| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,005,558 | C→A | 10.3% | L119L (CTG→CTT) | amaB ← | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,005,558 | 0 | C | A | 10.3% | 1250.6 / 98.9 | 390 | L119L (CTG→CTT) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (157/193); new base A (19/21); total (176/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 394 total aligned reads displayed.
GAGTTGCCGGCCACCAGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCG > NC_002947/6005409‑6005707 | ttGCCGGCCACCAGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGc < 2:5352064/150‑1 (MQ=255) cGGCCACCAGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCACCCGGGCCGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTGTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGAGGGTCAGGCCGTACAGCTGgc > 2:5415299/1‑150 (MQ=255) caccaGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGa < 1:4812703/150‑1 (MQ=255) accaGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGTGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGAc < 2:5742993/150‑1 (MQ=255) accaGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGAc > 2:5958855/1‑150 (MQ=255) accaGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGAc < 2:3749978/150‑1 (MQ=255) ccagggccagggCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACa < 1:1249986/150‑1 (MQ=255) ccagggccagggCGGTGTTCCAGGCACACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACa < 1:742236/150‑1 (MQ=255) cagggccagggcGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAg < 2:1151541/150‑1 (MQ=255) cagggccagggcGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAg > 2:3253230/1‑150 (MQ=255) gggccagggcGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGc < 1:6035982/150‑1 (MQ=255) gggccagggcGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGc < 1:7320139/150‑1 (MQ=255) ggcGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGc > 2:1475639/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGaa < 1:2950792/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGaa > 1:9007433/1‑150 (MQ=255) ccACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTc < 1:1767457/150‑1 (MQ=255) acacGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGa > 1:8309922/1‑150 (MQ=255) acacGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGa > 1:6615311/1‑150 (MQ=255) acGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATc < 1:3102167/150‑1 (MQ=255) acGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATc > 1:2812513/1‑150 (MQ=255) aaCCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTc < 2:4003555/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCa < 2:4294428/150‑1 (MQ=255) ggccgagATAACGCCGACAACGCCAAGCGGATGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAg < 2:2653588/144‑1 (MQ=255) ggCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAg < 2:6356385/150‑1 (MQ=255) gccgagATAACGCCGACAACGCCAAGCGGATGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAgg > 1:2078658/6‑150 (MQ=255) tGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCtt > 2:6920478/1‑150 (MQ=255) gATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTc > 1:7708379/1‑150 (MQ=255) gATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTc < 1:5354851/150‑1 (MQ=255) cACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCA‑CCAGGCCTTCCTgg < 2:3477789/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGACAACGCCAAGCGGATGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTccga > 1:6660977/2‑148 (MQ=255) aCGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg > 1:1094437/1‑150 (MQ=255) aCGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg < 1:5912877/150‑1 (MQ=255) aCGCCGACAACGCCAAGCGGATGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTccgaa < 2:1855763/150‑4 (MQ=255) aCGCCGACAACGCCAAGCGGATGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTccgaa < 1:8031704/150‑4 (MQ=255) cGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTggg > 1:8882580/1‑150 (MQ=255) gCCGACCACCCCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGt < 2:5312189/150‑1 (MQ=255) gCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGt < 1:8053321/150‑1 (MQ=255) gCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGt > 1:3414575/1‑150 (MQ=255) cGACCACCCCCCCCCGGAGCCAGCTTCCACGCATCTGGTGGCCCGCGCGCGCGCAACCGACGGCCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGCCCAACGGCGAAGCCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCACGCCTTCCTGGGTGa < 2:7397081/150‑1 (MQ=255) gACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGAAGGCCTGGGTGaa < 2:5880238/150‑2 (MQ=255) ccACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGaagt < 2:60652/150‑4 (MQ=255) cacaCCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCtt > 2:1758509/1‑150 (MQ=255) cacaCCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCtt > 1:5625327/1‑150 (MQ=255) cacCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGc < 1:7084077/150‑1 (MQ=255) cacCCAGCGGGTGCCAGGTGTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGAAGGCCTGGGTGaagtgca < 2:8462811/150‑7 (MQ=255) acCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGcc > 2:1128252/1‑150 (MQ=255) acCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGcc > 1:6215591/1‑150 (MQ=255) acCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGcc > 1:5535971/1‑150 (MQ=255) acCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGcc > 1:1593209/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGc > 1:2507337/1‑150 (MQ=255) ggTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcga > 2:4935825/1‑150 (MQ=255) atGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTtcgag > 2:2924064/2‑149 (MQ=255) tGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatc < 2:6226009/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatcga > 1:2648113/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatcga < 1:1003614/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatcga < 1:5284411/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCgag < 1:6447009/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCgag > 2:8225522/1‑150 (MQ=255) ggTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGAc < 1:199741/150‑1 (MQ=255) tCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGc < 1:9154522/150‑1 (MQ=255) aCGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGc < 2:7853110/128‑1 (MQ=255) gCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGc > 1:6385082/1‑150 (MQ=255) cATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGcc < 1:8781608/150‑1 (MQ=255) aTGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCg > 2:4509485/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGa < 2:4729787/150‑1 (MQ=255) gatggCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGt > 1:6915570/3‑150 (MQ=255) gtggCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTc > 2:646927/1‑150 (MQ=255) gtggCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTc < 2:3563532/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCt > 2:2317767/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCtt < 1:4512051/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCtt < 2:8836216/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCtt < 2:8572120/150‑1 (MQ=255) gggCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtg < 1:6299088/150‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtgt < 2:5591712/150‑1 (MQ=255) gcgtTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTtgga < 2:9111417/150‑3 (MQ=255) gcgcTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCATCGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtgtg < 2:678201/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtgtg < 2:6725279/150‑1 (MQ=255) tCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCa > 1:5674763/1‑150 (MQ=255) tCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCa > 1:3742500/1‑150 (MQ=255) tCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCa > 2:7257725/1‑150 (MQ=255) cGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCAc > 1:4982955/1‑150 (MQ=255) ggAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACg > 1:3665180/1‑150 (MQ=255) gAAGCGATGGTCAGGCCGTACATCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCCGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgc < 1:145353/150‑1 (MQ=255) aaGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgca > 1:3874319/1‑150 (MQ=255) aGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgcag < 1:4056642/150‑1 (MQ=255) aGCAATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgcag < 1:5159551/150‑1 (MQ=255) gCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgcagc > 1:6677209/1‑150 (MQ=255) gCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgcagc > 1:7500817/1‑150 (MQ=255) cGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATc < 2:5175517/95‑1 (MQ=255) gATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCAc > 1:4271283/1‑150 (MQ=255) gATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCAc > 2:4976909/1‑150 (MQ=255) tgaGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAgac > 2:8942859/3‑112 (MQ=255) cAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGcc < 1:5415299/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtgt > 1:6250146/1‑130 (MQ=255) gCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCGTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGaa > 1:2385608/1‑150 (MQ=255) gCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGaa > 1:8408330/1‑150 (MQ=255) gCCGTAACGCTGACGCGACCGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCGTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGCGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGag < 1:6564972/150‑2 (MQ=255) gTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAg > 2:2126623/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGAGCAg > 1:1910624/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGAGCAg > 2:2732252/1‑150 (MQ=255) | GAGTTGCCGGCCACCAGGGCCAGGGCGGTGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCG > NC_002947/6005409‑6005707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |