| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,823,901 | +T | coding (1248/1293 nt) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,823,901 | 1 | . | T | 95.6% | 707.8 / 21.6 | 206 | coding (1248/1293 nt) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/8); new base T (88/109); total (89/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.08e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑A‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCC > NC_002947/3823766‑3824029 | cAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑a > 1:3833485/1‑136 (MQ=255) aGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑at > 1:3889430/1‑135 (MQ=255) ggTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atg < 1:243959/136‑3 (MQ=255) ggcACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atga < 1:1633493/134‑4 (MQ=255) gTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atga < 1:3795229/136‑4 (MQ=255) gTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atga < 2:3861971/136‑4 (MQ=255) cACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atgagg < 2:1699770/136‑6 (MQ=255) cACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atgagg < 1:2297313/136‑6 (MQ=255) cACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atgagg > 2:2945418/1‑131 (MQ=255) cTCGACGCTATCTTGCAGGCGTGCCATCTAGTCGTCGGACATGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCt < 2:1860960/136‑1 (MQ=255) cTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCt < 1:1024333/136‑1 (MQ=255) tCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTg > 2:4510161/1‑136 (MQ=255) cGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTgg < 1:168494/136‑1 (MQ=255) gACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑atga < 2:823028/128‑4 (MQ=255) gACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTggg > 1:1958539/1‑136 (MQ=255) cgcgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGaa < 2:2582598/136‑1 (MQ=255) cgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGt < 1:39788/136‑1 (MQ=255) gATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCt > 2:1829598/1‑128 (MQ=255) gATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTa > 1:2953485/1‑136 (MQ=255) ttGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 2:3916432/136‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 2:1114416/136‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 2:1091862/136‑1 (MQ=255) tGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAg > 2:2344208/1‑136 (MQ=255) tGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAg > 2:850516/1‑136 (MQ=255) cAGGCGTGCCATCTAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCTTGGCCAGAGGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAgcg < 2:3301720/136‑1 (MQ=255) gTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCg < 2:123252/136‑1 (MQ=255) gCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGt < 2:2845857/136‑1 (MQ=255) cATCAAGTCGTCGGACTGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCTT‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTaa < 2:3331711/136‑1 (MQ=255) cATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTaa > 1:4372602/1‑136 (MQ=255) cATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTaa > 1:941403/1‑136 (MQ=255) tCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAgc > 1:1176068/1‑136 (MQ=255) cAAGTCGTCGGACTGGCGTTTATACTGGACGATTCGCTTATTCATTGCAGTTTTCATAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAgcg < 2:3781408/136‑1 (MQ=255) aGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGcc < 1:1222420/136‑1 (MQ=255) gcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGc < 1:2133703/135‑1 (MQ=255) ggACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTATTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAg > 1:2913335/1‑136 (MQ=255) gACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGt < 1:2878613/136‑1 (MQ=255) gACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGt > 1:522207/1‑136 (MQ=255) gACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGt > 1:3439384/1‑136 (MQ=255) gACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCACGTATCCAAATCGTTCATGGCCAGACGCGAGCAATCGCGCTTAGCCCGGCCAA‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCCCTGCAGt > 1:558170/1‑136 (MQ=255) gCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCTAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCTT‑GAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTcagca < 1:3655198/136‑1 (MQ=255) tttATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCATAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCTT‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg < 2:3800695/136‑1 (MQ=255) ttaataCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCATGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGTTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg < 1:1833866/133‑1 (MQ=255) ataCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcac > 2:1618910/1‑136 (MQ=255) accggATGATTCGCTTCTTCATTGCTGGTTTCCAAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCTT‑GAGGTCTGGGATGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcacca < 2:792423/133‑1 (MQ=255) tggACGATTCGATTCTTCATTGCTGGTTTCCTAATGGTTCTTGGCCTGACGCTAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCTT‑GAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcaca < 2:4372602/135‑1 (MQ=255) ggACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGAGGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacac < 2:336400/136‑1 (MQ=255) ggACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacac < 1:3704578/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCTGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCTAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 1:2219498/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 1:2321726/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 2:3568145/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 1:850516/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 1:4606156/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt > 2:3144283/1‑136 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 1:4059634/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 1:3358344/136‑1 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCAAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTAACGCGCTTAGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGCGAAGTATTGAGAGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacacaa > 2:265220/1‑135 (MQ=255) aCGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCC‑AATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAtt > 1:3254124/1‑135 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑a > 2:290702/1‑71 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg < 2:3599559/124‑1 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCATCACACATGa > 1:1362824/1‑136 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 2:26177/134‑1 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt > 1:3328202/1‑134 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa > 1:3632528/1‑136 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa > 1:1387088/1‑136 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa > 1:2733925/1‑136 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa > 2:2876594/1‑136 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa > 1:725310/1‑136 (MQ=255) gATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGa > 1:576138/1‑136 (MQ=255) gCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 2:1678176/129‑1 (MQ=255) gCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAgg > 1:1996666/1‑136 (MQ=255) gCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAgg > 1:1650825/1‑136 (MQ=255) gCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAgg > 1:1707297/1‑136 (MQ=255) ttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg < 2:3499653/114‑1 (MQ=255) ttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg > 1:3499653/1‑114 (MQ=255) cggTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGCCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCgg < 2:13398/135‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGCCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCGGGCC‑ATGTGGTCTGGGAAGTTTTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCgg < 1:4558267/136‑1 (MQ=255) ttCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgccc > 2:2239365/1‑136 (MQ=255) tCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccg > 2:4700012/1‑136 (MQ=255) tCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccg > 2:3648099/1‑136 (MQ=255) aaTGTTTCATGGCCATACGCCACCTATCGAGATTTGCCCGGCA‑ATGAGGTCTGTGAAGTATTGAGCGCAGCGTTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGcccgcccg < 1:438491/136‑1 (MQ=255) aaTGGTTCCTGGCCAGCCGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCTT‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGAAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGcccgcccg < 2:4019358/136‑1 (MQ=255) aaTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCGGGCC‑ATGAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGcccgcccg < 2:2515/136‑1 (MQ=255) aaTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGTGCGGTGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGTACAGGTAAGAGGCGCCGGGcccgcccg < 2:562085/136‑1 (MQ=255) aaTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGcccgcccg < 1:1858771/136‑1 (MQ=255) aTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGt < 2:4198919/136‑1 (MQ=255) aTGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATCGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGt < 2:2446223/136‑1 (MQ=255) tCATGGCCCGACGCGAGCTAGCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCAACACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCTCCCGTAGccc < 2:3202712/136‑1 (MQ=255) tCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATGGCGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGccc < 1:4510161/136‑1 (MQ=255) aTGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCa < 1:2086087/136‑1 (MQ=255) aTGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCa > 1:2687480/1‑136 (MQ=255) gCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTg > 1:1466351/1‑136 (MQ=255) ccAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGa < 1:1277702/136‑1 (MQ=255) cgAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGcc < 2:19738/136‑1 (MQ=255) tATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca > 1:2714579/1‑136 (MQ=255) tATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca > 1:947182/1‑136 (MQ=255) tATCGCGCTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca > 2:911822/1‑136 (MQ=255) cgcTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCAc > 2:3783556/1‑136 (MQ=255) gcTTTGCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCAcc > 2:3971744/1‑135 (MQ=255) ttGCCCGGCC‑ATGTGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgc < 2:342006/136‑1 (MQ=255) gCCCGGCC‑ATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccg > 2:4140850/1‑136 (MQ=255) | CAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCC‑A‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCC > NC_002947/3823766‑3824029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |