Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,539,045 | G→C | 13.6% | intergenic (+52/+51) | nadE → / ← PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,539,045 | 0 | G | C | 13.6% | 455.5 / 38.8 | 175 | intergenic (+52/+51) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (66/83); new base C (13/12); total (79/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
CTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGAA > NC_002947/5538898‑5539194 | tGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGCAGACGCGGGTGAACCCACCGACg > 2:5447339/1‑150 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACCTCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGc < 2:547816/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGc < 1:6682951/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGCAAACGAGGGTGAACCCACCCACGCCTTcgc > 2:7941206/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:4864544/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:5903046/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:4752405/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:7589429/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:4351501/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:8769025/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:1391026/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:712816/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:712770/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:4675078/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:8682035/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:3312285/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:2237217/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTGGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:3487603/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCggg < 1:1185038/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAAACCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCggg > 2:3539560/1‑150 (MQ=255) cGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTg < 2:7387714/150‑1 (MQ=25) cGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGACCCCCCCAAAAGAGGGTTGAACCACCCCCCCAATCGCggggg > 1:2746584/1‑148 (MQ=255) ttGACCAGGCAGCGTTCGAGATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAc < 2:3154669/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGc < 2:189846/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCCCGAATACCAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAACCGcg > 2:8441706/1‑149 (MQ=255) gCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCCCCAATAAGAGGGTGTAACCACCCACCCCATAGCGGGTGGACACCCTccg > 1:692254/1‑149 (MQ=255) gCAGCGTTCGACATCAGCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCGTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTACACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCt < 2:8420325/150‑1 (MQ=255) cGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAACCCGCCCAAAAGAGGGTGAACCCACCCACGCATTCGCGGGTGAACCCCCGCcagcag > 1:6708695/1‑150 (MQ=255) gTTCGACATCATCGTCGCCACCTCCCGCAAGACCCCGCCCACGCGCGACCTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGGGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAgg < 2:6584078/150‑1 (MQ=255) gTTCGACATCATCGTCGCCACCTCCCGCAAGACCCCGCCAAGGGGCGAAGGGCCGTTCGGTCCTTTATAAGGGGCCTGCAGGCGGGGTTTCACCCGCGAATACGTGGTTGAACCCACCGACGATTTCGGGGTTGAACCCGCTCCTGCAgg < 2:1843483/150‑1 (MQ=255) gTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAACCCCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGTTTCACCGGCTAATACGTGGTTGAACCCACCGACGAATGCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAgg < 2:6442561/150‑1 (MQ=255) tgcGACATCTTCTTCGCCACCTCCCGCACGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCGTTATAAGTGGCCTGCAGGCGCGGGGTCACCCGCGAACCCGCGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGCGAACCCGCTCCTGCAggg < 2:5670546/148‑1 (MQ=255) atcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCCAATAAGAGGGTGAAACCACCCACGCAGTCGCGGGTGAACCCGCGCCGGCAGGGTTCGCCggc > 2:890507/1‑148 (MQ=255) gCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGCGGGGTTTCACCCGCTAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCtt < 2:3590984/150‑1 (MQ=255) cccTCCCGCAACACCCCGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGGGGCCTGCAGGAGCGGTTTCACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGa < 2:3470970/149‑1 (MQ=38) cacccGCAAGCCCCCGCACACGCGCCAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGGGGCCTGCAGGCGCGGGTTCACCGGCTAATACGTGGGTTAACCCACCGACGAATTGGCGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGAtt < 1:6595045/147‑1 (MQ=255) cTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGTGCGGGGTCACCCGCGCAAACGCGGGTGTACCCACCGACGCCATCGCGGGGGAACCCGCGCCGGGAGGGTTCGCCGTAAGCCATTGAtt > 2:2668481/1‑150 (MQ=255) cTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGTACCCACCGACGCAGTCGCGGGTGAACCCCCGCCTGCCGGGTTCGCCGTCAGCCGTTGAtt > 1:7531344/1‑150 (MQ=255) ccGCAAGACCCAGCAAACGCGCTAACTGCCGTGCGCTCCTTTATATGTGGCCGGCTGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACt < 1:6019357/150‑1 (MQ=38) cGCAAGACCCCGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt < 2:7422247/150‑1 (MQ=255) cAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGa < 2:6803746/150‑1 (MQ=255) cAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAAGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGGTTACGTGa > 2:6816512/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTGGGCCCGCGAATAAGAGGGGGTAACCACCCACCCCATCGCGGGTGAACCCCCGCCGGCAGGGGTGGCCGGCAGCCGTTGGTTACTTGGCGAt > 1:7563725/1‑150 (MQ=255) cccgCACACGCGCTAACTGCCGTGCGCTCCTTGATATGTGGCCTGCTGGAGCGGGTTCACCCGCTAATAGGTGGGTGAACCCACCGACGCTTTCGCGGTTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGa < 1:1316083/147‑1 (MQ=255) aGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGCATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCCGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACGTGACGATGAcc > 2:6069496/1‑150 (MQ=255) aggagcgAACGGCAGTTCGCGCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTTACGATGACCTTGcc > 2:5949331/5‑150 (MQ=38) cgcgcGAACTGCCGTTCGCTCCTGGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCt < 2:524293/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTGCGCTCCTTTATACGGGGCCTGCAGGAGCGGGTACACCCGCGATTACGAGGGTGAACCCACCGCCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTcatcat < 2:3849508/150‑1 (MQ=38) gTTCGCTCCTTGATATGTGGCCTGCAGGTGGGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTTAACCCACCGCCGCTTTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCgaga < 2:948958/150‑1 (MQ=255) ttCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAAAGAGGGTGAACCCCCCGACGCATTAGCGGGTGAACCCGCGACTGCAGGGTTCGCCGTCCGCCTTTGAGTACTTGACGGTGACCATTCCTTTCATCATCgagct > 2:5887024/1‑148 (MQ=255) ttCGCTCCTTGATAAGTGCCCTGCAGGAGCGTGTACACCCGCGAATACGTGGGTCAACCCACCGACGAATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCATTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAt < 2:1906342/150‑1 (MQ=38) cGCCCCTTTATATGTGGCCTGCAGGCGGGGGTACACCCGCTAATACTCGGGTGACCCCACCGCCGCTTGCGGGGGGCAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAtgt < 1:5540042/150‑1 (MQ=255) atggggCCTTCAGGCGGGGGTCCACCCGCTAACCCGTGGGTGACCCCCCCGCCGCTTTGGGGGGTTCCCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAg < 1:1913134/146‑1 (MQ=255) cgTGGCCTGCTGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAgg < 2:3983984/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTGGGGTTGCACCGGCGAATACGCGGGTCACCCCACCGACGCATTGGGGGGTCAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCag < 1:5017223/150‑1 (MQ=255) ggccggcgCGGGGTCCCCCGCGAAGCCGCGGGTGAACCCACCGCCGCATGCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCagaa < 2:7296033/143‑1 (MQ=255) gCAGGAGCGGGTTCACCCGCGACTACGAGGGTGAACCCACCTACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGTTGTGGCCCGTGAAGGTGCagaag < 2:8208449/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCGGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGc > 2:7070096/1‑150 (MQ=21) aGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCt < 2:3691294/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGTTGAACCCACCGACGAATTCGCGGGTGAACACGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACATTGCCTTTCATCATCGAGATTTGGCCAGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTg > 1:739543/1‑150 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa < 2:4347650/150‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTGGCCATTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAg < 2:7538176/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 2:5523497/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:6736379/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAATACGAGGGTGACCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcacc < 2:2884844/150‑1 (MQ=255) aCCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcacc > 1:4817453/1‑150 (MQ=255) cccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcacca > 1:4320331/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:5095699/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:2860671/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:2488770/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCAGTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:844908/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCCTCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:4568590/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 2:806702/1‑150 (MQ=255) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCg > 1:7708810/1‑150 (MQ=255) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCg > 2:611753/1‑150 (MQ=255) gAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGc > 1:5183869/1‑150 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc > 1:1934815/1‑150 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc > 1:2422468/1‑150 (MQ=255) caggcgggTCAACCCACCGCGGCTTCCGCGGGGCACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc < 1:3150322/145‑1 (MQ=255) gAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg > 2:5754963/1‑150 (MQ=255) ggTGAACCCACCGACGCATTCGCGGTTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCtt < 2:4301470/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGACGCGGTAGTCACCACCGGCTTCAAGCtt > 2:1586943/1‑150 (MQ=255) ctcaaCCCACCCACTAATGCGCGGGACAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTg < 1:2503261/147‑1 (MQ=255) gAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGa < 2:1377215/150‑1 (MQ=255) accccACCGACGCATTCGGGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 1:8883665/148‑1 (MQ=255) accccACCGACGCATGCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 1:8441706/148‑1 (MQ=255) aaCCCACCGACTCAGTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 2:175837/150‑1 (MQ=255) aCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt > 2:3421884/1‑64 (MQ=255) aCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAg > 2:213394/1‑150 (MQ=255) aCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAg > 2:4417787/1‑150 (MQ=255) aCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGGTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAg > 1:8184342/1‑150 (MQ=255) ccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtg > 1:9057034/1‑150 (MQ=255) cACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtgt > 1:2248629/1‑150 (MQ=255) cACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtgt > 1:2248482/1‑150 (MQ=255) ccGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCa > 2:5663507/1‑136 (MQ=255) ccGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCa < 1:5663507/136‑1 (MQ=255) cGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGa > 2:771954/1‑150 (MQ=255) cGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGa > 2:4644256/1‑150 (MQ=255) cGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGa > 2:3696200/1‑150 (MQ=255) gACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGaa < 2:7558496/150‑1 (MQ=255) | CTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGAA > NC_002947/5538898‑5539194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |