| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,348,789 | A→G | 48.6% | intergenic (‑249/+505) | galP‑I ← / ← PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,348,789 | 0 | A | G | 48.6% | 19.3 / 271.6 | 193 | intergenic (‑249/+505) | galP‑I/PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/61); new base G (46/47); total (83/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
AACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGTACGC > NC_002947/1348643‑1348937 | aaCGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTa > 1:7671674/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATg < 1:8811990/150‑1 (MQ=255) gcgcgGTAACCGGGCGCTTCGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATgg < 2:1358414/150‑1 (MQ=255) gcgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATgg < 1:7045217/150‑1 (MQ=255) ggTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGa < 2:8815721/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGAttatta < 1:6036504/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGAttatta < 1:7824131/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGAttatta < 1:1072663/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGAttatta > 2:184995/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGAttatta > 1:8349196/1‑150 (MQ=255) cgcTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCaa < 2:2575057/150‑1 (MQ=255) cTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAgg < 2:1365308/150‑1 (MQ=255) cTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAgg < 1:536589/150‑1 (MQ=255) cTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAgg < 2:8081913/150‑1 (MQ=255) gTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGaa < 1:1962920/150‑1 (MQ=255) gTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGaa > 2:2955088/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGaa > 2:9135407/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTGTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGaa > 2:761080/1‑150 (MQ=255) cggCACGCGTACGCCAGCCGGCCGGGGGACGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGAGGGGTGTCGACATGGGGTCGTCCACGGCGTGTTGTTTTTGTTATGTGGTGTCGTACAACTATGGGTGATTAGTAGCAAGGGGAAGATg < 2:7315550/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGc > 2:7520310/1‑150 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt > 1:9167967/1‑150 (MQ=255) aGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCt > 1:5680570/1‑150 (MQ=255) gCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGt < 2:7553324/150‑1 (MQ=255) gCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGt > 1:3929739/1‑150 (MQ=255) cGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTc < 1:2234448/150‑1 (MQ=255) tACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCaa < 1:5824633/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAAc < 2:255464/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACgg < 2:1894476/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACgg < 1:3066082/150‑1 (MQ=255) cgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGc < 2:1760481/150‑1 (MQ=255) cgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGc < 2:4563818/150‑1 (MQ=255) gcgCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 2:1267853/148‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 2:4998277/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt > 2:3698177/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt > 1:1720293/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGGGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 1:8105566/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGa < 2:2934178/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGa < 2:4715825/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGa > 1:7566377/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGAt < 1:4407720/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGAt > 1:6658296/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCt < 2:6854418/150‑1 (MQ=255) cGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAATGGCTGATAGCTg > 2:6217766/1‑150 (MQ=255) cGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTg < 2:5656336/150‑1 (MQ=255) gggggAAGCGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:9091955/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa > 1:2104878/1‑150 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 1:8321718/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:7042808/150‑1 (MQ=255) aaGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaat > 1:6372366/1‑150 (MQ=255) cgggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATaaa < 2:2150080/149‑1 (MQ=255) agGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATaaa < 2:651667/150‑1 (MQ=255) ggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGAt < 2:2007554/116‑1 (MQ=255) ggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAgg > 1:751141/1‑150 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 1:2659633/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 1:3497990/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 1:9047190/150‑1 (MQ=255) cAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAg > 1:1251261/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAgg < 2:3401568/150‑1 (MQ=255) aGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGAcc > 2:4025440/1‑150 (MQ=255) ggTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAGAGGTCCAAGGAccc < 1:4857627/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCa < 1:2821866/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCa < 1:4666118/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATc < 1:6527654/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc < 1:184995/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATcc > 2:8256166/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg < 2:15751/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg < 1:4147103/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg < 2:4626305/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCggg < 1:8673305/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCggg < 1:4228803/150‑1 (MQ=255) accGGGATGGGTGTCGACATGGGTTAGTCCACGGCTTGTTGTTATAGTTATGTGTTGTCGTACAACAATGGGAGATAAATAGCAAGGGGAAGATGGTATGTCAACGGATGATAGCTGAGAAATAAAGGACCAAGGACCCAAAATCCGGGc > 2:4276911/3‑150 (MQ=255) aGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGc > 2:1069167/1‑150 (MQ=255) aGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGc > 2:6400103/1‑150 (MQ=255) ggATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCa > 2:5827296/1‑150 (MQ=255) aTGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGa < 1:2388507/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGaa < 1:3260512/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAAc > 2:3452577/1‑97 (MQ=255) gtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCATAAGctct > 2:3063306/1‑150 (MQ=255) tCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTg > 1:51872/1‑150 (MQ=255) tCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCg > 1:2515326/1‑134 (MQ=255) gACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGcc < 1:8887440/150‑1 (MQ=255) aTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg < 1:4344974/150‑1 (MQ=255) aTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg < 2:4103477/150‑1 (MQ=255) aCGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAg > 2:5915544/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta > 1:5093613/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta > 2:6185228/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta > 2:8730137/1‑150 (MQ=255) tttttGTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGa > 1:2920767/1‑150 (MQ=255) gTTATGTGTTGTTGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTggg < 1:7150124/150‑1 (MQ=255) gTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTggg > 1:1580985/1‑150 (MQ=255) gTTATGTGTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTggg < 1:6212850/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGTCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGACTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGAACCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGctc > 1:2037252/1‑150 (MQ=255) tgtgTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 1:8947485/68‑1 (MQ=255) tgtgTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa > 2:8947485/1‑68 (MQ=255) tgttgtCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGTAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGAACCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCtctc > 2:3324210/1‑150 (MQ=255) tgttgtCGTACAGCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCtctc > 2:1678256/1‑150 (MQ=255) gggtCGTACACCTATGGGTGATTATGAGCAAGGGGCAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCACAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACGACGACGGGGGCTCTcgc < 2:7696745/148‑1 (MQ=255) tCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGcc < 1:8053149/150‑1 (MQ=255) tACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATCGCTGAGTAAGACAGGTCCAAGGCCCCACACTCCGGGCTGCAGAAGCTCGGCCGGGGCCTCGGTACAGACATTCTACGACTGGGGCGCTCGCGCCGtc > 2:5793959/1‑149 (MQ=255) aaCTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGTAcgc > 2:3875422/1‑150 (MQ=255) | AACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTCTCGCGCCGTACGC > NC_002947/1348643‑1348937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |