Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,494,831 | C→A | 6.2% | S385S (TCG→TCT) ‡ | cobJ ← | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,494,831 | 0 | C | A | 6.2% | 1024.1 / 40.4 | 306 | S385S (TCG→TCT) ‡ | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (150/136); new base A (13/6); total (164/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
TGGGCGGCGGTTGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAG > NC_002947/5494682‑5494980 | ggggCGGCGGTTGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCCAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGAATGACGACAcccccgccacc < 2:8912549/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGGTTGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACAccaccgccaccg > 1:6810413/1‑150 (MQ=255) gcggcgGTTGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGaa > 1:2968135/1‑150 (MQ=255) ggcggTTGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACg > 1:3450858/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTg < 2:654349/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCCGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCAGGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGgc < 2:441650/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGgc > 1:1002056/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGgc < 2:5903402/150‑1 (MQ=255) cGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGgccgc < 2:7491312/150‑1 (MQ=255) gCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGt < 2:6685679/150‑1 (MQ=255) gCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGt < 1:8510726/150‑1 (MQ=255) gATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCg > 2:728668/1‑150 (MQ=255) tACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGTGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGaa < 1:1183712/150‑1 (MQ=255) tACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGaa < 2:2328285/150‑1 (MQ=255) tACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGaa < 1:4764329/150‑1 (MQ=255) aCCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCCGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAg < 2:7653521/150‑1 (MQ=255) cccccGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAgg < 2:182711/150‑1 (MQ=255) ccccGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGc < 2:5574648/150‑1 (MQ=255) ccccGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGc > 2:6447818/1‑150 (MQ=255) ccccGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGc > 1:5847348/1‑150 (MQ=255) cccGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCa > 1:6116735/1‑150 (MQ=255) ggCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGACCGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGt < 2:258064/150‑1 (MQ=255) aaGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCgg < 2:5562260/150‑1 (MQ=255) aaGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCgg > 2:7030098/1‑150 (MQ=255) aGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCggg > 1:2680503/1‑150 (MQ=255) aGATCTGCAGGTCAACGCGAGGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCggg < 1:8942383/150‑1 (MQ=255) aTCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGgcg < 2:1248213/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGgcgcg > 2:5050082/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGgcgcgc > 1:838220/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGAGTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCGGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCGGGGGCCGCCCGTTCGAAGGCCTGGCGGgcgcgc > 2:5632137/1‑150 (MQ=255) tCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCAtc > 2:3945255/1‑150 (MQ=255) cAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCAtct > 2:5005513/1‑150 (MQ=255) aaCGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCAtctc > 1:6902949/1‑150 (MQ=255) aCGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCAACGAACGGCCTTGGGAAGACAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATctct > 1:5352743/1‑150 (MQ=255) cgcgATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCtt > 1:7850228/1‑150 (MQ=255) aTGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTcgcg < 1:3612987/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGtt > 1:2836958/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGtt < 1:2530263/150‑1 (MQ=255) gTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCg < 1:7390447/150‑1 (MQ=255) gTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCg < 1:4962359/150‑1 (MQ=255) ggggTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGgt < 1:9034366/150‑1 (MQ=255) cTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGgtgcagtgc < 1:6656520/150‑1 (MQ=255) tGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGgtgcagtgca > 2:7371513/1‑150 (MQ=255) tGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGgtgcagtgca > 1:36530/1‑150 (MQ=255) gATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTgcagc < 1:8307257/150‑1 (MQ=255) ttCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCAc > 1:7666840/1‑150 (MQ=255) cGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCt < 1:3216564/150‑1 (MQ=255) tGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTgg > 2:3136015/1‑150 (MQ=255) tGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGCTCGAAg > 2:3996516/1‑96 (MQ=255) aaTGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcg > 1:1488457/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcg > 1:6330811/1‑150 (MQ=255) tGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgcc < 2:2521949/150‑1 (MQ=255) gCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccg > 2:1529563/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccg > 1:7240566/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCCTGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccgc > 2:3864944/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccgc < 2:7796300/150‑1 (MQ=255) cTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccgc < 2:3019922/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCcgcg < 1:7449855/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCcgcg > 2:3118001/1‑150 (MQ=255) gAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGaa < 2:4500972/150‑1 (MQ=255) aGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAAc > 1:2286445/1‑150 (MQ=255) cACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACCCCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACgg < 2:4296589/150‑1 (MQ=255) cACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACgg < 2:2070376/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGgcca < 2:3450858/150‑1 (MQ=255) ccATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATgc > 2:4793749/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATgc > 2:2718367/1‑150 (MQ=255) ccATGGCAAATACGCCCGGATCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATgc < 1:4356038/150‑1 (MQ=255) gCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACg > 1:7104777/1‑150 (MQ=255) caaataCGCCCGGATCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATGCGCAcat > 1:5570857/6‑148 (MQ=255) gAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTa > 2:5003534/1‑150 (MQ=255) gAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTa > 1:869531/1‑150 (MQ=255) aataCGCCCGGATCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACATag < 2:8358807/147‑2 (MQ=255) aaaaCGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTaa < 1:1619660/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAg > 1:7498353/1‑150 (MQ=255) taCGCCCGGATCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACATAGGt < 1:6470832/149‑1 (MQ=255) aCGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGtt > 1:977296/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTc < 2:4771949/150‑1 (MQ=255) gCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTc > 2:7856871/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTc < 2:2778246/150‑1 (MQ=255) gCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTc > 2:3241412/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTc < 2:462782/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGt > 2:4128891/1‑150 (MQ=255) gggTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTaa < 1:3934188/150‑1 (MQ=255) gatCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACATAGGTTTCATagc > 2:6235215/3‑148 (MQ=255) cGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGa < 2:282845/150‑1 (MQ=255) ccTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACATAGGTTTCATAGCCAAGc > 1:1971787/1‑150 (MQ=255) ccTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGc > 1:4436321/1‑150 (MQ=255) tGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGcac > 2:759765/1‑150 (MQ=255) gacgacACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGcaca < 2:6116735/150‑1 (MQ=255) gacACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCt > 2:4906557/1‑150 (MQ=255) ccaccgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCgg < 2:2193458/150‑1 (MQ=255) caccgccactgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGc < 1:6291892/150‑1 (MQ=255) caccgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGc > 2:7159801/1‑150 (MQ=255) caccgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGc > 1:2026112/1‑150 (MQ=255) caccgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGc < 1:3054988/150‑1 (MQ=255) caccgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGc > 2:8553488/1‑150 (MQ=255) accgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGcc > 2:2941807/1‑150 (MQ=255) accgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGcc > 2:4950260/1‑150 (MQ=255) cgccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTg > 1:7146367/1‑150 (MQ=255) gccaccgAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTgc > 2:8263779/1‑150 (MQ=255) | TGGGCGGCGGTTGCCAGCGAGGCGGATACCCCCGGCAAGATCTGCAGGTCAACGCGATGCCAGGTGGGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAG > NC_002947/5494682‑5494980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |