| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 359677 = | 155 (1.020) | 17 (0.120) | 13/262 | NT | 11.6% | intergenic (+34/+86) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 359721 = | 112 (0.770) | intergenic (+78/+42) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTCCACCA > NC_002947/359573‑359869 | cgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTggggg < 1:4515283/150‑1 (MQ=255) gcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggc < 1:3864680/150‑1 (MQ=255) cacaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcg < 1:4970533/150‑1 (MQ=255) cacaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcg < 1:4970652/150‑1 (MQ=255) cacaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGgggcg > 2:3637377/1‑150 (MQ=255) cggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCtt > 1:5099050‑M1/98‑150 (MQ=255) ccGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGAACAAGCCCGCCCCCACAGATCA‑CCGCTG‑GCTCAAGCTCAGCGGGTGACCTGTGGGAGCGGGCGTgcc < 2:3838510/150‑3 (MQ=14) ttGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGTGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCcgc < 1:4556923/149‑1 (MQ=255) cggcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAg < 1:1647108/150‑1 (MQ=255) caagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGaa > 1:402266‑M1/88‑150 (MQ=255) aagcaactgttgcccgcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttaccccggaccggccccttcggggaacaagcccgccCCCACCGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGaa > 2:2285964‑M1/88‑150 (MQ=255) ggcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAgg < 1:3567564/150‑1 (MQ=255) cccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAgggg < 2:2634948/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc < 1:3805998/150‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCg < 2:3443097/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTACGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTGTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGG‑GGTGATCTGTGGGGGGGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCt < 1:1397505/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTg < 2:1612771/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 1:1037427/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 1:3490241/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 2:1310878/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg > 2:470667/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 1:1149818/150‑1 (MQ=255) attGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGTTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGTGGGCGTGCTTTTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATg < 2:439237/148‑1 (MQ=255) aaTGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATg > 2:2585053/1‑150 (MQ=255) tGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGa > 2:1720921/1‑150 (MQ=255) tGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGa < 1:3341229/150‑1 (MQ=255) gTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTa < 1:736227/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGTGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAc < 1:3461744/150‑1 (MQ=255) tCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAc > 2:992456/1‑150 (MQ=255) tCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAc > 2:4211021/1‑150 (MQ=255) gACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAcgc > 2:684803/1‑150 (MQ=255) tGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGttt < 1:1810846/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttg < 2:2345002/150‑1 (MQ=255) catgtgtAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgt > 2:3289529/4‑150 (MQ=255) tgtAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGaa > 1:1655139/1‑150 (MQ=255) tgtAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGaa > 2:3936911/1‑150 (MQ=255) tgtAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGaa < 1:2865032/150‑1 (MQ=255) tgtAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGGCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGACGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGaa > 2:3245602/1‑150 (MQ=255) aGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTgc > 1:4750407/1‑150 (MQ=255) aGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTgc < 2:3627495/150‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg < 1:4426977/150‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg < 2:5100469/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTgg > 1:2085992/1‑150 (MQ=255) cgcCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCaa < 1:37959/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATGTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGc < 1:1757472/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCATGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGc < 2:252064/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCt > 1:4581649/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCt > 2:497448/1‑150 (MQ=255) ctTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCtt < 2:3736992/150‑1 (MQ=255) tCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGt < 1:2669788/150‑1 (MQ=255) tCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGt > 2:1655352/1‑150 (MQ=255) ttcgcggaacaagcccgcccccacagatcaccgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCGTG‑CCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTg > 1:402266‑M2/64‑150 (MQ=255) ttcgcggaacaagcccgcccccacagatcaccgctggctcaagctcagcgggtgaccggtgggGGCGGGCTTGTTCCCCGAAGGGGCCGGTCCGGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCGGGCAACAGTTGCtt > 2:2285964‑M2/64‑150 (MQ=255) cgcgG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTc < 1:1012083/150‑1 (MQ=255) cgcgG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGGGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTc < 1:555609/150‑1 (MQ=255) cgG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGa < 2:2128946/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCt < 2:1463186/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt < 1:438967/144‑1 (MQ=255) CCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGc > 1:1262216‑M1/1‑144 (MQ=255) CACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGc > 2:4809427‑M1/1‑150 (MQ=255) CACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGc > 2:3152457‑M1/1‑150 (MQ=255) CACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGATGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGc > 1:235343‑M1/1‑150 (MQ=255) ACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGcc < 1:2633844‑M1/150‑1 (MQ=255) cacagatcaccgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGCTTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGc > 2:130766‑M2/43‑150 (MQ=255) CAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAGGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCg > 1:49798‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGc < 1:2729564‑M1/150‑1 (MQ=255) gTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa < 2:1213464/150‑1 (MQ=255) gTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa < 2:3012843/150‑1 (MQ=255) agatcaccgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCgg > 1:2341739‑M2/40‑150 (MQ=255) tCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAg > 2:1669067/1‑150 (MQ=255) atcaccgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCGTG‑CCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAg > 2:2440904‑M2/38‑150 (MQ=255) aCCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGa > 1:3403248/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGa > 2:4238246/1‑150 (MQ=255) cccGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGAt < 1:1932837/150‑1 (MQ=255) ccGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGACGGCAGGAtc > 1:3245398/1‑150 (MQ=255) accgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAcgc > 2:2675465‑M2/35‑82 (MQ=255) ccgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCGTG‑CCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGc > 1:1905418‑M2/34‑133 (MQ=255) ccgctggctcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCGTG‑CCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGc < 2:1905418‑M2/100‑1 (MQ=255) gCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGAtcgt > 1:300836/1‑150 (MQ=255) cgctggctcaagctcagcgggtgatctgtgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa > 2:643746‑M2/33‑145 (MQ=255) cgctggctcaagctcagcgggtgatctgtgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa < 1:643746‑M2/113‑1 (MQ=255) cgctggctcaagctcagcgggtgatctgtgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAggagc > 2:4259008‑M2/33‑148 (MQ=255) cTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGAtcgtc < 2:3832616/150‑1 (MQ=255) tGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGAtcgtcg < 2:1952468/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCAc > 1:4153563/1‑150 (MQ=255) tcaagctcagcgggtgacctgtgggAGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCAc > 2:1101326‑M2/26‑150 (MQ=255) caagctcAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTGTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTg > 1:1956167/7‑150 (MQ=255) cAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGgtg < 2:2555190/150‑1 (MQ=255) cgC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGgtgt < 1:999832/149‑1 (MQ=255) aGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGgtgt < 1:3289529/150‑1 (MQ=255) gTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACAt < 1:2585053/150‑1 (MQ=255) gTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACAt > 1:4321225/1‑150 (MQ=255) tCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGc < 1:3637377/150‑1 (MQ=255) tCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCAGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGc > 2:1027902/1‑150 (MQ=255) ctgtgggAGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCt > 2:4591883‑M2/8‑150 (MQ=255) gtgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTcc > 2:39640‑M2/6‑150 (MQ=255) gtgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTcc < 1:3437721‑M2/145‑1 (MQ=255) tgggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTcca > 1:1272226‑M2/5‑150 (MQ=255) ggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTccacc > 2:4002362‑M2/3‑150 (MQ=255) ggGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTccacc > 2:4002761‑M2/3‑150 (MQ=255) | CGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGC‑GGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGATCGTCGCACTGCCGGTGTACATCTGCTCCACCA > NC_002947/359573‑359869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |