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Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
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gTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGa > 2:5015445/1‑150 (MQ=255) tAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGGATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGaa < 2:3601500/150‑1 (MQ=255) tAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGaa < 1:3862265/150‑1 (MQ=255) tAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGaa < 1:202678/150‑1 (MQ=255) tAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGaa < 1:4458126/150‑1 (MQ=255) ggggTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGt > 1:146648/1‑150 (MQ=255) gggTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGtt > 2:1455606/1‑150 (MQ=255) tttGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAAc < 2:2150475/150‑1 (MQ=255) tttGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAAc < 1:1828637/150‑1 (MQ=255) tttGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAAc < 2:3269872/150‑1 (MQ=255) tGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGAGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAACGa > 1:4166994/1‑150 (MQ=255) | TTGGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTGCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGAGAGATCGAAGCGAGTTAAGTGTCTGAAGTTAAACGA > NC_002947/176257‑176547 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |