| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,534,952 | 0 | C | A | 12.1% | 727.6 / 69.7 | 239 | intergenic (+101/‑82) | secA/argJ | protein translocase subunit SecA/glutamate N‑acetyltransferase/amino acid acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (122/88); new base A (15/14); total (137/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTT > NC_002947/1534805‑1535100 | gTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTtgt > 2:6509915/1‑150 (MQ=255) gTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTtgt < 2:4075822/150‑1 (MQ=255) ttCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTtgtg < 2:6311624/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cgcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACACCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCAGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTcc < 2:4828904/150‑1 (MQ=255) gcccGTTCATGGACGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTTGCGAAAGGGCCGCAAAGCGACCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTcc > 2:1476102/4‑150 (MQ=17) gcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCg > 2:5696453/1‑150 (MQ=255) tCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCggg < 2:2432538/150‑1 (MQ=255) tCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCggg > 1:8902618/1‑150 (MQ=255) aagTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGTGTGCGAAGGGGCCGCTGTTTCGGCATCAACGTTTTTTCAGGGAGCGCTCTAATGGCTGTGTGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCggg > 2:4196417/3‑150 (MQ=255) tCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGttt < 2:4576531/150‑1 (MQ=255) ccATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGtttt < 2:723909/150‑1 (MQ=255) cATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTg > 1:4069439/1‑150 (MQ=255) cATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTg > 2:2082206/1‑150 (MQ=255) cATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGAACCGGGtgcag < 2:8876317/150‑5 (MQ=255) cATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAAGGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTg < 1:1792110/150‑1 (MQ=255) tGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGaa < 1:1160593/150‑1 (MQ=255) tGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGaa > 2:230171/1‑150 (MQ=255) ggaCGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAAc > 1:6548851/3‑150 (MQ=39) gAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAAc > 2:2385009/1‑150 (MQ=255) gggCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCgg < 1:9136665/150‑1 (MQ=255) gcgcGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTa > 2:7974233/1‑150 (MQ=255) gcgcGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTa < 1:1443835/150‑1 (MQ=255) gcgATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATc > 1:1391600/1‑150 (MQ=255) | GTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTT > NC_002947/1534805‑1535100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |