Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,448,265 | A→C | 16.2% | E147A (GAG→GCG) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,448,265 | 0 | A | C | 16.2% | 539.5 / 20.1 | 263 | E147A (GAG→GCG) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (143/67); new base C (15/33); total (162/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
CCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGC > NC_002947/5448116‑5448413 | cAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAg < 1:4111063/150‑1 (MQ=255) cAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAg < 2:8715249/150‑1 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCCACGT‑CGGCCGGCGCGCGCAgg > 1:6540613/1‑150 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAgg > 2:3973405/1‑150 (MQ=255) ggCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGc < 2:5685099/150‑1 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGcc > 2:3237045/1‑150 (MQ=255) cAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGATGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTATATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAGCGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGccg < 1:7284529/150‑2 (MQ=255) cAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAGCGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGccg < 1:1004485/150‑2 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCGCGAGCACGcccc > 1:7318884/1‑149 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGT‑CGCCCTGCGCGCGCCGGcccc > 2:6340188/1‑149 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTCCAATTCGGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGccga < 2:6504222/150‑3 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCATGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCATTTGGCCGCTTCTTAAATTCTGTCACCAAGCCGGGGGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCTGGccgacg < 2:2361789/150‑5 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGCGCAGGCCcgcg > 2:3055552/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGATCAGGCCcgcg > 2:5985512/1‑150 (MQ=255) atcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGccgacgtt < 2:760663/150‑7 (MQ=255) atcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGcc > 1:7864643/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCCCCAACCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGccc < 2:3493088/150‑1 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCGGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGccc < 2:7377939/150‑1 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGACTGCTCGAGCAGGCCCGCGccc > 2:784868/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGA‑CGGCGGGCGCGAGACCGCCCGCcccc > 1:5655658/1‑150 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCgg > 2:5953349/1‑150 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCACGAGCAGGCCCGCGCCCAgg > 2:4740906/1‑150 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCGCGCGCCGGCCCGCGcccccggg > 1:6873079/1‑145 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCGCGCGCCGGCCCCCCCCCacggg > 1:6252077/1‑146 (MQ=255) aCCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaaa < 1:7489501/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaaa < 2:2040246/150‑1 (MQ=255) gCCCCGCCTGCCTCGAACGGGCCGCCCCGGCTGCCTGCTATGGCGCCAGATACGGGGCGTTTGGCCGCTTCTTAAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCCCCCGCTGCAACCGT‑CGGCTGGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGc < 2:3812922/150‑1 (MQ=255) ccACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCTGGCTGCCAGCGACGGGGCCAGCTACGTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAACCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGcc < 2:7705322/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATc > 2:5538495/1‑150 (MQ=255) cAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGc > 2:7314837/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGAACGGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGGGGCCTTTGGCCGCTACTCCATTTCTGCCACCAAGCGGGGCGCGCCCGCGGCCACCGC‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGcc < 2:1771726/150‑1 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCggg > 2:134004/1‑148 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGACACTGCCGATCGCCGTgg > 2:7161935/1‑149 (MQ=255) ttcgcTGGCAGCCTGGGCGGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCACTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGAt > 1:2917098/5‑150 (MQ=255) ggCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTgg > 2:5594789/1‑150 (MQ=255) cgccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCACGTGCAACAGCCGATCGCCGTGGTCGGTGGCAt > 1:7030950/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGGGTGCCGTGGCATCAcccgc > 2:1936292/1‑148 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGCTCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGa > 2:2613940/1‑150 (MQ=255) gCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGTGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGCTGAAACAGCCGCTCGCCGGGATCGGTGGCCTCACCCACGACAAcc > 1:3330653/1‑149 (MQ=255) gCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCCCCCAGGTGAAAATGACGATCGCCGAGATCGGTGGCATCACCCAAGACAAcc > 1:1134291/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGTAACAGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCATCACCCACGACAAagcc > 1:8936315/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGTGGCGTTGGGCGGCTTCGTCATTTCGGCCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTCCCAACGG‑GGGCCGGCTCGCCCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCAc < 1:6946962/150‑1 (MQ=255) cggtctttGGGCTTGGGCCTTTTCTTCTTTTCGGTACCCAGGCGGGGGGCGCCCGCGGCCACGGG‑CGGCGTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTg < 1:2802806/143‑1 (MQ=255) gCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGGGGCATCACCCACGACAAAGCCCCCCCACAgg > 1:1879288/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCCCCCCACAGGTCGcc > 1:8332249/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCATTTCCGCCACCCCCCCGGGCGCGCCCGCGCCCAACGC‑CGGCCGGCCCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGcc < 1:133555/150‑1 (MQ=255) tttGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCCCGTGAAACAGCCCATCGCCCGGATAGGTGGCATCACCCACCACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCAcccc > 1:7190191/1‑147 (MQ=255) ggCCGCTTCTTCAAGTCTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGT‑CGGCGTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGcc < 2:8614166/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGa > 2:4630803/1‑150 (MQ=255) cGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGAc > 2:6548069/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCAATTCTGTCACCCAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCCCGGGGCGCCCACGGCGCCGAcc > 2:7214363/1‑150 (MQ=255) ttcttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGAACGCCGAGATCGGTGGCATAACCCACGACAAAGCCCCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCCAccgg > 1:1397616/1‑148 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACACCGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:6234839/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:4874865/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTAGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACGGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACcagctg > 2:1000462/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCACGAGCAGGCCCGCGCCCAGCGGTCAATGCCGATCGCCGAGGGCCGTGGCAGCACCCACGAAAACCCCCCCCCACGGCTCGCCCACCGCGCCGAccgcctg > 1:935829/1‑145 (MQ=255) ttcAACTCGGCCACCACGCCGGGCCCGCCCGCTGCCACCGT‑CGGCCTGCCCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg < 1:8131140/150‑1 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGAACGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGCCGCCGACCAGCTgg > 2:7402165/1‑150 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCCTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCGACCAGCTgg > 1:2879932/1‑150 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCCTGATCGGTGGCATCACCCACGACAAAGCCGCCCCACAGGTCGCCCCCGGCGCCGCCCAGCTgg > 1:8625629/1‑150 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCCCCCACGAGAAACTGCCCATCGCCGGGATCGGTGGCAACACCCACGACAACCCCCCCCCACACGACGCCCACGCCGCCCACCAGCAgg > 1:8467114/1‑150 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCAGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGGGTAACAGCCCATCGCCGTGAGCGGAGGCGTAAACCTCGACAACACCCCCCCACAGGGCGCCCCCGCCGCCCCCCGGCTgg > 1:2323/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCCTCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg > 2:8478760/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCCGCCAACGT‑CGGCCGGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 2:8255982/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCCCCCCCCAGGTCGCCCACGGCCCCGACCGGCTGGCgg > 1:2262056/1‑150 (MQ=255) aTTCTGCCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGC‑CGGCCGGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCgg < 1:4540075/150‑1 (MQ=255) ctcaccccACGCGGGGCGCCCCCGCTGCC‑ACGTCCGGCCGGATCCACCACGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATAGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGa < 1:2455899/144‑1 (MQ=255) cTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGT‑CGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGa < 1:2102642/150‑1 (MQ=255) gTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCGGCGCGAGCCGGCCCGCGCCCCGGGGCAACAGCCGCTCGCCGGGATCGGTGGCCTCACCCGCGACAACGCCGCCCCCCGGGTCGCCCACCGCGCCCACCGGCTGGCGGGGATc > 1:5047713/1‑150 (MQ=255) cccACGCCGGGCCCCCCCGCGGCCCCCGC‑CGGCCGGCCCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCTGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc < 1:6315251/149‑1 (MQ=255) aCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc < 1:5975704/150‑1 (MQ=255) aCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACACCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc > 2:4974883/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGGTCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTTCTCGATCAGGCCCGCGCCCATTTGAAACTGCCGATAGCCGTTATATGTGGCATCAACCTAGAAAACGCCGCCCCACTTGTCGCCCACTGCGCCGACCTGATGGCGGTGATACACgg > 2:5453922/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCACGGGAAACTGCCGATAGCCCTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACGGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGc > 1:3984203/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGGCGCGCCCGCCGCCACCGG‑CGGCCTGCTCGAGCAGACCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGc < 2:4362392/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 2:3033035/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 2:2739750/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCGCCCCCCAGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTg > 1:8787267/1‑150 (MQ=255) gggCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGtt > 2:1528428/1‑150 (MQ=255) gcgcCCGCTGCCCACGG‑CGGCCTGCTCGAGCTGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGt < 2:870253/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCCCTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGt > 1:3090925/1‑150 (MQ=255) gcCCGCCGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc < 1:8217364/150‑1 (MQ=255) gcCCCCCGCCACCGG‑CGGCCGGCCCCCCCAGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc < 1:5589386/150‑1 (MQ=255) tGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACGGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAg > 1:4408646/1‑150 (MQ=255) ccAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTg > 2:4818113/1‑134 (MQ=255) cAACGT‑CGGCCTGCCCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc < 2:5742134/150‑1 (MQ=255) cAACGT‑CGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc < 2:1153266/150‑1 (MQ=255) aaCGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 1:3232924/1‑150 (MQ=255) aaCGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCCACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCCACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 1:8589630/1‑150 (MQ=255) gcgggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAg > 1:3486981/4‑150 (MQ=255) gcgggCCGGCGCGCGCCGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAg < 1:4788031/147‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 2:3762967/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAg < 1:2998452/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGt > 1:5238540/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGt > 1:1954683/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTc > 1:4511193/1‑150 (MQ=255) cTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAcc < 2:8948728/150‑1 (MQ=255) cTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAcc < 2:6825378/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAccc > 2:1998491/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgc > 1:1701202/1‑150 (MQ=255) | CCGTCAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGT‑CGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGC > NC_002947/5448116‑5448413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |