New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGA > NC_002947/5515063‑5515355 | tGACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCG > 1:5007278‑M1/1‑150 (MQ=255) gACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGC < 2:4791639‑M1/150‑1 (MQ=255) cttgcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgcct < 1:3829336‑M1/4‑1 (MQ=255) 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cagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTttacccgcgaa > 2:1293829‑M2/1‑139 (MQ=255) tactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAaga > 2:4462726‑M1/56‑150 (MQ=255) gATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaaga < 1:1485289‑M1/150‑70 (MQ=255) gATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaaga < 1:1485326‑M1/150‑70 (MQ=255) aTGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTttacccgcgaagag > 2:5064829‑M2/1‑136 (MQ=255) gAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggc < 2:1752166‑M1/150‑73 (MQ=255) gAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTttacccgcgaagaggc > 2:802833‑M2/1‑134 (MQ=255) gAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTttacccgcgaagaggc > 2:369151‑M2/1‑134 (MQ=255) gAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTttacccgcgaagaggc > 2:3375289‑M2/1‑134 (MQ=255) ggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGcc > 2:3556033‑M1/52‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |