Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,494,897 | G→C | 7.1% | C363W (TGC→TGG) ‡ | cobJ ← | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,494,897 | 0 | G | C | 7.1% | 1074.1 / 52.3 | 322 | C363W (TGC→TGG) ‡ | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (152/147); new base C (15/8); total (167/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
GGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCAGG > NC_002947/5494748‑5495044 | gggTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGgtg < 2:7507277/150‑1 (MQ=255) ttCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCAc > 1:7667100/1‑150 (MQ=255) tCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCAcc > 2:5872385/1‑150 (MQ=255) cGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCt < 2:2820084/150‑1 (MQ=255) cGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCt < 1:3216564/150‑1 (MQ=255) gTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTg < 1:1144919/150‑1 (MQ=255) tGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTgg > 2:1261307/1‑150 (MQ=255) tGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTgg > 2:3136015/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcg > 1:4915572/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcg > 1:6330811/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccg > 2:1529563/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccg > 1:7240566/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccgc < 2:3019922/150‑1 (MQ=255) cTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTcgccgc < 2:3332982/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCACCGCAGCGGCCCTGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCcgcg > 1:8819985/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCcgcg > 2:3118001/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCcgcg < 1:7449757/150‑1 (MQ=255) aGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAAc > 1:6227848/1‑150 (MQ=255) 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ccATGGCAAATACGCCCGGATCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCTGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATgc < 1:4356038/150‑1 (MQ=255) ccATGGCAAATACGCCCGGATCGCCTGACGATACCATCACCACATCACGGCCAGAAGCCGCGAGTTCAAATGCATGGCGTGCACGCTGCATTTCCTCGCGATTGTCGGTCATATGGATGATCTGGTCGTCCCGGAACGGGCCAGCCATgc < 2:2880757/150‑1 (MQ=255) cATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATgcg > 2:2768455/1‑150 (MQ=255) tGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCa < 2:4519620/150‑1 (MQ=255) gCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACg > 1:7104777/1‑150 (MQ=255) 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aTGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTc > 2:7008480/1‑150 (MQ=255) tGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTAGACCGCCGGCACCATCAGTTcc > 1:6194854/1‑150 (MQ=255) gcTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAg > 2:3913404/1‑150 (MQ=255) gcTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAg > 1:4256826/1‑150 (MQ=255) cTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAgg < 1:8208569/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGcc > 1:8499573/1‑150 (MQ=255) gcgGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGAt > 1:6371488/1‑150 (MQ=255) gcgGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGAt > 2:7275524/1‑150 (MQ=255) gcgGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGAt > 2:8261509/1‑150 (MQ=255) ggTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGa < 1:3118411/150‑1 (MQ=255) ttGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGAcc > 1:1490408/1‑150 (MQ=255) cGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCa < 2:681808/150‑1 (MQ=255) cGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCa < 1:2350336/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTTACCGAGCACTTCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCGTTGACCGCCGGCACCTTCAGTTCCGCCTCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCAg < 1:440260/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCAg < 2:632291/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCAg < 2:2286445/150‑1 (MQ=255) | GGGTCGCTGGATTCGTGCAATGCTTCGAGCACCGCAGCGGCCATGGCGAAAACGCCCGGGTCGCCTGACGACACCACCGCCACCGAACGGCCTTGGGCCGCCAGTTCGAAGGCATGTCGGGCGCGCTGCATCTCTTCGCGGTTGTCGGTGCAGTGCAGCACCTGGTCGCCGCGGAACGGGCCAGCCATGCGCACGTAAGTTTCGTAACCGAGCACATCTTCGGCCTGCGCAAGTTCGGCCTTGACCGCCGGCACCATCAGTTCCGCCGCACCAGGGCCAAGGCCGATGACCGCCAGG > NC_002947/5494748‑5495044 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |