New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2297824 | 72 (0.470) | 4 (0.030) | 3/248 | NT | 5.5% | intergenic (+105/+28) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | = 2959037 | 74 (0.540) | intergenic (+27/‑169) | PP_2588/PP_2589 | class III aminotransferase/aldehyde dehydrogenase family protein |
GCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2297751‑2297824 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcccgctcccacaG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCGGCCCAGGGT < NC_002947/2959037‑2958891 GCACGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATCCACCGTGTCGCCTGATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTC > 2:2411012/1‑150 GCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATCCACCGTGTCGCCTGATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGAGGGAGTGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTC > 1:196156/1‑150 CCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATCCACCGTGTCGCCTGATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCC > 1:1968303/1‑150 CCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATCCACCGTGTCGCCTGATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCC > 1:4574020/1‑150 TGCCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATC < 2:1020638/150‑1 GCCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCC < 1:2182225/150‑1 GCCCGCTCCCACAG‑GGAAGCCCGTAGCCCAAGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGCTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCACCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCC > 2:1483474/1‑150 CCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCATGGCCCCGGCCTTGATCgccaa < 1:3687956/150‑6 CCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCATGGCCCCGGCCTTGATCgccaa < 1:3687961/150‑6 CCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCG > 1:4733354/1‑150 CCCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGAGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCG > 1:4081659/1‑150 CCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCGG > 1:366104/1‑150 CCGCTCCCACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCGG > 2:4494215/1‑150 ACAG‑TGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGAGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCGGCCCAGGGT > 2:1002236/1‑150 ACAG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCGGCCCAGGGT > 1:4220336/1‑150 GCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2297751‑2297824 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcccgctcccacaG‑GGAAGCGCGTTGCCCTTGTCAGCGGCTTACAGCTTGCCGACCAGCCGCGCCGTGCGGTCTACGGCTATCCGGGTCTTCTCCACCAGCTCATCCAGCTCGCTGTGGTTGGCGATCAAGGCCGGGGCCATGATCATCCGGCCCAGGGT < NC_002947/2959037‑2958891 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |