| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 3524681 | 100 (0.660) | 5 (0.040) | 5/246 | NT | 5.0% | intergenic (+503/‑194) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
| ? | NC_002947 | = 3524738 | 99 (0.730) | intergenic (+560/‑137) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACC > NC_002947/3524533‑3524827 | nccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCg > 1:4930596/2‑150 (MQ=255)cccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCg > 2:4853450/1‑150 (MQ=255) cGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGtt > 1:4076569/1‑150 (MQ=255) 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ccaGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAg > 2:464891/1‑150 (MQ=255) aTGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCa > 1:2960275/1‑150 (MQ=255) cAAAGTGCTGGCCCAGGCCCTTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCTTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc < 1:4369741/150‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAccc > 2:2338493/1‑150 (MQ=255) aaGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAccc < 1:558242/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCCAGGCCCTTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCca < 2:1801990/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCcac < 2:2054968/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCcaca < 1:2909854/150‑1 (MQ=255) ccaggcccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctc > 2:2186622‑M1/1‑13 (MQ=255) ccaggcccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgcccta > 2:2186735‑M1/1‑13 (MQ=255) ccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgcccta < 1:4475362‑M2/150‑81 (MQ=255) ccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc > 1:4764504/1‑138 (MQ=255) ccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc < 2:4764504/138‑1 (MQ=255) ccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCaaa < 2:297562/150‑1 (MQ=255) ccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCaaa < 1:2396034/150‑1 (MQ=255) caggcccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctac < 1:790788‑M1/150‑139 (MQ=255) aggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAgc > 2:4987961/1‑150 (MQ=255) cccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctca > 2:1217839‑M1/1‑8 (MQ=255) ccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctcac > 1:4226821‑M1/1‑7 (MQ=255) ccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctcac > 1:1647040‑M1/1‑7 (MQ=255) aTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctcaccg < 1:4267803‑M2/150‑89 (MQ=255) tGGCGTTCAGCAAGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGACGATGCCATGGGCATGGGCATGATCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTAcc > 2:853862/1‑150 (MQ=255) | CCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACC > NC_002947/3524533‑3524827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |