New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 5543209 | 90 (0.670) | intergenic (‑254/+62) | PP_4872/dnaB | hypothetical protein/replicative DNA helicase |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
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ttggtttggtGGGCTTGGTGAGGGCGCCAGGTGTACGACACAGCAGTTTCAGCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGgttgccc > 2:4689427/1‑150 (MQ=255) tggtttggtGGGCTTGGTGAGGGCGCCAGGTGTACGACACAGCAGTTTCAGCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGgttgcccg < 2:1125060/150‑1 (MQ=255) ttggtGGGCTTGGTGAGGGCGCCAGGTGTACGACACAGCAGTTTCAGCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGgttgcccgttgc < 2:1117144/150‑1 (MQ=255) tggGCTTGGTGAGGGCGCCAGGTGTACGACACAGCAGTTTCAGCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGc < 2:3064401/150‑1 (MQ=255) cTTGGTGAGGGCGCCAGGTGTACGACACAGCAGTTTCAGCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTg > 2:986380/1‑150 (MQ=255) 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cccgcGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAg < 1:3925564/150‑1 (MQ=255) ggcgCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCt < 2:3709055/150‑1 (MQ=255) ggcgCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCt < 2:866915/150‑1 (MQ=255) cgcATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGc < 1:4914096/150‑1 (MQ=255) gaATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACTTTTGTTGCAACGTGCAAAAACTGCAAGGCCTTGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCt > 1:3184249‑M1/3‑150 (MQ=255) aTCGCGACGCAAGGCCcacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctg > 2:3387180‑M1/1‑16 (MQ=255) aTCGCGACGCAAGGCCcacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctg > 1:3297819‑M1/1‑16 (MQ=255) ATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTaa < 2:3105545‑M1/150‑1 (MQ=255) tCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctga < 1:969219‑M2/150‑54 (MQ=255) gcgACGCAAGGCCcacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctgaaa < 2:1909287‑M1/150‑138 (MQ=255) CGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCa > 1:4215094‑M1/1‑150 (MQ=255) cGCAAGGCCcacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctgaaactgc < 2:503886‑M1/150‑142 (MQ=255) GCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTa > 1:387608‑M1/1‑150 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACCCGGGCCCCTgctaacgcccttaga < 2:50792‑M1/150‑8 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGt < 2:2896736‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGt < 1:2972727‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGt < 2:3275649‑M1/150‑1 (MQ=255) AGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGtt > 1:4918310‑M1/1‑150 (MQ=255) ggCCcacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctgaaactgctgtgt > 2:3191858‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCcacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctgaaactgctgtgtc < 1:966136‑M1/150‑148 (MQ=255) GCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTAt < 1:4484717‑M1/150‑1 (MQ=255) ccacattcgtttcaactcggccaaggcgggcaacgggcaaccatggccttgcagttttggcacgttgcaacaaatgtgggagcggccttgcgtcgcgatgcgccgcgcgggcggcgctcgatttcacaggcgctgaaactgctgtgtcgt > 1:1434264‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCGTGGGGATTGGTGAGGAGAGCGACAGTTGGGGGGGGCGTCAGGTGGTTGGTTTGGTGGGCTTGGTGAGGGCGCCAGGTGTACGACACAGCAGTTTCAGCGCCTGTGAAATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCATCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACATTTGTTGCAACGTGCCAAAACTGCAAGGCCATGGTTGCCCGTTGCCCGCCTTGGCCGAGTTGAAACGAATGTGGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCAAAGCAGCCCCTACAAGGGCCCCTGCTAACGCAATTAGTTATTC > NC_002947/5542978‑5543276 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |