| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 1,114,917 | T→C | 7.4% | intergenic (‑106/+73) | rlmF ← / ← valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,114,917 | 0 | T | C | 7.4% | 687.5 / 30.1 | 232 | intergenic (‑106/+73) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (122/89); new base C (8/9); total (133/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.59e-01 | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTT > NC_002947/1114769‑1115066 | ggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGtt < 1:1083335/150‑1 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTg > 2:5575373/1‑150 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTg < 2:5266378/150‑1 (MQ=255) ggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGgc < 1:6234169/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGgcg < 1:8455455/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCg < 2:105041/150‑1 (MQ=255) gtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 2:5043050‑M1/98‑150 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 1:3627297‑M2/150‑6 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGCAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 2:4179861‑M2/150‑6 (MQ=255) gaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCtgt > 1:2919809‑M1/94‑150 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 1:6689921‑M2/1‑144 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 1:7819854‑M2/1‑144 (MQ=255) aacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCtgtg > 2:8959290‑M1/93‑150 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 2:2884944‑M1/92‑150 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 1:629337‑M1/92‑150 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 1:8599186‑M1/92‑150 (MQ=255) tGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtggga > 2:7488614‑M2/1‑140 (MQ=255) cAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagc > 1:6975035‑M2/1‑138 (MQ=255) ggtgggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc < 1:7739148‑M2/150‑16 (MQ=255) gggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcctt > 2:814651‑M2/1‑132 (MQ=255) gggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCtcctgtgggagcggcctt > 1:2699453‑M2/1‑132 (MQ=255) gggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCtcctgtgggagcggcctt > 1:6836159‑M2/1‑132 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:1679481‑M2/150‑21 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCtcctgtgggagcggccttgt > 1:6636697‑M2/1‑130 (MQ=255) tttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtg < 2:3096936‑M2/150‑22 (MQ=255) ggggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaa > 1:635581/1‑150 (MQ=255) gggccctGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGACGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTTTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa < 1:3879698/144‑1 (MQ=255) gggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaa > 2:2031539‑M2/1‑121 (MQ=255) tCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGAGCCGTGCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTAGCGAAAtgg > 1:2246644/1‑150 (MQ=255) gCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTa > 2:1648258/1‑150 (MQ=255) aGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAATGGCCGTACa > 1:5637064/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGc < 2:2805979/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCGCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGcc > 1:2655093/1‑150 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 2:9085853/1‑150 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 1:6058995/1‑150 (MQ=255) tataCGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACg > 2:7033177/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTa < 2:5056368/150‑1 (MQ=255) tGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGt < 2:2538259/150‑1 (MQ=255) gggCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGt < 2:7157233/149‑1 (MQ=255) gCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTTCAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGa > 2:8310902/1‑150 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt > 2:1408319/1‑150 (MQ=255) aGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCGCAGGAGGGTGGCG‑GCTGGTAGGGTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGGGTCGCGAAAGGGCCGTCCAGCGGCCCCACCGGTCGCTCGAGGGagtcccg > 2:9035697/1‑144 (MQ=37) gcaaaagggCTGCGCAGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAgcg > 1:1868010/7‑150 (MQ=38) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCGGTGGGAGCGGCCGGGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCGAGTGATTACAGCGCt > 2:290487/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGc > 2:8891729/1‑150 (MQ=255) aagggCTGCGCAGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGc > 1:4859970/3‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCGGGGGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGTGTGGGGCGTACGGCGGCCCCCGCGGTCTCTCTCGTGATTTCAGCGCGGCacgccg > 2:8626884/1‑145 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcg > 2:6042625/1‑150 (MQ=255) ctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgcg > 2:7112421/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCgcgc > 2:4418128/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgct > 1:653457/1‑150 (MQ=255) ccTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGGTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACCGCGGCCCCAACGGTCTCTCTCGTGATTACAGAGCTGCAATACGCGCATgctgct > 1:7809057/1‑150 (MQ=38) ctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTc < 2:4700298‑M1/145‑1 (MQ=255) 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CCGCTCCCACAGGACGGCGCCAACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGaa > 1:8298931‑M1/1‑140 (MQ=255) tCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgca < 1:7026483‑M2/150‑115 (MQ=255) CCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGt < 2:5691588‑M1/150‑1 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcgaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcaccc < 2:3007051‑M2/150‑118 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcaccc < 1:4792292‑M2/150‑118 (MQ=255) CACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTTTGGGATCGGCATTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt > 2:3051892‑M1/1‑150 (MQ=255) CACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt < 1:1498618‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCATGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt > 2:7952164‑M1/1‑150 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg < 1:4884560‑M2/150‑119 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg < 2:6765289‑M2/150‑119 (MQ=255) ACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTc < 2:1258444‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGAGGGTGGCG‑CCATGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTc < 1:2844381‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAGTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCg > 2:6561689‑M1/1‑150 (MQ=255) AGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCgg < 1:2324716‑M1/150‑1 (MQ=255) GGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGa < 1:4383866‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAc < 1:3940564‑M1/150‑1 (MQ=255) gggTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTc < 2:1679481/150‑1 (MQ=255) ggTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgcgca < 1:1376837‑M2/150‑126 (MQ=255) tGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGc > 2:363225/1‑150 (MQ=255) g‑cCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGc > 1:520047/1‑150 (MQ=255) g‑cCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGc > 2:1868902/1‑150 (MQ=255) g‑cCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGGGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGc > 2:7699640/1‑150 (MQ=255) ccTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgcgcaaccgccacca < 1:3275984‑M2/150‑133 (MQ=255) cTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCtt > 1:1408330/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTg > 2:5631354/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTg > 1:554764/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTg > 2:4778657/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTg > 1:2109583/1‑150 (MQ=255) aaGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGgcg < 1:8891729/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTa > 2:736304/1‑47 (MQ=255) gTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTa < 1:736304/47‑1 (MQ=255) ttGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGtt < 1:8056541/150‑1 (MQ=255) | GGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCG‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTT > NC_002947/1114769‑1115066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |