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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,458,126 | 0 | A | T | 10.1% | 833.5 / 67.1 | 276 | intergenic (+19/+21) | PP_1276/algA | hypothetical protein/mannose‑6‑phosphate isomerase/mannose‑1‑phosphate guanylyltransferase |
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Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
AACTCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGATCTCC > NC_002947/1457977‑1458273 | cTCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGc < 2:5206445/150‑1 (MQ=255) tCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGcc > 1:6858672/1‑150 (MQ=255) tCGAAAGGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGcc < 1:7271553/150‑1 (MQ=255) 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tgctgacTCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGCCTGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACt > 1:2064391/7‑150 (MQ=38) cAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGc < 1:8034148/150‑1 (MQ=255) cAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGAGGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGc > 2:126164/1‑150 (MQ=255) gacTCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCAc > 1:1859183/3‑150 (MQ=255) gCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCAcc < 1:9043394/150‑1 (MQ=255) tCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTc > 2:5420020/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTc > 1:7657188/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTc > 1:3626706/1‑136 (MQ=255) tCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTc > 1:695919/1‑150 (MQ=255) gCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCga < 2:6687427/150‑1 (MQ=255) ccccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCgat < 1:5944692/150‑1 (MQ=255) ccccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCgat < 1:7506112/150‑1 (MQ=255) ccccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCgat < 2:8768408/150‑1 (MQ=255) cccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCgatg > 2:4501536/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGAtc < 1:972295/150‑1 (MQ=255) tCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGATCTcc < 2:5827356/150‑1 (MQ=255) | AACTCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATTTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGATCTCC > NC_002947/1457977‑1458273 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |