Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 542,789 | G→T | 6.6% | L342F (TTG→TTT) ‡ | rpoC → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 542,789 | 0 | G | T | 6.6% | 978.2 / 38.0 | 295 | L342F (TTG→TTT) ‡ | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (132/142); new base T (15/5); total (147/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.47e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
GCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTGGTCTGGCG > NC_002947/542641‑542936 | gcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACCTGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGc > 1:7396952/1‑150 (MQ=255) cAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACCTGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCt > 2:7362854/1‑150 (MQ=255) cAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCt < 2:4459899/150‑1 (MQ=255) cAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCt < 2:6480220/150‑1 (MQ=255) cAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCt > 1:2861161/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTtctc < 1:8667821/150‑1 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTc > 2:2637960/1‑150 (MQ=255) aCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCg < 1:895144/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGTATGTTGCAGGAAGCTTTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCAGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCAGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTAGTTTCCGTCAGAAAATTCTCGGt > 1:4776433/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTTCTCGGt > 1:2329849/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGt < 1:2468531/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGt > 2:7701217/1‑150 (MQ=255) aaGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAg < 1:8615305/150‑1 (MQ=255) aGCGTATGTTGCAGGAAGCTGTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTTCTCGGTAAGc < 1:8451096/150‑1 (MQ=255) cgcATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCgt > 1:5478175/1‑150 (MQ=255) gcATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCgtg > 2:2154837/1‑150 (MQ=255) gctgcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGa < 2:8468708/150‑1 (MQ=255) gctgcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGa < 1:5733535/150‑1 (MQ=255) 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gAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTcc < 1:3740221/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCgg < 1:7487038/150‑1 (MQ=255) gTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGt > 1:4915693/1‑150 (MQ=255) gTTGACGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTTCTCGGTAAGCGCGTCGACTATTCGGGTCGt > 2:2842571/1‑150 (MQ=255) ttGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGtt < 2:6137713/150‑1 (MQ=255) aCGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCgg > 2:3008415/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTTCTCGGTAAGCGCGTCGACTATTCGGGTCGTTCgg > 1:6946103/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTGTTCGATAACGGCCGTCGTGGCCGCGTCATCACCGGTGCTAACAAGCGTCCGCTGAAGTCGCTCTCCGACATGCTCAAGGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTTCTCGGTAAGCGCGTCGACTATTCGGGTCGTTCgg < 1:7373755/150‑1 (MQ=255) tctGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAAt < 1:3527932/150‑1 (MQ=255) tctGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAAt > 1:5183461/1‑150 (MQ=255) gctgGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTAc < 1:3403386/150‑1 (MQ=255) ctgGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGac < 2:8731225/126‑1 (MQ=255) ctgGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGac > 1:8731225/1‑126 (MQ=255) ctgGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTAcc > 1:5436415/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGt > 1:8870963/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCTGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCg > 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cTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCg < 1:3844629/150‑1 (MQ=255) tCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTg > 1:4867179/1‑150 (MQ=255) tCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTg > 1:985657/1‑150 (MQ=255) gAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGcc < 1:6617862/150‑1 (MQ=255) gAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTATGCACCAGTGCGGTCTGcc < 1:1297854/150‑1 (MQ=255) 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tCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGtt > 2:1453914/1‑139 (MQ=255) tCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCa > 2:35501/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCa > 1:3017193/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCa > 2:1960938/1‑150 (MQ=255) cAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCATTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATg < 2:2310581/124‑1 (MQ=255) aaaGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGt < 2:1903964/68‑1 (MQ=255) aaaGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGt > 1:1903964/1‑68 (MQ=255) aaGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCAttt > 2:7133194/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCAtttt > 1:7201100/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCAtttt < 2:4210155/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCAtttt < 1:1767348/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCAtttt > 2:2879137/1‑150 (MQ=255) ggTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTc < 1:955303/150‑1 (MQ=255) tAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCgg < 2:6450926/150‑1 (MQ=255) aGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCa > 2:8428191/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCaa > 1:3277255/1‑150 (MQ=255) aGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCt < 2:2460250/150‑1 (MQ=255) gTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTgg < 1:8494835/150‑1 (MQ=255) tCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGc < 1:6296004/150‑1 (MQ=255) tCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGc < 1:7315437/150‑1 (MQ=255) cGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGt < 2:4720184/150‑1 (MQ=255) gTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCCCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTg > 1:8133061/1‑150 (MQ=255) tCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTgg > 1:6885201/1‑150 (MQ=255) aaCTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTGGTCTg < 1:2627700/150‑1 (MQ=255) aCTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTGGTCTgg < 2:6883702/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTGGTCTGGc > 2:9161559/1‑150 (MQ=255) | GCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCGTAGGTCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAGATGGCCCTCGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTGGTCTGGCG > NC_002947/542641‑542936 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |