Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,827,923 | G→T | R30S (CGT→AGT) | ptxS ← | 2‑ketogluconate utilization repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,827,923 | 0 | G | T | 98.3% | 1069.2 / 4.2 | 295 | R30S (CGT→AGT) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/1); new base T (121/169); total (125/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGC > NC_002947/3827776‑3828069 | cGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACtgg < 1:3934883/150‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga > 1:3151633/1‑150 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga > 2:2810671/1‑150 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga < 2:4447825/150‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCATGCCGAACAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGCTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGga < 1:4194970/150‑1 (MQ=255) ccaccaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGgaga < 1:3231316/150‑1 (MQ=255) caccaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGAc > 2:1218725/1‑150 (MQ=255) ccaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACgg < 1:4752408/150‑1 (MQ=255) ccaGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACgg < 2:514108/150‑1 (MQ=255) aGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTg < 2:768196/150‑1 (MQ=255) aGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTg > 1:3875376/1‑150 (MQ=255) aTGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCt > 1:806679/1‑150 (MQ=255) aTGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCt > 1:2505185/1‑150 (MQ=255) gCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTTGCttt > 1:4641510/1‑150 (MQ=255) gCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCttt > 1:3018576/1‑150 (MQ=255) gCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCttt < 2:3791161/150‑1 (MQ=255) ccGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCGGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTg < 1:1596614/150‑1 (MQ=255) cGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTgg > 2:619862/1‑150 (MQ=255) cGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTgg > 2:1421706/1‑150 (MQ=255) gATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGa < 1:3681909/150‑1 (MQ=255) tCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGaaa < 2:470936/150‑1 (MQ=255) cAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAAc < 2:4384521/150‑1 (MQ=255) gTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGc > 2:2854491/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGc < 1:4441390/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 2:1798742/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 2:4296765/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa < 2:3529057/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCa > 2:3592222/1‑147 (MQ=255) gTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCa > 2:1882947/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAac < 2:16830/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAac < 2:17176/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAacac > 1:4581814/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcg > 1:3291447/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcgc < 1:2493073/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAcgc > 1:5006663/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTg > 1:3578408/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGa > 2:2946199/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGAt < 1:5155646/150‑1 (MQ=255) gcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGAt < 1:2420738/150‑1 (MQ=255) gcgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGAt < 1:2639274/150‑1 (MQ=255) cgAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATg < 2:387145/150‑1 (MQ=255) aGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGt < 2:73167/150‑1 (MQ=255) aGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGt < 2:2067010/150‑1 (MQ=255) gCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTg < 1:920078/150‑1 (MQ=255) ccATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGa > 2:3486229/1‑150 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc > 1:5212867/1‑150 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc < 1:182565/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAc < 1:3390799/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAcc > 1:5370002/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGAcc > 1:2826117/1‑150 (MQ=255) ttGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTcg < 2:4240053/150‑1 (MQ=255) aTAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATg < 1:543070/150‑1 (MQ=255) tAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATgg < 1:313449/150‑1 (MQ=255) tAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATgg < 1:1062815/150‑1 (MQ=255) cgCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATggg < 1:244572/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGc < 2:1491581/150‑1 (MQ=255) gTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGt < 2:5229673/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATgg < 2:2335383/150‑1 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGTAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATggg > 2:5378742/1‑150 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATggg > 1:809774/1‑150 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATggg > 2:5066551/1‑150 (MQ=255) tctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGt > 1:2146740/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAAGTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTc > 2:3103848/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTACCTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCCCTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTCTGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTcc > 2:4646002/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCt < 1:4769451/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCtt < 2:2507096/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGGCCGTGGCTTCGTCCAGCATTTGGCGGTCGCCACCTATTTAACTGGAGACGGTGTCTTTGGAAACGCCAGCTACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTa < 1:55525/150‑1 (MQ=255) cGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTAt < 1:1520862/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGa < 2:3061527/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGa < 2:3943333/150‑1 (MQ=255) caattgctGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGAt > 1:2742927/8‑150 (MQ=255) tGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGAtt < 2:3151626/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGt < 2:1351848/150‑1 (MQ=255) gTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGtttt > 2:3047792/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTaa < 1:3663844/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAAt > 2:919839/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATa < 1:1132878/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATa < 1:1707778/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGt < 2:460483/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtga < 2:2146740/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGTGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgat > 1:126147/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgat < 2:2076714/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGATCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgat < 1:280695/150‑1 (MQ=255) cAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgatga > 2:1137212/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCg < 2:5017145/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGttt > 2:2697423/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGttt < 2:1299586/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGttt < 1:1961140/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCa < 2:3672591/150‑1 (MQ=255) gTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCaa < 2:4880117/150‑1 (MQ=255) gTCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCaa < 1:2280240/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAAt < 2:3969479/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAAt < 1:4936740/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCtata < 2:4758191/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATa < 1:4114603/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATa < 2:2400175/150‑1 (MQ=255) gCCACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATAc > 1:3979447/1‑150 (MQ=255) ccACCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCTCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACa < 2:5054641/150‑1 (MQ=255) aCCGATGTAACTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGc > 1:2855138/1‑150 (MQ=255) aaCTGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAg > 2:3245441/1‑78 (MQ=255) | CGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTTTAGGCCGCGAGCCATCTGGTTGGGGCGATAGCCGAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACACGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGC > NC_002947/3827776‑3828069 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |