| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4161049 = | 94 (0.620) | 17 (0.130) | 6/244 | NT | 18.2% | intergenic (+31/‑178) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4161109 = | 70 (0.520) | intergenic (+91/‑118) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAG > NC_002947/4160900‑4161197 | cggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtga < 2:4004399‑M1/1‑1 (MQ=255) ggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctatgtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagagcgagctgcctgcttcgcgggtgaa < 2:4290565‑M1/2‑1 (MQ=255) ggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgaa > 1:2982136‑M1/149‑150 (MQ=255) ggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgaa < 2:4290701‑M1/2‑1 (MQ=255) gatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAAc > 1:4092767‑M1/148‑150 (MQ=255) gatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAAc < 1:3174919‑M1/3‑1 (MQ=255) cattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGc > 1:2005940‑M1/144‑150 (MQ=255) ttgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTc < 1:616595‑M1/9‑1 (MQ=255) ttgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTc > 2:3546460‑M1/142‑150 (MQ=255) aGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:2947527/1‑150 (MQ=255) ttCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:17877/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:2091447/150‑1 (MQ=255) tgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTAc < 1:3760562‑M1/13‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGTCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 2:3441/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 1:3172915/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 1:10144/150‑1 (MQ=255) catggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAgg > 2:3843363‑M1/135‑150 (MQ=255) ccAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggt < 2:3199067/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggt < 2:524737/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGCGTCGCGGGGAAAACCCCACCAACAggtgggt > 2:1408416/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggtgggt < 2:4610838/150‑1 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGccc < 2:4892726/150‑1 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGccc < 2:713084/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑t < 1:4047885/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑t < 1:2839650/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGaa < 2:3863405/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGaa < 1:3191565/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGaa < 2:2452113/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGaa < 1:3043724/150‑1 (MQ=255) ggCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGc < 1:3672891/150‑1 (MQ=255) ggCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGc < 1:1529711/150‑1 (MQ=255) gCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCa < 1:2947527/150‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCaa < 2:2061647/150‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCaa < 1:4397577/150‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCaa < 2:4014242/150‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCaa < 2:4840940/150‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCaa < 2:4014474/150‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCaa < 2:4014421/150‑1 (MQ=255) gtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGccc > 2:3529076‑M1/106‑150 (MQ=255) ggTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGccc < 1:447412/150‑1 (MQ=255) gTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGGTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCGGCGTCGCCGGGAAACCCCCGCCCACCCGGGGGGGCGGCCC‑CGCAGACCGCCAGCcccc > 2:3174919/1‑150 (MQ=255) cGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGt < 2:1838454/150‑1 (MQ=255) ggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagtcggctgcttcgcgggtaAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa > 2:227847‑M1/101‑150 (MQ=255) ggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa > 1:821869‑M1/101‑150 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa < 2:3172915/150‑1 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa < 1:1268132/150‑1 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTACCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa < 1:4273302/150‑1 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCGTCGCGGGTAAACCCCCACCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa > 2:5082279/1‑150 (MQ=255) gtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg > 2:537089‑M1/100‑150 (MQ=255) gtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaacctggagaccgagtcggctgcttcgcgggtaAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg > 1:3501496‑M1/100‑150 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg < 2:181149/150‑1 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg < 1:443091/150‑1 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg < 1:2569323/150‑1 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:1690002‑M1/98‑150 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:2352264‑M1/98‑150 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtaAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:47010‑M1/98‑150 (MQ=255) aaaacatccttctgtgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:1887495‑M1/98‑150 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGc < 2:2628410/150‑1 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCATAGCGGGTAAAACCCCTCCAAAAGGTTGGTGGTGCCC‑AGAAGACGGCAAGGCCCCGGTAGGatc > 2:3400913/1‑148 (MQ=255) aacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGc > 2:3693511‑M1/96‑150 (MQ=255) cAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCCGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCg < 1:2256085/150‑1 (MQ=255) catccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtgAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 1:559161‑M1/94‑150 (MQ=255) catccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtaAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 2:701191‑M1/94‑150 (MQ=255) 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ttACCCTGGGGGGGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCACGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCa < 1:296538/150‑1 (MQ=255) tGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGTGGTTCGCGGGTAAAACCGCACCGAAAGGTGGGGGGGGCCC‑GGATGAAGGCGAGGCCCCGGGAGGTGGGGGTTGACCCCCGCCGCAGGCCCCGCGGTCTCAAGGgtt > 2:1137861/1‑150 (MQ=255) ggggggTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGttt < 1:5007219/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCGGCGTAGCGGGGAAACCCCCCCCCACACGGGGGGGGTGCCC‑CGCAGACCGCCACCCCCCCGGAGGAGCCGGGTCACCCCCCCAGCAGGCCCCTCCGGCACAAGGtttttaa > 2:4513331/1‑148 (MQ=255) tGCAGCAGCTGTGGGGCTGACTGGAGCCCGAGGCGGCGGCTCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTcaca < 2:4791776/150‑1 (MQ=255) aaGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGGTTGGCCGGGAAAACCCCACCTAAATGTGGGGGCTGCCC‑CGAAGACGGCAAGGCCCCCGTAGTGGCGGGGTCAAACCCCAAGCAGGCCGCTCGGTGTCGAAGGTTTTGACAGcccc > 2:3502879/1‑150 (MQ=255) ggAGTCGGTTTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACTGTTGGGTGGTGCCC‑TTATGACGGCACGGCCCATTTAGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTtctc < 1:2297839/149‑1 (MQ=255) gAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCGACAGGTGGGTGGGGCCC‑AGAAGACGGCCACGCCCCGGGAGGAGCGGGGTCACCCCCCCACCACGCAGCACCGTCGCAAGGTTTTTAACAGCCCCCCCCGGTGCCGTCCCCAATTGTCg > 2:361701/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACAGTTCTCGGTAtg > 2:3263182/1‑150 (MQ=255) ctgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggt > 2:5034137/1‑150 (MQ=255) 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tAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaa < 1:2059994/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaag > 1:429686/1‑150 (MQ=255) | GCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCC‑TGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAG > NC_002947/4160900‑4161197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |