| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3385530 | 55 (0.300) | 158 (0.870) | 65/264 | 0.3 | 84.7% | coding (501/546 nt) | PP_2985 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 4459341 | 2 (0.010) | coding (13/696 nt) | pcaI | 3‑oxoadipate CoA‑transferase subunit A | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
ACCTTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3385397‑3385530‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAG < NC_002947/4459341‑4459208 TTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTA > 1:1565170/1‑136 CAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTATTGAT > 1:105129/1‑136 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TCGGCATGACCCCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTG < 2:2494908/136‑1 TCGGCATGACCCCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTG > 1:1740928/1‑136 ACCCCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGA < 1:4045226/136‑1 CCCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATA < 2:4020567/136‑1 CCCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATA < 1:3901662/136‑1 CCCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATA < 1:2475081/136‑1 CCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGGGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAG > 1:1242475/1‑136 CCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGGGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAG < 2:1242475/136‑1 CCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAa > 1:548062/1‑135 CCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAG < 1:3206795/136‑1 CCTTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAG > 1:3139691/1‑136 ACCTTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3385397‑3385530‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTATTGATCAAGGCGAGCTCCTGGTTGTTCCTGGAGTTGTGGTTGTCGGGCTGGCCGGAGCGCGTGAAGCGATGGGGCCTGTCAGCACTTGAAATGGCTTGCTGACTTTCGCTATAGCGTGCCGCAAGATAG < NC_002947/4459341‑4459208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |