New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
ATATCGCCGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGC > NC_002947/1748582‑1748880 | ggcagctccggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccg < 1:114183‑M1/1‑1 (MQ=255) tatCGCCGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGa < 2:815533/150‑1 (MQ=255) agctccggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccGAtt > 2:2936177‑M1/147‑150 (MQ=255) gctccggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccGAttt < 1:3132920‑M1/5‑1 (MQ=255) gctccggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccGAttt > 1:3489982‑M1/146‑150 (MQ=255) gCCGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTc < 1:2535264/150‑1 (MQ=255) ctccggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccGATTTc > 2:5082451‑M1/145‑150 (MQ=255) cGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTccc < 1:5019092/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCt > 2:4822900/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCt < 2:1397486/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTg < 1:4196545/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTgg < 1:1200755/150‑1 (MQ=255) ggcgACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCt < 2:1483189/150‑1 (MQ=255) 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gAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTcca > 2:3690132/1‑150 (MQ=255) aaCAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTccac > 1:691715/1‑150 (MQ=255) cAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTccacca < 2:3488960/150‑1 (MQ=255) cAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTccacca < 1:917602/150‑1 (MQ=255) tCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTc < 2:1131554/150‑1 (MQ=255) tCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTc > 2:1589584/1‑150 (MQ=255) cAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCaa > 1:4481022/1‑150 (MQ=255) cAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCaa > 2:3037391/1‑150 (MQ=255) aGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATc < 2:3138341/150‑1 (MQ=255) aGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATc < 2:1388163/150‑1 (MQ=255) aGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATc > 2:3175858/1‑150 (MQ=255) aTGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGcc > 2:4299168/1‑150 (MQ=255) aTGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGcc < 1:853751/150‑1 (MQ=255) ggggTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGgccagcca < 2:4051931/56‑1 (MQ=255) ggggTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGgccagcca > 1:4051931/1‑56 (MQ=255) ggTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGAt < 2:883513/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGAtt < 2:2133451/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGAtt < 2:935418/150‑1 (MQ=255) cTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCg > 2:5057231/1‑150 (MQ=255) tCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCgg > 2:3048722/1‑150 (MQ=255) gTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCtggt > 2:4452268/1‑150 (MQ=255) gTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCtggt > 2:4825938/1‑150 (MQ=255) gTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATGAACTCGGCGCCtggt > 2:183079/1‑150 (MQ=255) tGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCtggtgg > 1:1491384/1‑150 (MQ=255) GATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGc < 2:1861324‑M1/150‑1 (MQ=255) GATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGc < 1:1972037‑M1/150‑1 (MQ=255) | ATATCGCCGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCACCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGATTTCCC‑GTCTGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGTGGC > NC_002947/1748582‑1748880 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |