| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,229,253 | 1 | . | T | 6.2% | 606.7 / 33.5 | 144 | coding (1776/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (75/60); new base T (4/5); total (79/65) | |||||||||||
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Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
CTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGATGTCGG > NC_002947/5229104‑5229401 | tGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑g > 1:3335711/1‑150 (MQ=255) gTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑ga < 2:17823/150‑1 (MQ=255) tAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag < 2:2598552/150‑1 (MQ=255) tAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag > 2:1666133/1‑150 (MQ=255) tAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag < 1:5002143/150‑1 (MQ=255) ccGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAAGGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTC‑GGTGGCACCTgaggagg < 2:2873946/150‑2 (MQ=255) tctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGa < 1:4549454/150‑1 (MQ=255) tctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTCGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGa > 2:2490671/1‑150 (MQ=255) gCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCAc > 2:4908038/1‑150 (MQ=255) gCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCAc > 2:3757182/1‑150 (MQ=255) ttGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGa > 1:1215283/1‑150 (MQ=255) ttGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGa > 1:1215277/1‑150 (MQ=255) gtgACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGAGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGAcc > 2:3803523/1‑149 (MQ=255) gCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCg < 1:3388012/150‑1 (MQ=255) gCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCg < 1:3937371/150‑1 (MQ=255) gTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGt < 1:3520530/150‑1 (MQ=255) cGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGgcgc < 1:5026246/150‑1 (MQ=255) cGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGgcgc < 1:5027508/150‑1 (MQ=255) 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gactcctc‑GGTGGCACCTGAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGcc > 1:767955/3‑150 (MQ=255) ctcctcTGGGGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTg < 1:3133562/150‑1 (MQ=255) ctcctcAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTg > 1:2482539/1‑150 (MQ=255) tcctcggTGGCACCTGAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTgg > 2:1223920/6‑150 (MQ=255) aGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACt > 1:1933030/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACt > 2:3125364/1‑150 (MQ=255) ggTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTg < 1:2923371/150‑1 (MQ=255) gTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGa > 2:1643844/1‑150 (MQ=255) aCC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGATGTCg < 2:1572748/150‑1 (MQ=255) aCC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGATGTCg > 1:4581284/1‑150 (MQ=255) cc‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGATGTCgg < 2:1196577/150‑1 (MQ=255) cc‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGAGGTCgg > 1:4940543/1‑150 (MQ=255) | CTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCATAGAACGAGAGCTGGTCGTCGACTTTGTAAACGATACCGGCGTGAGGTACCCAGGCCTGGCCACTGATGTCGG > NC_002947/5229104‑5229401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |