| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,726,259 | 0 | T | A | 12.3% | 397.0 / 6.8 | 165 | intergenic (‑183/+111) | PP_5024/opgH | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein/glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/95); new base A (19/4); total (64/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.15e-06 | |||||||||||
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Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TTATTGTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAA‑TGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAGG > NC_002947/5726110‑5726408 | ttATTGTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAA‑TGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCt < 1:1274215/150‑1 (MQ=255)ttATTGTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAA‑TGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCt < 1:4998339/150‑1 (MQ=255) tATTGTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAA‑TGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGTACCCCCTCCTa > 1:3410071/1‑150 (MQ=255) 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TTATTGTGTTGGCACGGCCGTACTGGCCGAAGCGTCGTATCGGAGAGGGATGCTAACGCATGGCGGCCCGTGGACCTAGAGCCGCAGGGGGACTTTGTTGGCCAAAA‑TGAGGGGGTTAGGCCAAAAAGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGGGCATGTGTATCCCTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGTCATGCGCCCCGTAGGGCGGGTTCATCGGGGCGCCGAACCGCCGCGAACAGACCCGATCAAGCGCCGACGAGGCTCGGTTGGCCTGCGTTTTCAGG > NC_002947/5726110‑5726408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |