Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,448,268 | A→C | 12.2% | Q148P (CAG→CCG) | thiE → | thiamine‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,448,268 | 0 | A | C | 12.2% | 562.3 / 8.3 | 264 | Q148P (CAG→CCG) | thiE | thiamine‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (150/72); new base C (11/29); total (161/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.66e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGCG > NC_002947/5448120‑5448417 | cAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAg < 2:8715249/150‑1 (MQ=255) aGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCCACGTCGGCCGGCGCGCGCAgg > 1:6540613/1‑150 (MQ=255) ggCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGc < 2:6499842/150‑1 (MQ=255) gCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGcc > 2:3237045/1‑150 (MQ=255) cAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAGCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGccg < 1:1004485/150‑2 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCACGcccc > 1:7318884/1‑149 (MQ=255) aaTCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGCCCTGCGCGCGCCGGcccc > 2:6340188/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCATGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCATTTGGCCGCTTCTTAAATTCTGTCACCAAGCCGGGGGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCTGGccgacg < 2:2361789/150‑5 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCcgcg > 2:3055552/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCAGCTCGAGCAGGCCcgcg > 2:5985446/1‑150 (MQ=255) atcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGcc > 1:7864643/1‑150 (MQ=255) tcGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGACTGCTCGAGCAGGCCCGCGccc > 2:784868/1‑150 (MQ=255) gCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCgg > 2:5953349/1‑150 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGCGCCGGCCCGCGcccccggg > 1:6873079/1‑145 (MQ=255) tCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGCGCCGGCCCCCCCCCacggg > 1:6252077/1‑146 (MQ=255) aCCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCCGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTATTCAATCCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaaa < 1:7489586/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGaaa < 2:2040246/150‑1 (MQ=255) cTGCCACGCCTGCCTCTACCGGGCGGCCCAGGCTGCCCGCGATGGGGCCAGCTACTTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCGGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACGGCCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACt < 2:5401289/150‑1 (MQ=255) cTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAAAGTCGGGGTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCCGTGAAACt > 1:3110474/1‑150 (MQ=255) gCCCCGCCTGCCTCGAACGGGCCGCCCCGGCTGCCTGCTATGGCGCCAGATACGGGGCGTTTGGCCGCTTCTTAAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCCCCCGCTGCAACCGTCGGCTGGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGc < 2:3812922/150‑1 (MQ=255) ccACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCTGGCTGCCAGCGACGGGGCCAGCTACGTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAACCCGGGCGCGCCCGCGGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGcc < 2:7705322/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGc > 2:7314837/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGAACGGGCCGCCCCGGCTGCCAGCGATGGCGCCAGCTACGGGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGTGGGCGTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGcc < 2:7441801/150‑1 (MQ=255) aGCCTCGAACGGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGACGGCGCCAGCTACGGGGCCTTTGGCCGCTACTCCATTTCTGCCACCAAGCGGGGCGCGCCCGCGGCCACCGCCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGcc < 2:1771726/150‑1 (MQ=255) cTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCggg > 2:134004/1‑148 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGACACTGCCGATCGCCGTgg > 2:7161935/1‑149 (MQ=255) tCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGa > 2:6704484/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGGGCCGGCCCCCCCCCCCCGGAAACTGCCGATAGCCGTGATCg > 1:3022936/1‑150 (MQ=255) gggCCGCCCAGGCTGCCACCGACGGCGCCAGCTACGGGGCCTTGGGCCGCTTCTTCAATTCTGCCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCGGCCACCGCCGGCCGGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTg < 1:2826803/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTgg > 2:5594789/1‑150 (MQ=255) gccgccCTGGCTGCCTGCGACGGCGCCCGCTCCGTGGCGTTTGGCCGCTACTACAAGCCGGACCCCACGCGGGGCGCGCCCGCGGCCACCGACGGCCGGCTCCAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGc < 1:5730547/150‑1 (MQ=255) cgccCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCACGTGCAACAGCCGATCGCCGTGGTCGGTGGCAt > 1:7030950/1‑150 (MQ=255) aGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAAATGCCGATCGCCGTGATCGGTTGCATCAccc > 1:6953026/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGGGTGCCGTGGCATCAcccgc > 2:1936292/1‑148 (MQ=255) tGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGCTCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGa > 2:2613940/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGGGGCAACAcccaccacca > 1:5221782/1‑143 (MQ=255) gCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCGGCGCGGGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGCTCGCCGTGATCGGTGGCGGCACCCACCACAAcc > 1:8427069/1‑149 (MQ=255) gCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCCCCCAGGTGAAAATGACGATCGCCGAGATCGGTGGCATCACCCAAGACAAcc > 1:1134291/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCCCGCCCCGGGGAAACTGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCGTCACCCACGACAAcgcc > 1:4248491/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGGGTAACAGCCGATCGCCGGGATCGGTGGCATCACCCACGACAAagcc > 1:8936315/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCAGCACCCACGACAACGCCGccc > 1:1419357/1‑150 (MQ=255) gcCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCCGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCCCCCGCGACCACGCCGCCCCa > 2:869446/1‑150 (MQ=255) cAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATAGGTGGCATCACCCACGACAACCCCGccccccg > 1:3442030/1‑147 (MQ=255) tACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGGCTGGTGGAGCAGGGCCGCGCCCAGGTGTAAATGCCGATCGCCGTGATCGGTGGGATAACCCTCGACAAAGCCGCCCCACTGGtg > 1:4432256/1‑149 (MQ=255) gTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACAGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCCCCCCACAGGTCGcc > 1:8332249/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTTGGGCCGCTTCTTCATTTCCGCCACCCCCCCGGGCGCGCCCGCGCCCAACGCCGGCCGGCCCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGcc < 1:133555/150‑1 (MQ=255) tttGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCCCGTGAAACAGCCCATCGCCCGGATAGGTGGCATCACCCACCACAACGCCGCCCCACAGGTCGCCCAcccc > 1:7190191/1‑147 (MQ=255) ggCCGCTTCTTCAAGTCTGTCCCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCGTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGcc < 2:8614166/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGa > 2:4630803/1‑150 (MQ=255) cGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGAc > 2:6548069/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAAATGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACCCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGAcc > 1:8747585/1‑150 (MQ=255) ttcCATTCTGTCCCCCCGCCGGGCGCGCCCGCTGCCCCCGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg < 1:8131044/150‑1 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCCCCCGCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:5513129/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACACCGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACctgctg > 2:6234839/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAAAAGCCGATAGCCGTGATCGGTGGCATCAACCTCGACAACGCCCCCCCCCAGGTCGCCCACCGCGCCGACcagctg > 1:958300/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACCACAACCCCGCCCCACAGGTCGCCCACGGCGCCGACcggctg > 1:2145054/1‑150 (MQ=255) ttcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCACGAGCAGGCCCGCGCCCAGCGGTCAATGCCGATCGCCGAGGGCCGTGGCAGCACCCACGAAAACCCCCCCCCACGGCTCGCCCACCGCGCCGAccgcctg > 1:935829/1‑145 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGAACGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGCCGCCGACCAGCTgg > 2:7402165/1‑150 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACAGCCGATCGCCCTGATCGGTGGCATCACCCACGACAAAGCCGCCCCACAGGTCGCCCCCGGCGCCGCCCAGCTgg > 1:8625629/1‑150 (MQ=255) tcAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGTCTCGAGCACGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGACCATAGCCGTGATCGGTGGCATCACCCACGACAACGCCCCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCGACCAGCTgg > 1:6323458/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCCTCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCg > 2:8478760/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCACGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACCCCGCCCCACAGGTCGCCCACCGCGCCGACCAGCTGGCgg > 1:2262128/1‑150 (MQ=255) cgcccaccacGCCGGCCCCCCCCGCCCCCCACGTCGGCCTGCTCGCCCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGa < 1:328891/146‑1 (MQ=255) cTGACACCAAGCCGGGCGCGCCCCCTCCCAACGACGCCCTGCTCCAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGGTCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGa < 2:5641096/150‑1 (MQ=255) cccccgCCGGGCGCGCCCGCGGCCCCCGGCGGCCTGCGCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc < 1:4649090/145‑1 (MQ=255) aCCACGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc < 1:5975704/150‑1 (MQ=255) aCCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACACCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCAc > 2:4974883/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCCCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCAACACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGGCGCCCACGGCGCCGACCGGCTGGCGGTGATCCACgc > 2:4872382/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCGCGCGCAGGCCCGCGCCCACGGGAAACTGCCGATAGCCCTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACGGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGc > 1:3984203/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGGCGCGCCCGCCGCCACCGGCGGCCTGCTCGAGCAGACCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGc < 2:4362392/150‑1 (MQ=255) gcggggCGCGCCCGCGGCCCCGGGGGGCCGGCTCGCGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 1:1933824/147‑1 (MQ=255) gCCGGTCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCCGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 2:3033035/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCGCGCCCGCTGCCACCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCtt < 2:2739750/150‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGtt > 2:1528428/1‑150 (MQ=255) gcgcCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGt < 1:2993427/150‑1 (MQ=255) gcCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc > 2:4099588/1‑150 (MQ=255) gcCCGCCGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc < 1:8217364/150‑1 (MQ=255) gcCCCCCGCCACCGGCGGCCGGCCCCCCCAGCCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGc < 1:5589386/150‑1 (MQ=255) ccAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTg > 2:4818113/1‑134 (MQ=255) ccAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTg < 1:4818113/134‑1 (MQ=255) ccAACGTCGGCCTGCGCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcg > 2:3508259/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc < 1:2899955/150‑1 (MQ=255) cAACGTCGGCCTGCCCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc < 2:5742134/150‑1 (MQ=255) cAACGTCGGCCGGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgc < 2:1153266/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 2:8073591/1‑150 (MQ=255) aaCGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCCACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCCACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAgcgcg > 1:8589630/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCTCGCGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 2:7227534/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCATGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 1:7314837/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGaa < 2:3762967/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGt > 1:5238780/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTc > 1:4511457/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTc > 1:2523714/1‑150 (MQ=255) gCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAc > 2:4742351/1‑150 (MQ=255) cTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAcc < 2:6825378/150‑1 (MQ=255) cTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAcc < 2:8948728/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAccc > 2:1998491/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCAccc > 1:2428756/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccg > 1:2075771/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACccgc > 1:1701202/1‑150 (MQ=255) aGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGccgcg > 2:7389963/1‑150 (MQ=255) | CAGGCAATCATCGGCTCCACCTGCCACGCCAGCCTCGAACTGGCCGCCCAGGCTGCCAGCGAAGGCGCCAGCTACGTGGCCTTTGGCCGCTTCTTCAATTCTGTCACCAAGCCGGGCGCGCCCGCTGCCAACGTCGGCCTGCTCGAGCAGGCCCGCGCCCAGGTGAAACTGCCGATCGCCGTGATCGGTGGCATCACCCTCGACAACGCCGCCCCACTGGTCGCCCACGGCGCCGACCTGCTGGCGGTGATCCACGGCTTGTTCGGTGCCGACAGCGCGCAGGAAGTCACCCGCCGCG > NC_002947/5448120‑5448417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |