| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 1,114,900 | G→C | 7.7% | intergenic (‑89/+90) | rlmF ← / ← valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,114,900 | 0 | G | C | 7.7% | 724.9 / 38.0 | 223 | intergenic (‑89/+90) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (108/97); new base C (8/9); total (117/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTC > NC_002947/1114751‑1115049 | ggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACaggag < 2:4704752/150‑1 (MQ=255) aGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGt < 2:3403570/150‑1 (MQ=255) aGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGt < 2:7530499/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGgc < 2:6029062/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGgc < 1:336616/150‑1 (MQ=255) aGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑cc < 2:5450874/150‑1 (MQ=255) cGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCtt < 2:6304218/150‑1 (MQ=255) gACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTg < 1:2924693/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGaa < 2:6851142/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAg < 2:3358357/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAg > 2:4803512/1‑150 (MQ=255) ggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGtt < 1:1083335/150‑1 (MQ=255) ggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGtt < 1:6461540/150‑1 (MQ=255) ctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgcgcagcccttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTg > 1:6171523‑M1/106‑150 (MQ=255) ggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGgc < 2:7937823/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGgcg < 1:8455455/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCg < 2:7152491/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCg < 2:105041/150‑1 (MQ=255) agtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGG‑‑‑GTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCt > 1:2136822‑M1/99‑150 (MQ=255) gtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 2:5043050‑M1/98‑150 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 2:8056541‑M2/150‑6 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 1:6689921‑M2/1‑144 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 2:6596804‑M2/1‑144 (MQ=255) gggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtg > 2:3082558‑M2/1‑143 (MQ=255) aacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCtgtg > 2:8959290‑M1/93‑150 (MQ=255) ggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATCCGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgg > 2:3934212‑M2/1‑142 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 2:2884944‑M1/92‑150 (MQ=255) caggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTggg > 1:2722840‑M1/91‑150 (MQ=255) 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gCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtccggtgggag < 2:8524221‑M2/150‑12 (MQ=255) gccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGc > 2:4057411‑M1/88‑150 (MQ=255) cAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagc > 1:2868418‑M2/1‑138 (MQ=255) ggtgggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTg > 2:604369/1‑114 (MQ=255) gggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcctt > 2:9068870‑M2/1‑132 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:1679481‑M2/150‑21 (MQ=255) tttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtg < 2:3096936‑M2/150‑22 (MQ=255) tGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtc > 2:1793801‑M2/1‑127 (MQ=255) ttCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCATGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccgtgtgtcgc < 2:8978710‑M2/150‑26 (MQ=255) ggggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaa > 1:635581/1‑150 (MQ=255) ggggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGGCCTGTGGGAGCCGCCTTGTGTCGCGaa > 1:2672421/1‑150 (MQ=255) gggccctGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGACGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTTTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa < 1:3879698/144‑1 (MQ=255) gggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa < 2:2952123/150‑1 (MQ=255) gCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTa > 2:1648258/1‑150 (MQ=255) aGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAATGGCCGTACa > 1:5637064/1‑150 (MQ=255) aGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACa > 1:2276862/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCgg > 1:1383523/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGc < 2:2805979/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGcc > 1:2654927/1‑150 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 1:6058995/1‑150 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 1:6985469/1‑150 (MQ=255) cTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTGGCGACACACGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAAc < 1:7098452/150‑1 (MQ=255) tccgcgCGGTGGCTTGAAGACCCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGt < 2:2439633/145‑1 (MQ=255) gAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctc > 2:2172672/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc > 2:5599616/1‑150 (MQ=255) 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tGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTg < 1:2754380/150‑1 (MQ=255) GCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCGTGAAGGTTGGCGCCGGCCTGTGGGGGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACCGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGa < 1:3043121‑M1/150‑1 (MQ=255) GACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAg < 1:5948991‑M1/150‑1 (MQ=255) GACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAg < 2:6463684‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGtt < 1:8221382‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg > 1:5277277‑M1/1‑150 (MQ=255) ACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg > 1:9085853‑M1/1‑150 (MQ=255) ACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg < 1:4974354‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg > 2:2654927‑M1/1‑150 (MQ=255) ACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCGGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg < 1:3568934‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGc < 1:7335586‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGc < 1:8544600‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 1:2094066‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 1:6587345‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacc < 1:5568239‑M2/150‑117 (MQ=255) CCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGt < 2:5691588‑M1/150‑1 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcaccc < 1:4792292‑M2/150‑118 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcaccc < 1:6250829‑M2/150‑118 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCG‑CCGTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcgaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgcgcgtctagggctggacactgccatgaccccgaacaagcccaccctgcaccc < 2:3007073‑M2/150‑118 (MQ=255) CACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt < 2:7378018‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt < 1:1498114‑M1/150‑1 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg < 1:4884560‑M2/150‑119 (MQ=255) ACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTc < 2:1258444‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCg > 2:7636921‑M1/1‑150 (MQ=255) aggaggGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgcg < 1:7471371‑M2/150‑121 (MQ=255) GGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGa < 1:4383866‑M1/150‑1 (MQ=255) gggTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTc < 2:1679481/150‑1 (MQ=255) | GGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTC > NC_002947/1114751‑1115049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |