New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 235331 = | 106 (0.700) | 13 (0.100) | 13/244 | NT | 13.2% | intergenic (+28/+97) | PP_0183/argH | glutathione S‑transferase/argininosuccinate lyase |
? | NC_002947 | 235390 = | 77 (0.570) | intergenic (+87/+38) | PP_0183/argH | glutathione S‑transferase/argininosuccinate lyase |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CCCGCAGGCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAACGACGGCAGCACGCACCTGCG > NC_002947/235183‑235480 | cccGCAGGCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGc > 1:3591681/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGccc < 1:3005763/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCg > 2:107302/1‑150 (MQ=255) 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gCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa < 1:3230114/150‑4 (MQ=255) gCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa < 1:3230317/150‑4 (MQ=255) gCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa < 2:662678/150‑4 (MQ=255) gCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGcgaa < 1:1390139/150‑4 (MQ=255) gCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 2:710547/150‑1 (MQ=255) 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ccGGCCTTCAGGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGGCCCGTTGTTGAAACTTGTGCCTTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGccc > 1:3145982/1‑150 (MQ=39) ccTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑GGCACCGTTTTTGAACCTTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGc < 2:2205776/150‑1 (MQ=255) tGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCTTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTggg < 2:1273008/150‑1 (MQ=255) ggAGTTGATCCACAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGCGCCCTTCGCGGGAATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCTTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTgggg < 1:3634809/150‑1 (MQ=39) gagaTGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCCCAGGG‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTggggg < 2:1549081/150‑1 (MQ=255) gatCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAg < 2:2436147/150‑1 (MQ=255) atCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGc < 2:4504550/150‑1 (MQ=255) tCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCg > 2:3302882/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCga < 2:3249017/150‑1 (MQ=255) ttgccgcTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCCAc > 1:4801913/5‑150 (MQ=255) 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tGAGCCCTCCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCCGGT‑C‑TGCACCGTTTTTTAAACTTGTGCATTCCCTGTGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCacgaacga < 1:514017/150‑1 (MQ=255) gAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAacgac > 2:3575222/1‑150 (MQ=255) gAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAacgac > 2:831492/1‑150 (MQ=255) gAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCGTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAacgac > 2:3575231/1‑150 (MQ=255) tcgttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGT‑AATGCACAAGTTTCAAAAACGGTGCAG‑ACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAACGACGgc < 1:5007963‑M1/136‑1 (MQ=255) 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aTGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAACGACGGCAGCACGCACCTg > 2:2757885/1‑150 (MQ=255) GCCCGCTCCCACAGGT‑AATGCACAAGTTTCAAAAACGGTGCAG‑ACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAACGACGGCAGCACGCACCTgcg < 2:4513348‑M1/150‑1 (MQ=255) | CCCGCAGGCCAAGGCGTTGCTGCAACTGATGGGGGAGAACCCGCACATGCCGCGGATCTTGGCGGACAAGGAAGCGTCGATGCCGGCCTTCATGGAGATGATCCGCAGCGGCAAGCGCTGAGTCTGGTGTTGAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGT‑C‑TGCACCGTTTTTGAAACTTGTGCATTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGAGGGCGAAGCCCTCGCCTTGGGGGATTAGCGAGACGCCAACAGGGCCTTGCCACGAACGACGGCAGCACGCACCTGCG > NC_002947/235183‑235480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |