| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 2057943 | 87 (0.570) | 8 (0.060) | 4/244 | NT | 9.9% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 2058017 | 68 (0.510) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGC > NC_002947/2057795‑2058091 | gCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCATGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTa > 1:1422407/1‑150 (MQ=255) cATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa > 1:4773034/1‑150 (MQ=255) cATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa > 1:4773042/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:4841698/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1049593/150‑1 (MQ=255) tGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:891548/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:2326567/150‑1 (MQ=255) cACGCCGAGTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTttacccgcgaa < 2:2362103‑M1/150‑12 (MQ=255) aCGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 2:4000534/1‑150 (MQ=255) cGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:2151582/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGAGGCGATGTTGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCATCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg < 1:2942299/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg < 2:1186298/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGTTCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 1:2957492/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 2:4107643/150‑1 (MQ=255) ggCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCa < 1:2098011/150‑1 (MQ=255) cGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACt < 1:371324/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAg < 2:1464134/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAg < 2:4664865/150‑1 (MQ=255) aTTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTg < 1:953442/150‑1 (MQ=255) aTTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTg < 1:3525240/150‑1 (MQ=255) cGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGt < 2:4060754/150‑1 (MQ=255) cGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGt < 2:4603963/150‑1 (MQ=255) cGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGt < 2:2484307/150‑1 (MQ=255) 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tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAgg < 2:2374001/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAgg < 1:3029471/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAgg < 1:927868/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAgg < 1:2066167/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAgg < 2:719671/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCGGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAgg < 2:3583224/150‑1 (MQ=255) gACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGt < 2:72996/150‑1 (MQ=255) accaccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTg > 2:2118389/1‑150 (MQ=255) cccccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGa < 2:4189399/147‑1 (MQ=255) caccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGAAAATGGGATATCACTGC‑CCACAGGTGCAGTGACACGGTGaa > 1:3204954/1‑150 (MQ=255) 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ccTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatgtcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcac > 2:1308398‑M1/1‑13 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAggg < 2:4778253/63‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat > 1:3126741‑M1/1‑11 (MQ=255) tctTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacat > 1:3126692‑M1/1‑11 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg > 2:4706134‑M1/1‑9 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg < 2:3707092‑M1/150‑142 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCt > 1:119228/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagtt < 1:2532154‑M1/105‑99 (MQ=255) gggTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcatt > 2:1205035‑M1/1‑4 (MQ=255) gggTAACCCCCCTCCTCCTTGGGGATATCACGGC‑CCTCCGTTGCAGTGACAGGGTTAATGCGGGTTCGGTGCGGTTACCCCCGCTAATAGCCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTCCTGGCGCCTGTCCa < 2:3600359/150‑1 (MQ=255) ggTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcggcattc > 1:4841698‑M1/1‑3 (MQ=255) 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gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc > 1:4425264/1‑150 (MQ=255) | GCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGC‑CCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGC > NC_002947/2057795‑2058091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |