tcCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACgg > 2:1129791/1‑150 (MQ=255) tcCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACgg > 1:7894732/1‑150 (MQ=255) gaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCt > 2:8260996/2‑150 (MQ=255) gaccaGAAGCTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCt > 1:8948562/2‑150 (MQ=255) agaagcTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCTTGCa < 2:3324866/145‑1 (MQ=255) gaagcTGGTTCAGCGTCTGTTCGCGTTCGTCGTTGCCGCCGCCAAGACCGGCACCACGGTGGCGACCGACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCAAGGCGCATTCTTCTTGGCCTGTTCGAACATGTCACGGACGCGGCTTGCAc < 1:3207248/146‑1 (MQ=255) gCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCAc > 2:7474391/1‑150 (MQ=255) 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GGCAGGCCAACCACCACCTGGCGGTCGAAGCGGCCGGGGCGCAGCAGCGCAGGGTCGAGCACATCCGGACGGTTGGTGGCGGCGATGACGATGATGCCATCATTCATCTCGAAGCCGTCCATCTCCACCAGCAACTGGTTGAGGGTTTGCTCACGCTCGTCGTGACCGCCGCCCATGCCGGCGCCACGATGGCGACCAACGGCGTCGATTTCGTCGATGAAGATGATGCACGGGGCGTGCTTCTTGGCCTGCTCGAACATGTCGCGCACACGGCTGGCACCGACACCCACGAACATTTC > NC_002947/5367546‑5367844 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |